RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 MCRIP1C9JLW8 97 aa14.75□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 SCGB2A1O75556 95 aa14.75□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 MTCP1P56278 107 aa14.75□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa14.75□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 LIPIQ6XZB0 460 aa14.75□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 MEGF10Q96KG7 1140 aa14.75□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 KCNIP2Q9NS61 270 aa14.75□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 SLC35D1Q9NTN3 355 aa14.75□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 A6NCN8 305 aa14.75□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 NDUFB6O95139 128 aa14.75□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 SOD2P04179 222 aa14.75□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 BMPR1AP36894 532 aa14.75□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 CCL14Q16627 93 aa14.75□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 PPP1R3BQ86XI6 285 aa14.75□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 CBLN2Q8IUK8 224 aa14.75□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 GCNT2Q8N0V5 402 aa14.75□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 SYS1Q8N2H4 156 aa14.75□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 TM4SF18Q96CE8 201 aa14.75□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 AMDHD1Q96NU7 426 aa14.75□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa14.75□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 HMSDA8MTL9 139 aa14.74□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 OLIG3Q7RTU3 272 aa14.74□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 ANGPTL5Q86XS5 388 aa14.74□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 PRR22Q8IZ63 422 aa14.74□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 LMX1AQ8TE12 382 aa14.74□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 CMC2Q9NRP2 79 aa14.74□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 SLC23A2Q9UGH3 650 aa14.74□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 TMEM218A2RU14 115 aa14.74□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 EDIL3O43854 480 aa14.74□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 NXPH3O95157 252 aa14.74□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 CLEC12BQ2HXU8 276 aa14.74□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 TMEM151BQ8IW70 566 aa14.74□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 POM121Q96HA1 1249 aa14.74□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 HIPK2Q9H2X6 1198 aa14.74□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 B3GALT4O96024 378 aa14.74□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 WNT1P04628 370 aa14.74□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 VIPR2P41587 438 aa14.74□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa14.74□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 A0A1W2PP55 124 aa14.74□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 F6UZH7 168 aa14.74□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 M0QZQ0 153 aa14.74□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 CD14P08571 375 aa14.74□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 MLF1P58340 268 aa14.74□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 ZNF66Q6ZN08 573 aa14.74□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 SLC24A4Q8NFF2 622 aa14.74□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 REEP6Q96HR9 211 aa14.74□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 RAB27BO00194 218 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 GPNMBQ14956 572 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 CDK5R1Q15078 307 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 ZNF787Q6DD87 383 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 MOB3CQ70IA8 216 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 MOB1BQ7L9L4 216 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 ZNF429Q86V71 674 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 OR14A16Q8NHC5 309 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 RASD2Q96D21 266 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 OR5B2Q96R09 309 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 ABHD6Q9BV23 337 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 UCK1Q9HA47 277 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 UBQLN4Q9NRR5 601 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 PIK3C2AO00443 1686 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 C17orf105B2RV13 164 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 PSMB5P28074 263 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 CSNK1A1P48729 337 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 CATR1Q13166 79 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 NSDHLQ15738 373 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 PTOV1Q86YD1 416 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 OR2L13Q8N349 312 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 OR5L1Q8NGL2 311 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 OR4F5Q8NH21 305 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 PFN4Q8NHR9 129 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 OR4F4Q96R69 305 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 FKRPQ9H9S5 495 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 CUTCQ9NTM9 273 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 TMEM127O75204 238 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 HOXB2P14652 356 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 RNF150Q9ULK6 438 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 ZNF320A2RRD8 509 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 GPR75O95800 540 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 DOC2BQ14184 412 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 RAB35Q15286 201 aa14.73□□□□□ -0.05
CTIF-201ENST00000256413 SSX1Q16384 188 aa14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.9 ms