RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000595594.1

FCHO1-210, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 3

Gene FCHO1, Length 898 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-210ENST00000595594 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
FCHO1-210ENST00000595594 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa23.82■■□□□ 1.4
FCHO1-210ENST00000595594 MYH3P11055 1940 aa23.82■■□□□ 1.4
FCHO1-210ENST00000595594 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
FCHO1-210ENST00000595594 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
FCHO1-210ENST00000595594 CCDC30Q5VVM6 783 aa23.81■■□□□ 1.4
FCHO1-210ENST00000595594 USP48Q86UV5 1035 aa23.81■■□□□ 1.4
FCHO1-210ENST00000595594 CCDC191Q8NCU4 936 aa23.81■■□□□ 1.4
FCHO1-210ENST00000595594 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
FCHO1-210ENST00000595594 PGAP2Q9UHJ9 254 aa23.81■■□□□ 1.4
FCHO1-210ENST00000595594 UFL1O94874 794 aa23.8■■□□□ 1.4
FCHO1-210ENST00000595594 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
FCHO1-210ENST00000595594 EYA3Q99504 573 aa23.8■■□□□ 1.4
FCHO1-210ENST00000595594 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa23.8■■□□□ 1.4
FCHO1-210ENST00000595594 TSKSQ9UJT2 592 aa23.8■■□□□ 1.4
FCHO1-210ENST00000595594 PDE8AO60658 829 aa23.79■■□□□ 1.4
FCHO1-210ENST00000595594 ECE1P42892 770 aa23.79■■□□□ 1.4
FCHO1-210ENST00000595594 DDX58O95786 925 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
FCHO1-210ENST00000595594 CCDC152Q4G0S7 254 aa23.78■■□□□ 1.4
FCHO1-210ENST00000595594 G2E3Q7L622 706 aa23.78■■□□□ 1.4
FCHO1-210ENST00000595594 SAPCD2Q86UD0 394 aa23.78■■□□□ 1.4
FCHO1-210ENST00000595594 PI4KAP2A4QPH2 592 aa23.77■■□□□ 1.4
FCHO1-210ENST00000595594 CDC37L1Q7L3B6 337 aa23.77■■□□□ 1.4
FCHO1-210ENST00000595594 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa23.77■■□□□ 1.4
FCHO1-210ENST00000595594 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
FCHO1-210ENST00000595594 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
FCHO1-210ENST00000595594 PSME4Q14997 1843 aa23.77■■□□□ 1.4
FCHO1-210ENST00000595594 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
FCHO1-210ENST00000595594 G3V3G9 751 aa23.76■■□□□ 1.39
FCHO1-210ENST00000595594 IGKV5-2P06315 115 aa23.76■■□□□ 1.39
FCHO1-210ENST00000595594 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
FCHO1-210ENST00000595594 DCAF8Q5TAQ9 597 aa23.76■■□□□ 1.39
FCHO1-210ENST00000595594 DPF2Q92785 391 aa23.76■■□□□ 1.39
FCHO1-210ENST00000595594 GGA1Q9UJY5 639 aa23.76■■□□□ 1.39
FCHO1-210ENST00000595594 ADM5C9JUS6 153 aa23.75■■□□□ 1.39
FCHO1-210ENST00000595594 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
FCHO1-210ENST00000595594 KSR2Q6VAB6 950 aa23.75■■□□□ 1.39
FCHO1-210ENST00000595594 PODXL2Q9NZ53 605 aa23.75■■□□□ 1.39
FCHO1-210ENST00000595594 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
FCHO1-210ENST00000595594 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa23.74■■□□□ 1.39
FCHO1-210ENST00000595594 WWC1Q8IX03 1113 aa23.74■■□□□ 1.39
FCHO1-210ENST00000595594 STK31Q9BXU1 1019 aa23.74■■□□□ 1.39
FCHO1-210ENST00000595594 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
FCHO1-210ENST00000595594 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
FCHO1-210ENST00000595594 CTSWP56202 376 aa23.73■■□□□ 1.39
FCHO1-210ENST00000595594 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
FCHO1-210ENST00000595594 KRT26Q7Z3Y9 468 aa23.73■■□□□ 1.39
FCHO1-210ENST00000595594 BEGAINQ9BUH8 593 aa23.73■■□□□ 1.39
FCHO1-210ENST00000595594 GREM2Q9H772 168 aa23.72■■□□□ 1.39
