RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 TAS2R9Q9NYW1 312 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 CLCF1Q9UBD9 225 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 IKZF3Q9UKT9 509 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 ARL5AQ9Y689 179 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 ENPP4Q9Y6X5 453 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 PPIAL4EA0A075B759 164 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 A0A1B0GUS0 222 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 A0A1W2PRB8 838 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 ERVV-2B6SEH9 535 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 LMO7DNF2Z398 122 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 P2RY10O00398 339 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 ITGB1BP1O14713 200 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 PPIAL4FP0DN26 164 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 PPIAL4GP0DN37 164 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 PRF1P14222 555 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 CXCR1P25024 350 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 CXCR2P25025 360 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 F2RP25116 425 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 CD1CP29017 333 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 CHRNB4P30926 498 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 MATKP42679 507 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 RPS14P62263 151 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 RCAN2Q14206 197 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF74Q16587 644 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 AVPI1Q5T686 147 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 FAM72AQ5TYM5 149 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 STOX1Q6ZVD7 989 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM179Q6ZVK1 233 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 MON1BQ7L1V2 547 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 KBTBD8Q8NFY9 601 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 OR5T2Q8NGG2 359 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 OR5M8Q8NGP6 311 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 OR13J1Q8NGT2 312 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 MCOLN3Q8TDD5 553 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 MYLPFQ96A32 169 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 FAM122AQ96E09 287 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 SERPINB12Q96P63 405 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 ERGIC2Q96RQ1 377 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 AGPAT1Q99943 283 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 RAB1BQ9H0U4 201 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 METTL9Q9H1A3 318 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 DCLRE1BQ9H816 532 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 NIPAL2Q9H841 368 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 WDR41Q9HAD4 459 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 PLEKHA3Q9HB20 300 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 C11orf21Q9P2W6 132 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 ERGIC3Q9Y282 383 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 PPIAL4AQ9Y536 164 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 EML5Q05BV3 1969 aa2.2□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 A0A087X0T9 212 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 A0A1W2PRD5 423 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 PATE3B3GLJ2 98 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 H3BNH8 94 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 OR7A17O14581 309 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 SLC22A2O15244 555 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 TSPAN15O95858 294 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 SP9P0CG40 484 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 ARSBP15848 533 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 SPNP16150 400 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 CBR1P16152 277 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 GOT1P17174 413 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 CTRB1P17538 263 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 COMTP21964 271 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 PAICSP22234 425 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 GABRR1P24046 479 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 FASP25445 335 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 MAP2K4P45985 399 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 GNPDA1P46926 289 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 GABRA4P48169 554 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 SGSHP51688 502 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 CAV3P56539 151 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 IL5RAQ01344 420 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 BAXQ07812 192 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 KLRB1Q12918 225 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 GTF2H2Q13888 395 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 GANABQ14697 944 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 RHEBQ15382 184 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 NEDD8Q15843 81 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF124Q15973 351 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 ALG10Q5BKT4 473 aa2.19□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 ALG10BQ5I7T1 473 aa2.19□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.4 ms