RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 CLRN1P58418 232 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 PPIAP62937 165 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 PLGLB1Q02325 96 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 PHYHD1Q5SRE7 291 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 LIPNQ5VXI9 398 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 THEM6Q8WUY1 208 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 ROBO4Q8WZ75 1007 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 MCHR2Q969V1 340 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 SMIM19Q96E16 107 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 RBP7Q96R05 134 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 LINC01387J3KSC0 135 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 SPARCP09486 303 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 CLEC2LP0C7M8 214 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 CD53P19397 219 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 SDC2P34741 201 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 OPRL1P41146 370 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 BMXP51813 675 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 EGR3Q06889 387 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 DNM1P34Q6PK57 102 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM123Q8N131 208 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 OR13C5Q8NGS8 318 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 CAPSLQ8WWF8 208 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 OR2M2Q96R28 347 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 ARPC5LQ9BPX5 153 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 LIPGQ9Y5X9 500 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 ACACAQ13085 2346 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 CENPBD1B2RD01 187 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 SULT1C4O75897 302 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF708P17019 499 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 GALP22466 123 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 TRIM16LQ309B1 348 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF404Q494X3 552 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 CCDC58Q4VC31 144 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 GLB1L2Q8IW92 636 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 KCTD7Q96MP8 289 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 COQ7Q99807 217 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 TPK1Q9H3S4 243 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 KLHL9Q9P2J3 617 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A1B0GTH9 108 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 NPIPA2E9PIF3 369 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 NPIPA3F8WFD2 350 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 CDRT1O95170 752 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 HRGP04196 525 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 SELENOPP49908 381 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 MXD1Q05195 221 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 MOGQ16653 247 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM27D1Q5T7N8 215 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 PLXDC2Q6UX71 529 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 MCFD2Q8NI22 146 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 ABHD4Q8TB40 342 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 ST7LQ8TDW4 575 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 C11orf40Q8WZ69 217 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 HTRA1Q92743 480 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 MAP6Q96JE9 813 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 ABHD6Q9BV23 337 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 PALMDQ9NP74 551 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 ACKR4Q9NPB9 350 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 SNTG1Q9NSN8 517 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 POU2F3Q9UKI9 436 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 BSNQ9UPA5 3926 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF726A6NNF4 738 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 RPP14O95059 124 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 QDPRP09417 244 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 CDAP32320 146 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 GDI2P50395 445 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 PMP22Q01453 160 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 ROM1Q03395 351 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 TEX30Q5JUR7 227 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 LRRN1Q6UXK5 716 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 HDDC2Q7Z4H3 204 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM109AQ8N4B1 249 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM178AQ8NBL3 297 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 OR8B4Q96RC9 309 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 QPCTLQ9NXS2 382 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 FRRS1LQ9P0K9 344 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 DAPK2Q9UIK4 370 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 SSUH2Q9Y2M2 353 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa8.29□□□□□ -1.08
RABGEF1-201ENST00000284957 ZFPL1O95159 310 aa8.28□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.1 ms