RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637848.1

EFR3A-208, Transcript of EFR3 homolog A, human

TSL 5 BASIC

Gene EFR3A, Length 2,547 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFR3A-208	ENST00000637848	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
EFR3A-208	ENST00000637848	COPS6	Q7L5N1	327 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EFR3A-208	ENST00000637848	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
EFR3A-208	ENST00000637848	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
EFR3A-208	ENST00000637848	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
EFR3A-208	ENST00000637848	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
EFR3A-208	ENST00000637848	MYD88	Q99836	296 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EFR3A-208	ENST00000637848	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EFR3A-208	ENST00000637848	STRN4	Q9NRL3	753 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EFR3A-208	ENST00000637848	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EFR3A-208	ENST00000637848	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EFR3A-208	ENST00000637848	IL2RB	P14784	551 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EFR3A-208	ENST00000637848	SYT1	P21579	422 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EFR3A-208	ENST00000637848	FAM193A	P78312	1265 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EFR3A-208	ENST00000637848	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EFR3A-208	ENST00000637848	MMRN1	Q13201	1228 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EFR3A-208	ENST00000637848	ME3	Q16798	604 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EFR3A-208	ENST00000637848	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EFR3A-208	ENST00000637848	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EFR3A-208	ENST00000637848	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EFR3A-208	ENST00000637848	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EFR3A-208	ENST00000637848	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
EFR3A-208	ENST00000637848	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EFR3A-208	ENST00000637848	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EFR3A-208	ENST00000637848	HYPK	Q9NX55	129 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EFR3A-208	ENST00000637848	AOX1	Q06278	1338 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EFR3A-208	ENST00000637848	COL15A1	P39059	1388 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EFR3A-208	ENST00000637848	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EFR3A-208	ENST00000637848		A0A0G2JLW4	131 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EFR3A-208	ENST00000637848	FIBP	O43427	364 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EFR3A-208	ENST00000637848	PPFIA3	O75145	1194 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EFR3A-208	ENST00000637848	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EFR3A-208	ENST00000637848	GJB2	P29033	226 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EFR3A-208	ENST00000637848	MTX1	Q13505	466 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EFR3A-208	ENST00000637848	FERMT3	Q86UX7	667 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EFR3A-208	ENST00000637848	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EFR3A-208	ENST00000637848	GPATCH11	Q8N954	259 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EFR3A-208	ENST00000637848	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EFR3A-208	ENST00000637848	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EFR3A-208	ENST00000637848	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EFR3A-208	ENST00000637848	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EFR3A-208	ENST00000637848	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EFR3A-208	ENST00000637848	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EFR3A-208	ENST00000637848	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		4.9	□□□□□ -1.62
EFR3A-208	ENST00000637848	MCM2	P49736	904 aa		4.9	□□□□□ -1.62
EFR3A-208	ENST00000637848	CABP4	P57796	275 aa		4.9	□□□□□ -1.62
EFR3A-208	ENST00000637848	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
EFR3A-208	ENST00000637848	STK3	Q13188	491 aa		4.9	□□□□□ -1.62
EFR3A-208	ENST00000637848	NECTIN1	Q15223	517 aa		4.9	□□□□□ -1.62
EFR3A-208	ENST00000637848	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		4.9	□□□□□ -1.62
EFR3A-208	ENST00000637848	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		4.9	□□□□□ -1.62
EFR3A-208	ENST00000637848	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		4.9	□□□□□ -1.62
EFR3A-208	ENST00000637848	LINS1	Q8NG48	757 aa		4.9	□□□□□ -1.62
EFR3A-208	ENST00000637848	IL17RA	Q96F46	866 aa		4.9	□□□□□ -1.62
EFR3A-208	ENST00000637848	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
EFR3A-208	ENST00000637848	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		4.9	□□□□□ -1.62
EFR3A-208	ENST00000637848	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
EFR3A-208	ENST00000637848	MAFG	O15525	162 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	STX6	O43752	255 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	ALDH1L1	O75891	902 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	TFCP2	Q12800	502 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	GCKR	Q14397	625 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	BTG4	Q9NY30	223 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		4.9	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	SLC27A2	O14975	620 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	EVA1C	P58658	441 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	SGSM3	Q96HU1	749 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	FSD1	Q9BTV5	496 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	MTMR6	Q9Y217	621 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	UTY	O14607	1347 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	AP5Z1	O43299	807 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	F13A1	P00488	732 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	KCNJ4	P48050	445 aa		4.89	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
EFR3A-208	ENST00000637848	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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