RNA–Protein interactions for RNA: Q0115

BI3, Transcript of Mitochondrial mRNA maturase, yeast

Gene BI3, Length 1,554 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BI3	Q0115	YHR078W	P38799	552 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BI3	Q0115	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
BI3	Q0115	SSY5	P47002	699 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BI3	Q0115	OMS1	Q06668	471 aa		4.83	□□□□□ -1.64
BI3	Q0115	ALG7	P07286	448 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BI3	Q0115	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
BI3	Q0115	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
BI3	Q0115	YEL1	P34225	687 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BI3	Q0115	ZIP2	P53061	704 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BI3	Q0115	ERG5	P54781	538 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BI3	Q0115	MUK1	Q02866	612 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BI3	Q0115	PEX19	Q07418	342 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BI3	Q0115	GUD1	Q07729	489 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BI3	Q0115	ACF2	Q12168	779 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BI3	Q0115	GIN4	Q12263	1142 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BI3	Q0115	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
BI3	Q0115	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
BI3	Q0115	SAK1	P38990	1142 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BI3	Q0115	YJR096W	P47137	282 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BI3	Q0115	YGR237C	P50089	785 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BI3	Q0115	NPY1	P53164	384 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BI3	Q0115	UME1	Q03010	460 aa		4.82	□□□□□ -1.64
BI3	Q0115	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
BI3	Q0115	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
BI3	Q0115	YFL052W	P43551	465 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BI3	Q0115	STU2	P46675	888 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BI3	Q0115	GPR1	Q12361	961 aa		4.81	□□□□□ -1.64
BI3	Q0115	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
BI3	Q0115	HSL7	P38274	827 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BI3	Q0115	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
BI3	Q0115	PMT3	P47190	753 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BI3	Q0115	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
BI3	Q0115	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
BI3	Q0115	IOC4	Q04213	475 aa		4.8	□□□□□ -1.64
BI3	Q0115	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
BI3	Q0115	VHR1	P40522	640 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BI3	Q0115	PFA3	P42836	336 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BI3	Q0115	YGL081W	P53156	320 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BI3	Q0115	TIM44	Q01852	431 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BI3	Q0115	COG8	Q04632	607 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BI3	Q0115	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
BI3	Q0115	IRC10	Q08118	586 aa		4.79	□□□□□ -1.64
BI3	Q0115	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
BI3	Q0115	BNA2	P47125	453 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BI3	Q0115	CTF13	P35203	478 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BI3	Q0115	PZF1	P39933	429 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BI3	Q0115	MRPS35	P53292	345 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BI3	Q0115	ASI2	P53895	289 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BI3	Q0115	ARP4	P80428	489 aa		4.78	□□□□□ -1.64
BI3	Q0115	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
BI3	Q0115	MTH1	P35198	433 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BI3	Q0115	MNN4	P36044	1178 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BI3	Q0115	CKB2	P38930	258 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BI3	Q0115	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
BI3	Q0115	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
BI3	Q0115	SWM1	Q12379	170 aa		4.77	□□□□□ -1.65
BI3	Q0115	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
BI3	Q0115	YKR018C	P36114	725 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BI3	Q0115	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
BI3	Q0115	YJR120W	P47157	116 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BI3	Q0115	GND2	P53319	492 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BI3	Q0115	FRE5	Q08908	694 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BI3	Q0115	TRM11	Q12463	433 aa		4.76	□□□□□ -1.65
BI3	Q0115	ATF1	P40353	525 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BI3	Q0115	TMA17	Q12513	150 aa		4.75	□□□□□ -1.65
BI3	Q0115	MET3	P08536	511 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BI3	Q0115	PPS1	P38148	807 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BI3	Q0115	PCL10	P53124	433 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BI3	Q0115	DLT1	Q04216	342 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BI3	Q0115	DCS2	Q12123	353 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BI3	Q0115	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
BI3	Q0115	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
BI3	Q0115	ELO3	P40319	345 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BI3	Q0115	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
BI3	Q0115	PKH1	Q03407	766 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BI3	Q0115	HFD1	Q04458	532 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BI3	Q0115	DAL3	P32459	195 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BI3	Q0115	TDA3	P38758	523 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BI3	Q0115	RPP1	P38786	293 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BI3	Q0115	FKH2	P41813	862 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BI3	Q0115	YGR153W	P48238	217 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BI3	Q0115	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
BI3	Q0115	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
BI3	Q0115	YLR415C	O13578	112 aa		4.72	□□□□□ -1.65
BI3	Q0115	RET2	P43621	546 aa		4.72	□□□□□ -1.65
BI3	Q0115	FOL1	P53848	824 aa		4.72	□□□□□ -1.65
BI3	Q0115	ECM9	Q02202	377 aa		4.72	□□□□□ -1.65
BI3	Q0115	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
BI3	Q0115	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
BI3	Q0115	EUG1	P32474	517 aa		4.71	□□□□□ -1.66
BI3	Q0115	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
BI3	Q0115	SDS3	P40505	327 aa		4.71	□□□□□ -1.66
BI3	Q0115	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
BI3	Q0115	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
BI3	Q0115	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
BI3	Q0115	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
BI3	Q0115	SIC1	P38634	284 aa		4.7	□□□□□ -1.66
BI3	Q0115	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
BI3	Q0115	HXT7	P39004	570 aa		4.7	□□□□□ -1.66
BI3	Q0115	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66

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