RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340994.4

PKHD1-201, Transcript of PKHD1, fibrocystin/polyductin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PKHD1, Length 11,589 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF860A6NHJ4 632 aa7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 RPL7P18124 248 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 ACHEP22303 614 aa7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 PIGAP37287 484 aa7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 IKZF1Q13422 519 aa7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 PLXDC2Q6UX71 529 aa7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 ACVR1CQ8NER5 493 aa7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 LHX4Q969G2 390 aa7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 KLHDC7BQ96G42 594 aa7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 PRSS16Q9NQE7 514 aa7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 SIRT7Q9NRC8 400 aa7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 M0R1X1 148 aa7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 TUSC2O75896 110 aa7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 OR7E24Q6IFN5 339 aa7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 BLNKQ8WV28 456 aa7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 DUSP21Q9H596 190 aa7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 INSL5Q9Y5Q6 135 aa7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 A0A0U1RQF3 1178 aa7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 ACOT8O14734 319 aa7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 RD3LP0DJH9 198 aa7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 FCGR2CP31995 323 aa7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 SLC6A11P48066 632 aa7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 FAM26EQ8N5C1 309 aa7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 NPWQ8N729 165 aa7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 IFI44Q8TCB0 444 aa7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 RAB24Q969Q5 203 aa7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 LPAR4Q99677 370 aa7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 SRPK3Q9UPE1 567 aa7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 FLVCR2Q9UPI3 526 aa7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 GABRA4P48169 554 aa7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 MAP2K6P52564 334 aa7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 SCAND1P57086 179 aa7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 DHODHQ02127 395 aa7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 IHHQ14623 411 aa7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 TMEM201Q5SNT2 666 aa7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 Q6ZVL8 140 aa7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 MFSD4AQ8N468 514 aa7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 SEC11CQ9BY50 192 aa7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 ADM5C9JUS6 153 aa7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 SLC31A2O15432 143 aa7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 EIF1P41567 113 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 PMP2P02689 132 aa7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 ARSDP51689 593 aa7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 RACK1P63244 317 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 FCRL6Q6DN72 434 aa7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 KLRG1Q96E93 195 aa7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 HSBP1O75506 76 aa7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 NQO2P16083 231 aa7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 SCMH1Q96GD3 660 aa7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 ATRXP46100 2492 aa7.59□□□□□ -1.19
PKHD1-201ENST00000340994 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa7.59□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 A0A1W2PPH5 198 aa7.59□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 A0A1W2PRU2 124 aa7.59□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 RABIFP47224 123 aa7.59□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 TCTAP57738 103 aa7.59□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 PMS2P11Q13670 270 aa7.59□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 ACOT4Q8N9L9 421 aa7.59□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 YIPF6Q96EC8 236 aa7.59□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 SLC35E1Q96K37 410 aa7.59□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 BOLA1Q9Y3E2 137 aa7.59□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 NOTCH3Q9UM47 2321 aa7.59□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 A6NIN4 97 aa7.59□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 GLCEO94923 617 aa7.59□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 WNT7BP56706 349 aa7.59□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 SLC36A2Q495M3 483 aa7.59□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 WDFY2Q96P53 400 aa7.59□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 OR2A14Q96R47 310 aa7.59□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 CST4P01036 141 aa7.58□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 VIPR2P41587 438 aa7.58□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 FOXK2Q01167 660 aa7.58□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 EGR3Q06889 387 aa7.58□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 FAM57BQ71RH2 274 aa7.58□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 SYS1Q8N2H4 156 aa7.58□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 DOCK8Q8NF50 2099 aa7.58□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 NTNG2Q96CW9 530 aa7.58□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 ANAPC16Q96DE5 110 aa7.58□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 MACROD1Q9BQ69 325 aa7.58□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 TPPP3Q9BW30 176 aa7.58□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 TMEM218A2RU14 115 aa7.58□□□□□ -1.2
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms