RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 ALX3O95076 343 aa9□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 PGA4P0DJD7 388 aa9□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 PGA3P0DJD8 388 aa9□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 EDNRAP25101 427 aa9□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 LAP3P28838 519 aa9□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 MAGEA5P43359 124 aa9□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 TNFSF10P50591 281 aa9□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 CLDN17P56750 224 aa9□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 CLDN20P56880 219 aa9□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC3A1Q07837 685 aa9□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC17A1Q14916 467 aa9□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 ETFDHQ16134 617 aa9□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF684Q5T5D7 378 aa9□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 C22orf42Q6IC83 251 aa9□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 CHMP1BQ7LBR1 199 aa9□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 SSX6Q7RTT6 188 aa9□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM251Q8N6I4 163 aa9□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 OR9K2Q8NGE7 335 aa9□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 OR6N1Q8NGY5 312 aa9□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 OR10D3Q8NH80 312 aa9□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 TBC1D15Q8TC07 691 aa9□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 S100ZQ8WXG8 99 aa9□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 GHSRQ92847 366 aa9□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 PELI1Q96FA3 418 aa9□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 SCMH1Q96GD3 660 aa9□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 DACH2Q96NX9 599 aa9□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 MED18Q9BUE0 208 aa9□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 HES7Q9BYE0 225 aa9□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 RNF167Q9H6Y7 350 aa9□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa9□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM166BA8MTA8 275 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF814B7Z6K7 855 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 E9PI62 339 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 GABRPO00591 440 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 KLK10O43240 276 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 CXCL13O43927 109 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 AQP8O94778 261 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 GLSO94925 669 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 CDRT1O95170 752 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 ACTL6AO96019 429 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 QDPRP09417 244 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 SPARCP09486 303 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 PTGS2P35354 604 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 TGFBR1P36897 503 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 RPS19P39019 145 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 CSNK1A1P48729 337 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 CLDN15P56746 228 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 FABP5Q01469 135 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 CDK5R1Q15078 307 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 CARD17Q5XLA6 110 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 IGFL2Q6UWQ7 119 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 GGNQ86UU5 652 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF679Q8IYX0 411 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM109AQ8N4B1 249 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 NOXO1Q8NFA2 376 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 FDCSPQ8NFU4 85 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC26A10Q8NG04 563 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 NEIL3Q8TAT5 605 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 PHYHIPQ92561 330 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 NSMAFQ92636 917 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 SMIM19Q96E16 107 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 TPK1Q9H3S4 243 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 LDAHQ9H6V9 325 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 EXO5Q9H790 373 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 SEC61A2Q9H9S3 476 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 PLGRKTQ9HBL7 147 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 HMG20AQ9NP66 347 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 GLTPQ9NZD2 209 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 KLHL13Q9P2N7 655 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 KCNG2Q9UJ96 466 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF281Q9Y2X9 895 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 PEX16Q9Y5Y5 336 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 CUL9Q8IWT3 2517 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 SPEGQ15772 3267 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A075B6Q4 140 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 GPR171O14626 319 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 CASKO14936 926 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 RAMP1O60894 148 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF254O75437 659 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 GATBO75879 557 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF432O94892 652 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 RPP14O95059 124 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 SYNGR4O95473 234 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 WNT11O96014 354 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 WT1P19544 449 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 SDC2P34741 201 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 RFC3P40938 356 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGGTB-201ENST00000319942 GDI2P50395 445 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms