RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320857.7

SSR4-201, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SSR4, Length 1,671 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-201ENST00000320857 ZNF43P17038 809 aa15.18■□□□□ 0.02
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SSR4-201ENST00000320857 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
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SSR4-201ENST00000320857 CATSPERDQ86XM0 798 aa15.15■□□□□ 0.02
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