RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 IL17RDQ8NFM7 739 aa19.29■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 TSSK6Q9BXA6 273 aa19.29■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 GRIP2Q9C0E4 1043 aa19.29■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 POU2F3Q9UKI9 436 aa19.29■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 B9D1Q9UPM9 204 aa19.29■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa19.28■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 A0A1W2PPL8 197 aa19.28■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 MPZL1O95297 269 aa19.28■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 RAB36O95755 333 aa19.28■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 CST2P09228 141 aa19.28■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 ZNF32P17041 273 aa19.28■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 ACTR3P61158 418 aa19.28■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 ATP6AP1Q15904 470 aa19.28■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 MST1LQ2TV78 715 aa19.28■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 SLC36A2Q495M3 483 aa19.28■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 OTPQ5XKR4 325 aa19.28■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 C11orf71Q6IPW1 123 aa19.28■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 NRBF2Q96F24 287 aa19.28■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 ZNF416Q9BWM5 594 aa19.28■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 E2F6O75461 281 aa19.27■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 CIB2O75838 187 aa19.27■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 GPANK1O95872 356 aa19.27■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 PSG4Q00888 419 aa19.27■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 ZNF544Q6NX49 715 aa19.27■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 ZBTB46Q86UZ6 589 aa19.27■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 SDR9C7Q8NEX9 313 aa19.27■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 NUP37Q8NFH4 326 aa19.27■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 OR4F15Q8NGB8 312 aa19.27■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 OR52L1Q8NGH7 329 aa19.27■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 OR52E2Q8NGJ4 325 aa19.27■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 RNF121Q9H920 327 aa19.27■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 EMC7Q9NPA0 242 aa19.27■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 CA10Q9NS85 328 aa19.27■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 HIVEP1P15822 2718 aa19.27■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa19.27■□□□□ 0.68
SYF2-201ENST00000236273 TMCC2O75069 709 aa19.26■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 MSR1P21757 451 aa19.26■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 NOS3P29474 1203 aa19.26■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP19.26■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 FABP6P51161 128 aa19.26■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP19.26■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 KCNMB1Q16558 191 aa19.26■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 MSMPQ1L6U9 139 aa19.26■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 SLC36A3Q495N2 470 aa19.26■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa19.26■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 TMEM53Q6P2H8 277 aa19.26■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 SPNS3Q6ZMD2 512 aa19.26■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 AMIGO2Q86SJ2 522 aa19.26■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 JAZF1Q86VZ6 243 aa19.26■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa19.26■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 MUC15Q8N387 334 aa19.26■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 TMEM171Q8WVE6 324 aa19.26■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 ZNRF4Q8WWF5 429 aa19.26■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 LRTOMTQ8WZ04 291 aa19.26■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 GSX2Q9BZM3 304 aa19.26■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 WNT5BQ9H1J7 359 aa19.26■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 FN3KQ9H479 309 aa19.26■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 TBC1D23Q9NUY8 699 aa19.26■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 FBXL3Q9UKT7 428 aa19.26■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 GAAP10253 952 aa19.25■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 CCL2P13500 99 aa19.25■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 ANXA8P13928 327 aa19.25■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 NR4A1P22736 598 aa19.25■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 CRABP1P29762 137 aa19.25■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 DAPP51397 102 aa19.25■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 SWI5Q1ZZU3 235 aa19.25■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 FAHD1Q6P587 224 aa19.25■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 GLB1L2Q8IW92 636 aa19.25■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 OR5K1Q8NHB7 308 aa19.25■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 KCNS3Q9BQ31 491 aa19.25■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 OR2H1Q9GZK4 316 aa19.25■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 RERGLQ9H628 205 aa19.25■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 CBLN4Q9NTU7 201 aa19.25■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 H3BNX3 289 aa19.25■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 SMPD2O60906 423 aa19.25■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 FASP25445 335 aa19.25■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 THBS4P35443 961 aa19.25■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 PTH2RP49190 550 aa19.25■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 ADIPOQQ15848 244 aa19.25■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 AGAP6Q5VW22 663 aa19.25■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 ACSM5Q6NUN0 579 aa19.25■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 SYT9Q86SS6 491 aa19.25■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 CYB561A3Q8NBI2 242 aa19.25■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 SLC37A3Q8NCC5 494 aa19.25■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 SLC30A7Q8NEW0 376 aa19.25■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 OR2T33Q8NG76 320 aa19.25■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 AKR7LQ8NHP1 331 aa19.25■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 PYDC1Q8WXC3 89 aa19.25■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 C11orf40Q8WZ69 217 aa19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms