RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 LIPNQ5VXI9 398 aa22.15■■□□□ 1.14
GNPTAB-201ENST00000299314 CATSPERDQ86XM0 798 aa22.15■■□□□ 1.14
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
GNPTAB-201ENST00000299314 AGBL5Q8NDL9 886 aa22.15■■□□□ 1.14
GNPTAB-201ENST00000299314 CT45A3Q8NHU0 189 aa22.15■■□□□ 1.14
GNPTAB-201ENST00000299314 H0Y8G0 127 aa22.14■■□□□ 1.14
GNPTAB-201ENST00000299314 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
GNPTAB-201ENST00000299314 DCAF12Q5T6F0 453 aa22.14■■□□□ 1.14
GNPTAB-201ENST00000299314 NUDT19A8MXV4 375 aa22.14■■□□□ 1.14
GNPTAB-201ENST00000299314 F6UZH7 168 aa22.14■■□□□ 1.14
GNPTAB-201ENST00000299314 DOK3Q7L591 496 aa22.14■■□□□ 1.14
GNPTAB-201ENST00000299314 C2CD4CQ8TF44 421 aa22.14■■□□□ 1.14
GNPTAB-201ENST00000299314 MS4A6EQ96DS6 147 aa22.14■■□□□ 1.14
GNPTAB-201ENST00000299314 STMND1H3BQB6 276 aa22.14■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC2A1P11166 492 aa22.14■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 DUSP1P28562 367 aa22.14■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 EPHA5P54756 1037 aa22.14■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 ELLP55199 621 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 OR8G2PQ6IF36 304 aa22.14■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 OR13C8Q8NGS7 320 aa22.14■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 NME2P1O60361 137 aa22.14■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 C2orf76Q3KRA6 126 aa22.14■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF620Q6ZNG0 422 aa22.14■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa22.14■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 THBS1P07996 1170 aa22.13■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 IL34Q6ZMJ4 242 aa22.13■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 GRINAQ7Z429 371 aa22.13■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa22.13■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 DCBLD2Q96PD2 775 aa22.13■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 MYH4Q9Y623 1939 aa22.13■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 PRAMEF25A6NGN4 478 aa22.13■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 LGALS8O00214 317 aa22.13■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 SULT1C4O75897 302 aa22.13■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 AKR7A3O95154 331 aa22.13■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 RAF1P04049 648 aa22.13■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 ANKRD34AQ69YU3 496 aa22.13■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 FCRL6Q6DN72 434 aa22.13■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC35G3Q8N808 338 aa22.13■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 PDXPQ96GD0 296 aa22.13■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 LTB4R2Q9NPC1 389 aa22.13■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa22.13■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 ADAM5Q6NVV9 412 aa22.13■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa22.13■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 B3GAT1Q9P2W7 334 aa22.13■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC25A32Q9H2D1 315 aa22.13■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 DUSP22Q9NRW4 184 aa22.13■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 GABRG1Q8N1C3 465 aa22.13■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 ST8SIA4Q92187 359 aa22.13■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 TAAR5O14804 337 aa22.12■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 CSF3P09919 207 aa22.12■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 RIMKLAQ8IXN7 391 aa22.12■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 YIPF6Q96EC8 236 aa22.12■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 TPPP3Q9BW30 176 aa22.12■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 CMC2Q9NRP2 79 aa22.12■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 SOCS7O14512 581 aa22.12■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 OR2C1O95371 312 aa22.12■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF385BQ569K4 471 aa22.12■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 TIGD3Q6B0B8 471 aa22.12■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 TLCD2A6NGC4 264 aa22.12■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 H2AFB1P0C5Y9 115 aa22.12■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 GABRB1P18505 474 aa22.12■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM26DQ5JW98 314 aa22.12■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 OR1M1Q8NGA1 313 aa22.12■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 LURAP1Q96LR2 239 aa22.12■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 NIT2Q9NQR4 276 aa22.12■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 NUMBLQ9Y6R0 609 aa22.12■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 NID1P14543 1247 aa22.12■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 LBX1P52954 281 aa22.12■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 METRNLQ641Q3 311 aa22.12■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 CDH26Q8IXH8 852 aa22.12■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 CSF3RQ99062 836 aa22.12■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.12■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 SPINT2O43291 252 aa22.11■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa22.11■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 ALOX5APP20292 161 aa22.11■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 CDC20Q12834 499 aa22.11■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC6A17Q9H1V8 727 aa22.11■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 FN3KRPQ9HA64 309 aa22.11■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 BCO1Q9HAY6 547 aa22.11■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 RGPD2P0DJD1 1756 aa22.11■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.11■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 A0A1B0GTW7 788 aa22.11■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 RAB27BO00194 218 aa22.11■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 P2RX3P56373 397 aa22.11■■□□□ 1.13
GNPTAB-201ENST00000299314 DOC2BQ14184 412 aa22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.1 ms