RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592484.5

LRP3-204, Transcript of LDL receptor related protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene LRP3, Length 575 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP3-204ENST00000592484 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
LRP3-204ENST00000592484 PI4KAP2A4QPH2 592 aa20.39■□□□□ 0.85
LRP3-204ENST00000592484 NEXNQ0ZGT2 675 aa20.39■□□□□ 0.85
LRP3-204ENST00000592484 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
LRP3-204ENST00000592484 CDC37L1Q7L3B6 337 aa20.39■□□□□ 0.85
LRP3-204ENST00000592484 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa20.39■□□□□ 0.85
LRP3-204ENST00000592484 CAPNS2Q96L46 248 aa20.39■□□□□ 0.85
LRP3-204ENST00000592484 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
LRP3-204ENST00000592484 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa20.39■□□□□ 0.85
LRP3-204ENST00000592484 GGA1Q9UJY5 639 aa20.39■□□□□ 0.85
LRP3-204ENST00000592484 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
LRP3-204ENST00000592484 MYH3P11055 1940 aa20.38■□□□□ 0.85
LRP3-204ENST00000592484 UFL1O94874 794 aa20.38■□□□□ 0.85
LRP3-204ENST00000592484 CELF2O95319 508 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
LRP3-204ENST00000592484 HHIPL1Q96JK4 782 aa20.38■□□□□ 0.85
LRP3-204ENST00000592484 RTL9Q8NET4 1388 aa20.37■□□□□ 0.85
LRP3-204ENST00000592484 IGKV5-2P06315 115 aa20.37■□□□□ 0.85
LRP3-204ENST00000592484 CTSWP56202 376 aa20.37■□□□□ 0.85
LRP3-204ENST00000592484 DOK7Q18PE1 504 aa20.37■□□□□ 0.85
LRP3-204ENST00000592484 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
LRP3-204ENST00000592484 SAPCD2Q86UD0 394 aa20.37■□□□□ 0.85
LRP3-204ENST00000592484 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa20.37■□□□□ 0.85
LRP3-204ENST00000592484 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
LRP3-204ENST00000592484 XDHP47989 1333 aa20.36■□□□□ 0.85
LRP3-204ENST00000592484 SHTN1A0MZ66 631 aa20.36■□□□□ 0.85
LRP3-204ENST00000592484 CYP4F22Q6NT55 531 aa20.36■□□□□ 0.85
LRP3-204ENST00000592484 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
LRP3-204ENST00000592484 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
LRP3-204ENST00000592484 MRS2Q9HD23 443 aa20.36■□□□□ 0.85
LRP3-204ENST00000592484 ZNF609O15014 1411 aa20.36■□□□□ 0.85
LRP3-204ENST00000592484 CACNA1FO60840 1977 aa20.35■□□□□ 0.85
LRP3-204ENST00000592484 SCN9AQ15858 1988 aa20.35■□□□□ 0.85
LRP3-204ENST00000592484 G3V3G9 751 aa20.35■□□□□ 0.85
LRP3-204ENST00000592484 CAPN15O75808 1086 aa20.35■□□□□ 0.85
LRP3-204ENST00000592484 VIL1P09327 827 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
LRP3-204ENST00000592484 DCAF8Q5TAQ9 597 aa20.35■□□□□ 0.85
LRP3-204ENST00000592484 SAMD7Q7Z3H4 446 aa20.35■□□□□ 0.85
LRP3-204ENST00000592484 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
LRP3-204ENST00000592484 KCNQ5Q9NR82 932 aa20.35■□□□□ 0.85
LRP3-204ENST00000592484 PSME4Q14997 1843 aa20.34■□□□□ 0.85
LRP3-204ENST00000592484 NEURL1BA8MQ27 555 aa20.34■□□□□ 0.85
LRP3-204ENST00000592484 ANP32CO43423 234 aa20.34■□□□□ 0.85
LRP3-204ENST00000592484 SLC4A2P04920 1241 aa20.34■□□□□ 0.85
LRP3-204ENST00000592484 MAP2K2P36507 400 aa20.34■□□□□ 0.85
LRP3-204ENST00000592484 LBX1P52954 281 aa20.34■□□□□ 0.85
LRP3-204ENST00000592484 TTLL11Q8NHH1 800 aa20.34■□□□□ 0.85
LRP3-204ENST00000592484 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
LRP3-204ENST00000592484 ATP2B4P23634 1241 aa20.33■□□□□ 0.85
LRP3-204ENST00000592484 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
LRP3-204ENST00000592484 WDR63Q8IWG1 891 aa20.33■□□□□ 0.85
LRP3-204ENST00000592484 BEGAINQ9BUH8 593 aa20.33■□□□□ 0.85
LRP3-204ENST00000592484 FANCIQ9NVI1 1328 aa20.32■□□□□ 0.84
LRP3-204ENST00000592484 GRM1Q13255 1194 aa20.32■□□□□ 0.84
LRP3-204ENST00000592484 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
LRP3-204ENST00000592484 G2E3Q7L622 706 aa20.32■□□□□ 0.84
LRP3-204ENST00000592484 USP48Q86UV5 1035 aa20.32■□□□□ 0.84
LRP3-204ENST00000592484 ZNF408Q9H9D4 720 aa20.32■□□□□ 0.84
LRP3-204ENST00000592484 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
LRP3-204ENST00000592484 H7C1W4 665 aa20.31■□□□□ 0.84
LRP3-204ENST00000592484 EGFRP00533 1210 aa20.31■□□□□ 0.84
LRP3-204ENST00000592484 FLIIQ13045 1269 aa20.31■□□□□ 0.84
LRP3-204ENST00000592484 KRT26Q7Z3Y9 468 aa20.31■□□□□ 0.84
LRP3-204ENST00000592484 PODNQ7Z5L7 613 aa20.31■□□□□ 0.84
LRP3-204ENST00000592484 AGBL3Q8NEM8 1001 aa20.31■□□□□ 0.84
LRP3-204ENST00000592484 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
LRP3-204ENST00000592484 SPEF2Q9C093 1822 aa20.3■□□□□ 0.84
LRP3-204ENST00000592484 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
LRP3-204ENST00000592484 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa20.3■□□□□ 0.84
LRP3-204ENST00000592484 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
LRP3-204ENST00000592484 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa20.3■□□□□ 0.84
LRP3-204ENST00000592484 PLA2G12BQ9BX93 195 aa20.3■□□□□ 0.84
LRP3-204ENST00000592484 MYH16Q9H6N6 1097 aa20.3■□□□□ 0.84
LRP3-204ENST00000592484 GREM2Q9H772 168 aa20.3■□□□□ 0.84
LRP3-204ENST00000592484 MED23Q9ULK4 1368 aa20.3■□□□□ 0.84
LRP3-204ENST00000592484 GCKRQ14397 625 aa20.29■□□□□ 0.84
LRP3-204ENST00000592484 MINPP1Q9UNW1 487 aa20.29■□□□□ 0.84
LRP3-204ENST00000592484 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
LRP3-204ENST00000592484 AOC2O75106 756 aa20.28■□□□□ 0.84
LRP3-204ENST00000592484 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
LRP3-204ENST00000592484 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
LRP3-204ENST00000592484 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
LRP3-204ENST00000592484 LINS1Q8NG48 757 aa20.28■□□□□ 0.84
LRP3-204ENST00000592484 DNAAF4Q8WXU2 420 aa20.28■□□□□ 0.84
LRP3-204ENST00000592484 USP17L3A6NCW0 530 aa20.27■□□□□ 0.84
LRP3-204ENST00000592484 USP17L4A6NCW7 530 aa20.27■□□□□ 0.84
LRP3-204ENST00000592484 CA12O43570 354 aa20.27■□□□□ 0.84
LRP3-204ENST00000592484 VAMP4O75379 141 aa20.27■□□□□ 0.84
LRP3-204ENST00000592484 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
LRP3-204ENST00000592484 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
LRP3-204ENST00000592484 USP17L1Q7RTZ2 530 aa20.27■□□□□ 0.84
LRP3-204ENST00000592484 CCT4P50991 539 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
LRP3-204ENST00000592484 HUNKP57058 714 aa20.26■□□□□ 0.83
LRP3-204ENST00000592484 NOGQ13253 232 aa20.26■□□□□ 0.83
LRP3-204ENST00000592484 SULF1Q8IWU6 871 aa20.26■□□□□ 0.83
LRP3-204ENST00000592484 GMLQ99445 158 aa20.26■□□□□ 0.83
LRP3-204ENST00000592484 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
LRP3-204ENST00000592484 GGA3Q9NZ52 723 aa20.26■□□□□ 0.83
LRP3-204ENST00000592484 LEMD3Q9Y2U8 911 aa20.26■□□□□ 0.83
LRP3-204ENST00000592484 ADM5C9JUS6 153 aa20.25■□□□□ 0.83
LRP3-204ENST00000592484 USP17L8P0C7I0 530 aa20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms