RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa35.62■■■■□ 3.29
CAPNS1-217ENST00000629983 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP35.61■■■■□ 3.29
CAPNS1-217ENST00000629983 RTL9Q8NET4 1388 aa35.61■■■■□ 3.29
CAPNS1-217ENST00000629983 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP35.6■■■■□ 3.29
CAPNS1-217ENST00000629983 SULF1Q8IWU6 871 aa35.6■■■■□ 3.29
CAPNS1-217ENST00000629983 TBC1D16Q8TBP0 767 aa35.6■■■■□ 3.29
CAPNS1-217ENST00000629983 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP35.6■■■■□ 3.29
CAPNS1-217ENST00000629983 GGA3Q9NZ52 723 aa35.6■■■■□ 3.29
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP35.59■■■■□ 3.29
CAPNS1-217ENST00000629983 RPS8P62241 208 aaKnown RBP35.59■■■■□ 3.29
CAPNS1-217ENST00000629983 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP35.58■■■■□ 3.29
CAPNS1-217ENST00000629983 HOXB7P09629 217 aa35.58■■■■□ 3.29
CAPNS1-217ENST00000629983 HYPKQ9NX55 129 aa35.58■■■■□ 3.29
CAPNS1-217ENST00000629983 SAGE1Q9NXZ1 904 aa35.57■■■■□ 3.28
CAPNS1-217ENST00000629983 UFL1O94874 794 aa35.56■■■■□ 3.28
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa35.56■■■■□ 3.28
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIM35Q9UPQ4 493 aa35.56■■■■□ 3.28
CAPNS1-217ENST00000629983 TRPA1O75762 1119 aa35.55■■■■□ 3.28
CAPNS1-217ENST00000629983 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP35.55■■■■□ 3.28
CAPNS1-217ENST00000629983 RIC3Q7Z5B4 369 aa35.54■■■■□ 3.28
CAPNS1-217ENST00000629983 RUNDC1Q96C34 613 aa35.54■■■■□ 3.28
CAPNS1-217ENST00000629983 COL4A1P02462 1669 aa35.53■■■■□ 3.28
CAPNS1-217ENST00000629983 GOLGA2Q08379 1002 aa35.53■■■■□ 3.28
CAPNS1-217ENST00000629983 DUSP27Q5VZP5 1158 aa35.53■■■■□ 3.28
CAPNS1-217ENST00000629983 GGA1Q9UJY5 639 aa35.53■■■■□ 3.28
CAPNS1-217ENST00000629983 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP35.53■■■■□ 3.28
CAPNS1-217ENST00000629983 VIL1P09327 827 aaKnown RBP35.52■■■■□ 3.28
CAPNS1-217ENST00000629983 CDCA5Q96FF9 252 aa35.52■■■■□ 3.28
CAPNS1-217ENST00000629983 SEC31BQ9NQW1 1179 aa35.52■■■■□ 3.28
CAPNS1-217ENST00000629983 RNF186Q9NXI6 227 aa35.52■■■■□ 3.28
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC10A3P09131 477 aa35.51■■■■□ 3.28
CAPNS1-217ENST00000629983 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP35.51■■■■□ 3.28
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP35.51■■■■□ 3.28
CAPNS1-217ENST00000629983 PODXL2Q9NZ53 605 aa35.5■■■■□ 3.27
CAPNS1-217ENST00000629983 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP35.49■■■■□ 3.27
CAPNS1-217ENST00000629983 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP35.49■■■■□ 3.27
CAPNS1-217ENST00000629983 SOX10P56693 466 aa35.48■■■■□ 3.27
CAPNS1-217ENST00000629983 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP35.48■■■■□ 3.27
CAPNS1-217ENST00000629983 SCARF1Q14162 830 aa35.47■■■■□ 3.27
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC152Q4G0S7 254 aa35.47■■■■□ 3.27
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP35.47■■■■□ 3.27
CAPNS1-217ENST00000629983 MYD88Q99836 296 aa35.47■■■■□ 3.27
CAPNS1-217ENST00000629983 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP35.46■■■■□ 3.27
CAPNS1-217ENST00000629983 CSRNP1Q96S65 589 aa35.46■■■■□ 3.27
CAPNS1-217ENST00000629983 AGBL3Q8NEM8 1001 aa35.45■■■■□ 3.27
CAPNS1-217ENST00000629983 MBIPQ9NS73 344 aa35.45■■■■□ 3.27
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP35.43■■■■□ 3.26
CAPNS1-217ENST00000629983 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP35.43■■■■□ 3.26
CAPNS1-217ENST00000629983 RASAL3Q86YV0 1011 aa35.42■■■■□ 3.26
CAPNS1-217ENST00000629983 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP35.42■■■■□ 3.26
CAPNS1-217ENST00000629983 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP35.4■■■■□ 3.26
