RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-222	ENST00000592408	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		11.14	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	TMEM94	Q12767	1356 aa		11.14	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	AK9	Q5TCS8	1911 aa		11.13	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	HIP1	O00291	1037 aa		11.13	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	FECH	P22830	423 aa		11.13	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	NEK4	P51957	841 aa		11.13	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		11.13	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		11.13	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		11.13	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		11.13	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	CPD	O75976	1380 aa		11.13	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	UTY	O14607	1347 aa		11.12	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	RAD50	Q92878	1312 aa		11.12	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	GRM8	O00222	908 aa		11.12	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	KCNQ3	O43525	872 aa		11.12	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		11.12	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		11.12	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		11.12	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		11.12	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		11.12	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		11.12	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		11.12	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	HSPA4	P34932	840 aa		11.11	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		11.11	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	DCAF5	Q96JK2	942 aa		11.11	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		11.11	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		11.11	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		11.11	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	COL18A1	P39060	1754 aa		11.11	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	MEGF6	O75095	1541 aa		11.1	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	SGSM2	O43147	1006 aa		11.1	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	MBD3	O95983	291 aa		11.1	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	PHKG2	P15735	406 aa		11.1	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	CUL4A	Q13619	759 aa		11.1	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	ZNF790	Q6PG37	636 aa		11.1	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		11.1	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	TMX3	Q96JJ7	454 aa		11.1	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	C5	P01031	1676 aa		11.1	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	RGPD5	Q99666	1765 aa		11.1	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	ERBB4	Q15303	1308 aa		11.09	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	COL15A1	P39059	1388 aa		11.09	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	RNF223	E7ERA6	249 aa		11.09	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	CFH	P08603	1231 aa		11.09	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	11.09	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	11.09	□□□□□ -0.63	3e-10	■■■□□ 16.5
EFTUD2-222	ENST00000592408	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		11.09	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	EVI5L	Q96CN4	794 aa		11.09	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
EFTUD2-222	ENST00000592408	GPR37	O15354	613 aa		11.08	□□□□□ -0.64
EFTUD2-222	ENST00000592408	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
EFTUD2-222	ENST00000592408	ZMYND10	O75800	440 aa		11.08	□□□□□ -0.64
EFTUD2-222	ENST00000592408	ANXA1	P04083	346 aa		11.08	□□□□□ -0.64
EFTUD2-222	ENST00000592408	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
EFTUD2-222	ENST00000592408	MCTP1	Q6DN14	999 aa		11.08	□□□□□ -0.64
EFTUD2-222	ENST00000592408	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		11.08	□□□□□ -0.64
EFTUD2-222	ENST00000592408	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		11.07	□□□□□ -0.64
EFTUD2-222	ENST00000592408	PROSER3	Q2NL68	480 aa		11.07	□□□□□ -0.64
EFTUD2-222	ENST00000592408	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		11.07	□□□□□ -0.64
EFTUD2-222	ENST00000592408	AACS	Q86V21	672 aa		11.07	□□□□□ -0.64
EFTUD2-222	ENST00000592408	NLRP7	Q8WX94	980 aa		11.07	□□□□□ -0.64
EFTUD2-222	ENST00000592408	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
EFTUD2-222	ENST00000592408	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
EFTUD2-222	ENST00000592408	PALD1	Q9ULE6	856 aa		11.07	□□□□□ -0.64
EFTUD2-222	ENST00000592408	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		11.07	□□□□□ -0.64
EFTUD2-222	ENST00000592408	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		11.07	□□□□□ -0.64
EFTUD2-222	ENST00000592408	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		11.07	□□□□□ -0.64
EFTUD2-222	ENST00000592408	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
EFTUD2-222	ENST00000592408	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
EFTUD2-222	ENST00000592408	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
EFTUD2-222	ENST00000592408	ZNF445	P59923	1031 aa		11.06	□□□□□ -0.64
EFTUD2-222	ENST00000592408	LAPTM4A	Q15012	233 aa		11.06	□□□□□ -0.64
EFTUD2-222	ENST00000592408	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
EFTUD2-222	ENST00000592408	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		11.06	□□□□□ -0.64
EFTUD2-222	ENST00000592408	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
EFTUD2-222	ENST00000592408	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
EFTUD2-222	ENST00000592408	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
EFTUD2-222	ENST00000592408	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		11.05	□□□□□ -0.64
EFTUD2-222	ENST00000592408	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		11.05	□□□□□ -0.64
EFTUD2-222	ENST00000592408	BRD1	O95696	1058 aa		11.05	□□□□□ -0.64
EFTUD2-222	ENST00000592408	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
EFTUD2-222	ENST00000592408	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	11.05	□□□□□ -0.64
EFTUD2-222	ENST00000592408	CABP4	P57796	275 aa		11.05	□□□□□ -0.64
EFTUD2-222	ENST00000592408	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
EFTUD2-222	ENST00000592408	GCKR	Q14397	625 aa		11.05	□□□□□ -0.64
EFTUD2-222	ENST00000592408	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		11.05	□□□□□ -0.64
EFTUD2-222	ENST00000592408	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		11.05	□□□□□ -0.64
EFTUD2-222	ENST00000592408	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	11.05	□□□□□ -0.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.5 ms