RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 CEACAM4O75871 244 aa13.62□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 NCR1O76036 304 aa13.62□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 TACSTD2P09758 323 aa13.62□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF708P17019 499 aa13.62□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 EGR3Q06889 387 aa13.62□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 SLC18B1Q6NT16 456 aa13.62□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa13.62□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 CEACAM19Q7Z692 300 aa13.62□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 SLC22A16Q86VW1 577 aa13.62□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 SMIM19Q96E16 107 aa13.62□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 MAP6Q96JE9 813 aa13.62□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 MNTQ99583 582 aa13.62□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 SLC24A3Q9HC58 644 aa13.62□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 QPCTLQ9NXS2 382 aa13.62□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 GLTPQ9NZD2 209 aa13.62□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 KLHL9Q9P2J3 617 aa13.62□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa13.62□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 APC2O95996 2303 aa13.62□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa13.62□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 H3BSH0 61 aa13.61□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 LINC01387J3KSC0 135 aa13.61□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 ZNHIT1O43257 154 aa13.61□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 SULT1C4O75897 302 aa13.61□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 ACSM3Q53FZ2 586 aa13.61□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 ASB18Q6ZVZ8 466 aa13.61□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 DCXRQ7Z4W1 244 aa13.61□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM123Q8N131 208 aa13.61□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 OR6N1Q8NGY5 312 aa13.61□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 NEIL3Q8TAT5 605 aa13.61□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 ABHD3Q8WU67 409 aa13.61□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM54Q969K7 222 aa13.61□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 OR8B4Q96RC9 309 aa13.61□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 SPTBN4Q9H254 2564 aa13.61□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 CTDSP2O14595 271 aa13.61□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 ZFPL1O95159 310 aa13.61□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 CAPZA2P47755 286 aa13.61□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 CSNK1A1P48729 337 aa13.61□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa13.61□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 PCK2Q16822 640 aa13.61□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 ODF4Q2M2E3 257 aa13.61□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 CCDC58Q4VC31 144 aa13.61□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 FCRLAQ7L513 359 aa13.61□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 FAM220AQ7Z4H9 259 aa13.61□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 RDH10Q8IZV5 341 aa13.61□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 PRSS35Q8N3Z0 413 aa13.61□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 FAM109AQ8N4B1 249 aa13.61□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 ST7LQ8TDW4 575 aa13.61□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 SLC25A46Q96AG3 418 aa13.61□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 ORAI1Q96D31 301 aa13.61□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 MMP27Q9H306 513 aa13.61□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 LDAHQ9H6V9 325 aa13.61□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 ACKR4Q9NPB9 350 aa13.61□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa13.61□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 J3QRK9 145 aa13.6□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 PHYHO14832 338 aa13.6□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 CASKO14936 926 aa13.6□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 SC5DO75845 299 aa13.6□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 PNPP00491 289 aa13.6□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 IL1AP01583 271 aa13.6□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 CD53P19397 219 aa13.6□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 CALRP27797 417 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 SOX6P35712 828 aa13.6□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 RORCP51449 518 aa13.6□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 TEX30Q5JUR7 227 aa13.6□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 PDSS1Q5T2R2 415 aa13.6□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 HDDC2Q7Z4H3 204 aa13.6□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 BTLAQ7Z6A9 289 aa13.6□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 KRT77Q7Z794 578 aa13.6□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF679Q8IYX0 411 aa13.6□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 RPS4Y2Q8TD47 263 aa13.6□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 ASB17Q8WXJ9 295 aa13.6□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 DTNBP1Q96EV8 351 aa13.6□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 TTYH2Q9BSA4 534 aa13.6□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 MROQ9BYG7 248 aa13.6□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 TIGARQ9NQ88 270 aa13.6□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 SPRR3Q9UBC9 169 aa13.6□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa13.6□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 ACACAQ13085 2346 aa13.6□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 CYTIPO60759 359 aa13.59□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 AQP8O94778 261 aa13.59□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 HRGP04196 525 aa13.59□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 BMP4P12644 408 aa13.59□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 SGCAQ16586 387 aa13.59□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa13.59□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 OR7E24Q6IFN5 339 aa13.59□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 MS4A15Q8N5U1 240 aa13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.9 ms