RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373433.8

RPRD1B-201, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPRD1B, Length 3,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-201ENST00000373433 CHST6Q9GZX3 395 aa10.16□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 FAM60AQ9NP50 221 aa10.16□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 COMMD9Q9P000 198 aa10.16□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 FOXJ3Q9UPW0 622 aa10.16□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 FAM25EA8MYX2 175 aa10.16□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 FADS1O60427 444 aa10.16□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 FARS2O95363 451 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 RD3LP0DJH9 198 aa10.16□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF3P17036 446 aa10.16□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 GRK6P43250 576 aa10.16□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF425Q6IV72 752 aa10.16□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 SLC48A1Q6P1K1 146 aa10.16□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 TMEM71Q6P5X7 295 aa10.16□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 OVCH1Q7RTY7 1134 aa10.16□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 OR10H5Q8NGA6 315 aa10.16□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 IFI44Q8TCB0 444 aa10.16□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 GLYATL2Q8WU03 294 aa10.16□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 DNASE2BQ8WZ79 361 aa10.16□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 SEC22AQ96IW7 307 aa10.16□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 OR2A5Q96R48 311 aa10.16□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa10.15□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa10.15□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 A0A1W2PR77 199 aa10.15□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 OR2AT4A6NND4 320 aa10.15□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 G3V3Y1 287 aa10.15□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 SULT1C2O00338 296 aa10.15□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 SYT5O00445 386 aa10.15□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 CPMP14384 443 aa10.15□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 CSF2RBP32927 897 aa10.15□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 PDX1P52945 283 aa10.15□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 ARFIP1P53367 373 aa10.15□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 STPG1Q5TH74 334 aa10.15□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa10.15□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 TEX19Q8NA77 164 aa10.15□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 AGBL5Q8NDL9 886 aa10.15□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 PAQR8Q8TEZ7 354 aa10.15□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 CMKLR1Q99788 373 aa10.15□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa10.15□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 SRPK3Q9UPE1 567 aa10.15□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 V9GY05 133 aa10.15□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 CADP27708 2225 aa10.15□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa10.15□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 RFPL4AA6NLU0 287 aa10.15□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa10.15□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 LIPCP11150 499 aa10.15□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 PTGFRP43088 359 aa10.15□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 FXYD6P3P58550 94 aa10.15□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 FAM69BQ5VUD6 431 aa10.15□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF793Q6ZN11 406 aa10.15□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 VN1R4Q7Z5H5 301 aa10.15□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 TMPRSS12Q86WS5 348 aa10.15□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 MCEMP1Q8IX19 187 aa10.15□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 RXFP4Q8TDU9 374 aa10.15□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 METTL7AQ9H8H3 244 aa10.15□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 CMC2Q9NRP2 79 aa10.15□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 OR5V1Q9UGF6 321 aa10.15□□□□□ -0.78
RPRD1B-201ENST00000373433 RAB19A4D1S5 217 aa10.15□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 TTLL8A6PVC2 850 aa10.15□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 FAM171A2A8MVW0 826 aa10.15□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 IDSB3KWA1 339 aa10.15□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 BHLHE40O14503 412 aa10.15□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 CCSO14618 274 aa10.15□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 P2RX6O15547 441 aa10.15□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 SCRG1O75711 98 aa10.15□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 PLGP00747 810 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 IFNA4P05014 189 aa10.15□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 AVPR2P30518 371 aa10.15□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 PPIAP62937 165 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 ACTC1P68032 377 aa10.15□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 ACTA1P68133 377 aa10.15□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 GUCA2AQ02747 115 aa10.15□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 SMCO1Q147U7 214 aa10.15□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 FAM111BQ6SJ93 734 aa10.15□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 MOB3CQ70IA8 216 aa10.15□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 SLC29A4Q7RTT9 530 aa10.15□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 WDR5BQ86VZ2 330 aa10.15□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 GLB1L2Q8IW92 636 aa10.15□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa10.15□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 SDR9C7Q8NEX9 313 aa10.15□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa10.15□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 NR4A3Q92570 626 aa10.15□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 FBXO17Q96EF6 278 aa10.15□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 TCF7L1Q9HCS4 588 aa10.15□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 LHX9Q9NQ69 397 aa10.15□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 PRDM7Q9NQW5 492 aa10.15□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 K7ESF4 209 aa10.14□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF749O43361 778 aa10.14□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 RCBTB2O95199 551 aa10.14□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 FOSL1P15407 271 aa10.14□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 NFYBP25208 207 aa10.14□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 DPP4P27487 766 aa10.14□□□□□ -0.79
RPRD1B-201ENST00000373433 HTR2AP28223 471 aa10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms