RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621029.4

SEMA3B-215, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-215ENST00000621029 CNTROBQ8N137 903 aa36.85■■■■□ 3.49
SEMA3B-215ENST00000621029 BEND3Q5T5X7 828 aa36.84■■■■□ 3.49
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC4A10Q6U841 1118 aa36.84■■■■□ 3.49
SEMA3B-215ENST00000621029 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP36.84■■■■□ 3.49
SEMA3B-215ENST00000621029 XDHP47989 1333 aa36.84■■■■□ 3.49
SEMA3B-215ENST00000621029 ECE2O60344 883 aa36.83■■■■□ 3.49
SEMA3B-215ENST00000621029 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP36.83■■■■□ 3.49
SEMA3B-215ENST00000621029 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP36.82■■■■□ 3.48
SEMA3B-215ENST00000621029 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP36.82■■■■□ 3.48
SEMA3B-215ENST00000621029 PLA2G12BQ9BX93 195 aa36.82■■■■□ 3.48
SEMA3B-215ENST00000621029 CREBZFQ9NS37 354 aa36.82■■■■□ 3.48
SEMA3B-215ENST00000621029 CASP7P55210 303 aa36.81■■■■□ 3.48
SEMA3B-215ENST00000621029 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP36.81■■■■□ 3.48
SEMA3B-215ENST00000621029 LTBP1Q14766 1721 aa36.81■■■■□ 3.48
SEMA3B-215ENST00000621029 PASKQ96RG2 1323 aa36.81■■■■□ 3.48
SEMA3B-215ENST00000621029 RTL9Q8NET4 1388 aa36.8■■■■□ 3.48
SEMA3B-215ENST00000621029 SLFN5Q08AF3 891 aa36.8■■■■□ 3.48
SEMA3B-215ENST00000621029 PSMD14O00487 310 aa36.79■■■■□ 3.48
SEMA3B-215ENST00000621029 ITGA6P23229 1130 aa36.79■■■■□ 3.48
SEMA3B-215ENST00000621029 ATP2B4P23634 1241 aa36.79■■■■□ 3.48
SEMA3B-215ENST00000621029 FAM161AQ3B820 660 aa36.79■■■■□ 3.48
SEMA3B-215ENST00000621029 MINPP1Q9UNW1 487 aa36.78■■■■□ 3.48
SEMA3B-215ENST00000621029 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP36.78■■■■□ 3.48
SEMA3B-215ENST00000621029 CHMP3Q9Y3E7 222 aa36.78■■■■□ 3.48
SEMA3B-215ENST00000621029 CDCA7LQ96GN5 454 aa36.77■■■■□ 3.48
SEMA3B-215ENST00000621029 MPHOSPH8Q99549 860 aa36.77■■■■□ 3.48
SEMA3B-215ENST00000621029 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP36.77■■■■□ 3.48
SEMA3B-215ENST00000621029 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP36.77■■■■□ 3.48
SEMA3B-215ENST00000621029 H7C1D1 291 aa36.76■■■■□ 3.48
SEMA3B-215ENST00000621029 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa36.76■■■■□ 3.48
SEMA3B-215ENST00000621029 KCNQ5Q9NR82 932 aa36.76■■■■□ 3.48
SEMA3B-215ENST00000621029 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa36.76■■■■□ 3.47
SEMA3B-215ENST00000621029 TMEM88BA6NKF7 163 aa36.75■■■■□ 3.47
SEMA3B-215ENST00000621029 CSF1RP07333 972 aa36.75■■■■□ 3.47
SEMA3B-215ENST00000621029 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP36.75■■■■□ 3.47
SEMA3B-215ENST00000621029 MYH3P11055 1940 aa36.75■■■■□ 3.47
SEMA3B-215ENST00000621029 GRM8O00222 908 aa36.74■■■■□ 3.47
SEMA3B-215ENST00000621029 MICALL2Q8IY33 904 aa36.74■■■■□ 3.47
SEMA3B-215ENST00000621029 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP36.74■■■■□ 3.47
SEMA3B-215ENST00000621029 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa36.73■■■■□ 3.47
SEMA3B-215ENST00000621029 JMYQ8N9B5 988 aa36.73■■■■□ 3.47
SEMA3B-215ENST00000621029 ALDH1L1O75891 902 aa36.72■■■■□ 3.47
SEMA3B-215ENST00000621029 SHTN1A0MZ66 631 aa36.71■■■■□ 3.47
SEMA3B-215ENST00000621029 SSH1Q8WYL5 1049 aa36.71■■■■□ 3.47
SEMA3B-215ENST00000621029 DPF2Q92785 391 aa36.71■■■■□ 3.47
SEMA3B-215ENST00000621029 CCT4P50991 539 aaKnown RBP36.7■■■■□ 3.47
SEMA3B-215ENST00000621029 FOXO4P98177 505 aa36.7■■■■□ 3.47
SEMA3B-215ENST00000621029 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP36.7■■■■□ 3.47
SEMA3B-215ENST00000621029 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP36.69■■■■□ 3.46
SEMA3B-215ENST00000621029 RPS12P25398 132 aaKnown RBP36.69■■■■□ 3.46
SEMA3B-215ENST00000621029 ANKRD2Q9GZV1 360 aa36.69■■■■□ 3.46
SEMA3B-215ENST00000621029 LMBR1LQ6UX01 489 aa36.68■■■■□ 3.46
SEMA3B-215ENST00000621029 TRPM4Q8TD43 1214 aa36.68■■■■□ 3.46
SEMA3B-215ENST00000621029 SPEF2Q9C093 1822 aa36.66■■■■□ 3.46
SEMA3B-215ENST00000621029 PTPRCP08575 1304 aa36.66■■■■□ 3.46
SEMA3B-215ENST00000621029 KCNJ4P48050 445 aa36.66■■■■□ 3.46
SEMA3B-215ENST00000621029 LEMD3Q9Y2U8 911 aa36.66■■■■□ 3.46
SEMA3B-215ENST00000621029 TRAF5O00463 557 aa36.65■■■■□ 3.46
SEMA3B-215ENST00000621029 VIL1P09327 827 aaKnown RBP36.65■■■■□ 3.46
SEMA3B-215ENST00000621029 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP36.65■■■■□ 3.46
SEMA3B-215ENST00000621029 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP36.65■■■■□ 3.46
SEMA3B-215ENST00000621029 CCDC57Q2TAC2 916 aa36.65■■■■□ 3.46
SEMA3B-215ENST00000621029 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP36.65■■■■□ 3.46
SEMA3B-215ENST00000621029 TAF7LQ5H9L4 462 aa36.65■■■■□ 3.46
SEMA3B-215ENST00000621029 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP36.65■■■■□ 3.46
SEMA3B-215ENST00000621029 SAMD7Q7Z3H4 446 aa36.65■■■■□ 3.46
SEMA3B-215ENST00000621029 SMC4Q9NTJ3 1288 aa36.65■■■■□ 3.46
SEMA3B-215ENST00000621029 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP36.65■■■■□ 3.46
SEMA3B-215ENST00000621029 EPHA10Q5JZY3 1008 aa36.64■■■■□ 3.46
SEMA3B-215ENST00000621029 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP36.64■■■■□ 3.46
SEMA3B-215ENST00000621029 MED23Q9ULK4 1368 aa36.64■■■■□ 3.46
SEMA3B-215ENST00000621029 PODNQ7Z5L7 613 aa36.63■■■■□ 3.45
SEMA3B-215ENST00000621029 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP36.63■■■■□ 3.45
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF804BA4D1E1 1349 aa36.62■■■■□ 3.45
SEMA3B-215ENST00000621029 CHRNDQ07001 517 aa36.62■■■■□ 3.45
SEMA3B-215ENST00000621029 ALDH1L2Q3SY69 923 aa36.62■■■■□ 3.45
SEMA3B-215ENST00000621029 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP36.61■■■■□ 3.45
SEMA3B-215ENST00000621029 FBXW7Q969H0 707 aa36.61■■■■□ 3.45
SEMA3B-215ENST00000621029 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP36.61■■■■□ 3.45
SEMA3B-215ENST00000621029 CNTNAP1P78357 1384 aa36.61■■■■□ 3.45
SEMA3B-215ENST00000621029 USP17L3A6NCW0 530 aa36.6■■■■□ 3.45
SEMA3B-215ENST00000621029 USP17L4A6NCW7 530 aa36.6■■■■□ 3.45
SEMA3B-215ENST00000621029 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP36.6■■■■□ 3.45
SEMA3B-215ENST00000621029 USP17L1Q7RTZ2 530 aa36.6■■■■□ 3.45
SEMA3B-215ENST00000621029 MIER1Q8N108 512 aa36.59■■■■□ 3.45
SEMA3B-215ENST00000621029 PGAP2Q9UHJ9 254 aa36.59■■■■□ 3.45
SEMA3B-215ENST00000621029 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP36.58■■■■□ 3.45
SEMA3B-215ENST00000621029 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP36.58■■■■□ 3.45
SEMA3B-215ENST00000621029 SUCLG2Q96I99 432 aa36.58■■■■□ 3.45
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP36.58■■■■□ 3.45
SEMA3B-215ENST00000621029 COA1Q9GZY4 146 aa36.58■■■■□ 3.45
SEMA3B-215ENST00000621029 DEFB115Q30KQ5 88 aa36.57■■■■□ 3.44
SEMA3B-215ENST00000621029 CDC37L1Q7L3B6 337 aa36.57■■■■□ 3.44
SEMA3B-215ENST00000621029 AGBL3Q8NEM8 1001 aa36.57■■■■□ 3.44
SEMA3B-215ENST00000621029 CNNM1Q9NRU3 951 aa36.57■■■■□ 3.44
SEMA3B-215ENST00000621029 TAF5LO75529 589 aa36.56■■■■□ 3.44
SEMA3B-215ENST00000621029 EGFRP00533 1210 aa36.56■■■■□ 3.44
SEMA3B-215ENST00000621029 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa36.56■■■■□ 3.44
SEMA3B-215ENST00000621029 TXNRD3Q86VQ6 643 aa36.56■■■■□ 3.44
SEMA3B-215ENST00000621029 SCN9AQ15858 1988 aa36.55■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.8 ms