CAPNS1-217ENST00000629983 PDE8AO60658 829 aa35.4■■■■□ 3.26
CAPNS1-217ENST00000629983 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP35.4■■■■□ 3.26
CAPNS1-217ENST00000629983 USP17L8P0C7I0 530 aa35.4■■■■□ 3.26
CAPNS1-217ENST00000629983 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP35.4■■■■□ 3.26
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa35.4■■■■□ 3.26
CAPNS1-217ENST00000629983 MYOZ2Q9NPC6 264 aa35.4■■■■□ 3.26
CAPNS1-217ENST00000629983 ADAMTS8Q9UP79 889 aa35.4■■■■□ 3.26
CAPNS1-217ENST00000629983 XDHP47989 1333 aa35.39■■■■□ 3.26
CAPNS1-217ENST00000629983 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP35.39■■■■□ 3.26
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC191Q8NCU4 936 aa35.39■■■■□ 3.26
CAPNS1-217ENST00000629983 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP35.39■■■■□ 3.26
CAPNS1-217ENST00000629983 FKBP1BP68106 108 aa35.38■■■■□ 3.25
CAPNS1-217ENST00000629983 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP35.37■■■■□ 3.25
CAPNS1-217ENST00000629983 SCN9AQ15858 1988 aa35.37■■■■□ 3.25
CAPNS1-217ENST00000629983 USP17L3A6NCW0 530 aa35.36■■■■□ 3.25
CAPNS1-217ENST00000629983 USP17L4A6NCW7 530 aa35.36■■■■□ 3.25
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP2B4P23634 1241 aa35.36■■■■□ 3.25
CAPNS1-217ENST00000629983 USP17L1Q7RTZ2 530 aa35.36■■■■□ 3.25
CAPNS1-217ENST00000629983 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP35.36■■■■□ 3.25
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF609O15014 1411 aa35.35■■■■□ 3.25
CAPNS1-217ENST00000629983 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP35.34■■■■□ 3.25
CAPNS1-217ENST00000629983 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP35.34■■■■□ 3.25
CAPNS1-217ENST00000629983 MOB2Q70IA6 237 aa35.34■■■■□ 3.25
CAPNS1-217ENST00000629983 FBXW7Q969H0 707 aa35.34■■■■□ 3.25
CAPNS1-217ENST00000629983 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa35.33■■■■□ 3.25
CAPNS1-217ENST00000629983 PODNQ7Z5L7 613 aa35.33■■■■□ 3.25
CAPNS1-217ENST00000629983 GMLQ99445 158 aa35.33■■■■□ 3.25
CAPNS1-217ENST00000629983 HDAC9Q9UKV0 1011 aa35.33■■■■□ 3.25
CAPNS1-217ENST00000629983 UBE2Q2LH0YL09 131 aa35.32■■■■□ 3.24
CAPNS1-217ENST00000629983 DDX58O95786 925 aaKnown RBP35.32■■■■□ 3.24
CAPNS1-217ENST00000629983 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP35.32■■■■□ 3.24
CAPNS1-217ENST00000629983 GNAI1P63096 354 aa35.31■■■■□ 3.24
CAPNS1-217ENST00000629983 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa35.31■■■■□ 3.24
CAPNS1-217ENST00000629983 IFT57Q9NWB7 429 aa35.31■■■■□ 3.24
CAPNS1-217ENST00000629983 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa35.3■■■■□ 3.24
CAPNS1-217ENST00000629983 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP35.3■■■■□ 3.24
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF853P0CG23 659 aa35.29■■■■□ 3.24
CAPNS1-217ENST00000629983 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP35.29■■■■□ 3.24
CAPNS1-217ENST00000629983 AKAP11Q9UKA4 1901 aa35.28■■■■□ 3.24
CAPNS1-217ENST00000629983 CTSWP56202 376 aa35.28■■■■□ 3.24
CAPNS1-217ENST00000629983 TBC1D8O95759 1140 aa35.27■■■■□ 3.24
CAPNS1-217ENST00000629983 NBPF9Q3BBW0 867 aa35.27■■■■□ 3.24
CAPNS1-217ENST00000629983 OGFOD1Q8N543 542 aa35.27■■■■□ 3.24
CAPNS1-217ENST00000629983 HPS5Q9UPZ3 1129 aa35.27■■■■□ 3.24
CAPNS1-217ENST00000629983 NF2P35240 595 aa35.26■■■■□ 3.24
CAPNS1-217ENST00000629983 MXD3Q9BW11 206 aa35.26■■■■□ 3.24
CAPNS1-217ENST00000629983 PCDH10Q9P2E7 1040 aa35.26■■■■□ 3.24
CAPNS1-217ENST00000629983 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa35.26■■■■□ 3.24
CAPNS1-217ENST00000629983 MED23Q9ULK4 1368 aa35.25■■■■□ 3.23
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