FCHO1-210ENST00000595594 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa23.72■■□□□ 1.39
FCHO1-210ENST00000595594 VIL1P09327 827 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
FCHO1-210ENST00000595594 RPS12P25398 132 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
FCHO1-210ENST00000595594 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa23.71■■□□□ 1.39
FCHO1-210ENST00000595594 ZIC5Q96T25 663 aa23.71■■□□□ 1.39
FCHO1-210ENST00000595594 SLC4A2P04920 1241 aa23.7■■□□□ 1.38
FCHO1-210ENST00000595594 HUNKP57058 714 aa23.7■■□□□ 1.38
FCHO1-210ENST00000595594 XDHP47989 1333 aa23.69■■□□□ 1.38
FCHO1-210ENST00000595594 NEURL1BA8MQ27 555 aa23.69■■□□□ 1.38
FCHO1-210ENST00000595594 NEXNQ0ZGT2 675 aa23.69■■□□□ 1.38
FCHO1-210ENST00000595594 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa23.69■■□□□ 1.38
FCHO1-210ENST00000595594 TTLL11Q8NHH1 800 aa23.69■■□□□ 1.38
FCHO1-210ENST00000595594 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
FCHO1-210ENST00000595594 MRS2Q9HD23 443 aa23.69■■□□□ 1.38
FCHO1-210ENST00000595594 GGA3Q9NZ52 723 aa23.69■■□□□ 1.38
FCHO1-210ENST00000595594 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
FCHO1-210ENST00000595594 MAP2K2P36507 400 aa23.68■■□□□ 1.38
FCHO1-210ENST00000595594 CCDC27Q2M243 656 aa23.68■■□□□ 1.38
FCHO1-210ENST00000595594 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
FCHO1-210ENST00000595594 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
FCHO1-210ENST00000595594 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
FCHO1-210ENST00000595594 CHMP4AQ9BY43 222 aa23.67■■□□□ 1.38
FCHO1-210ENST00000595594 FANCIQ9NVI1 1328 aa23.66■■□□□ 1.38
FCHO1-210ENST00000595594 CACNA1FO60840 1977 aa23.66■■□□□ 1.38
FCHO1-210ENST00000595594 ATP2B4P23634 1241 aa23.66■■□□□ 1.38
FCHO1-210ENST00000595594 ABHD8Q96I13 439 aa23.66■■□□□ 1.38
FCHO1-210ENST00000595594 HHIPL1Q96JK4 782 aa23.66■■□□□ 1.38
FCHO1-210ENST00000595594 MXD3Q9BW11 206 aa23.66■■□□□ 1.38
FCHO1-210ENST00000595594 MINPP1Q9UNW1 487 aa23.66■■□□□ 1.38
FCHO1-210ENST00000595594 FBXW7Q969H0 707 aa23.65■■□□□ 1.38
FCHO1-210ENST00000595594 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
FCHO1-210ENST00000595594 FLIIQ13045 1269 aa23.64■■□□□ 1.37
FCHO1-210ENST00000595594 SCARF1Q14162 830 aa23.64■■□□□ 1.37
FCHO1-210ENST00000595594 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
FCHO1-210ENST00000595594 H7C1W4 665 aa23.63■■□□□ 1.37
FCHO1-210ENST00000595594 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
FCHO1-210ENST00000595594 SULF1Q8IWU6 871 aa23.63■■□□□ 1.37
FCHO1-210ENST00000595594 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
FCHO1-210ENST00000595594 IL16Q14005 1332 aa23.62■■□□□ 1.37
FCHO1-210ENST00000595594 USP17L3A6NCW0 530 aa23.62■■□□□ 1.37
FCHO1-210ENST00000595594 USP17L4A6NCW7 530 aa23.62■■□□□ 1.37
FCHO1-210ENST00000595594 CCT4P50991 539 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
FCHO1-210ENST00000595594 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
FCHO1-210ENST00000595594 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
FCHO1-210ENST00000595594 GCKRQ14397 625 aa23.62■■□□□ 1.37
FCHO1-210ENST00000595594 FAM161AQ3B820 660 aa23.62■■□□□ 1.37
FCHO1-210ENST00000595594 RGMBQ6NW40 437 aa23.62■■□□□ 1.37
FCHO1-210ENST00000595594 USP17L1Q7RTZ2 530 aa23.62■■□□□ 1.37
FCHO1-210ENST00000595594 C2orf69Q8N8R5 385 aa23.62■■□□□ 1.37
FCHO1-210ENST00000595594 AGBL3Q8NEM8 1001 aa23.62■■□□□ 1.37
FCHO1-210ENST00000595594 CDCA5Q96FF9 252 aa23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms