RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591287.5

CELF4-218, Transcript of CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CELF4, Length 3,757 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4-218ENST00000591287 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa14.89□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 STK38Q15208 465 aa14.88□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 CHST3Q7LGC8 479 aa14.88□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 MYO1CO00159 1063 aa14.88□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 RABEP2Q9H5N1 569 aa14.88□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 ARFGAP3Q9NP61 516 aa14.88□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 LCMT1Q9UIC8 334 aa14.88□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 PLA2G4AP47712 749 aa14.88□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 KARSQ15046 597 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa14.87□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 USP44Q9H0E7 712 aa14.87□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 GSDMDP57764 484 aa14.87□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 E2F4Q16254 413 aa14.87□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 FHOD1Q9Y613 1164 aa14.87□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 TAF6LQ9Y6J9 622 aa14.86□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 RGPD1P0DJD0 1748 aa14.86□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 CASQ1P31415 396 aa14.86□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 CCZ1BP86790 482 aa14.86□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP14.86□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 HSP90B2PQ58FF3 399 aa14.86□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 ECHDC1Q9NTX5 307 aa14.86□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 PI4KAP2A4QPH2 592 aa14.85□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 FAM193AP78312 1265 aa14.85□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa14.85□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 CPLX3Q8WVH0 158 aa14.85□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 PTPRUQ92729 1446 aa14.85□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 SART3Q15020 963 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 CCDC61Q9Y6R9 512 aa14.85□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa14.85□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 SLC27A2O14975 620 aa14.85□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 ANKRD1Q15327 319 aa14.85□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 Q6ZUG5 572 aa14.85□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa14.84□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa14.84□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 NYAP1Q6ZVC0 841 aa14.84□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 USHBP1Q8N6Y0 703 aa14.84□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 PI4K2BQ8TCG2 481 aa14.84□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 STAP2Q9UGK3 403 aa14.84□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 WWC2Q6AWC2 1192 aa14.84□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa14.84□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 ST3GAL1Q11201 340 aa14.83□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 USP28Q96RU2 1077 aa14.83□□□□□ -0.03
CELF4-218ENST00000591287 RHOXF2BP0C7M4 288 aa14.83□□□□□ -0.04
CELF4-218ENST00000591287 TOP1P11387 765 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
CELF4-218ENST00000591287 UBASH3AP57075 661 aa14.83□□□□□ -0.04
CELF4-218ENST00000591287 ETF1P62495 437 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
CELF4-218ENST00000591287 DPCR1Q3MIW9 517 aa14.83□□□□□ -0.04
CELF4-218ENST00000591287 RHOXF2Q9BQY4 288 aa14.83□□□□□ -0.04
CELF4-218ENST00000591287 DEF6Q9H4E7 631 aa14.83□□□□□ -0.04
CELF4-218ENST00000591287 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
CELF4-218ENST00000591287 SSH2Q76I76 1423 aa14.83□□□□□ -0.04
CELF4-218ENST00000591287 IQCB1Q15051 598 aa14.83□□□□□ -0.04
CELF4-218ENST00000591287 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa14.83□□□□□ -0.04
CELF4-218ENST00000591287 KLHDC4Q8TBB5 520 aa14.83□□□□□ -0.04
CELF4-218ENST00000591287 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
CELF4-218ENST00000591287 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
CELF4-218ENST00000591287 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa14.82□□□□□ -0.04
CELF4-218ENST00000591287 LZTFL1Q9NQ48 299 aa14.82□□□□□ -0.04
CELF4-218ENST00000591287 METP08581 1390 aa14.82□□□□□ -0.04
CELF4-218ENST00000591287 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
CELF4-218ENST00000591287 NLRP6P59044 892 aa14.82□□□□□ -0.04
CELF4-218ENST00000591287 ATP1A3P13637 1013 aa14.82□□□□□ -0.04
CELF4-218ENST00000591287 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
CELF4-218ENST00000591287 DESI2Q9BSY9 194 aa14.82□□□□□ -0.04
CELF4-218ENST00000591287 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa14.82□□□□□ -0.04
CELF4-218ENST00000591287 ATP2B1P20020 1258 aa14.81□□□□□ -0.04
CELF4-218ENST00000591287 A0A0D9SFI3 127 aa14.81□□□□□ -0.04
CELF4-218ENST00000591287 WASLO00401 505 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
CELF4-218ENST00000591287 APOBRQ0VD83 1088 aa14.81□□□□□ -0.04
CELF4-218ENST00000591287 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
CELF4-218ENST00000591287 CCDC150Q8NCX0 1101 aa14.81□□□□□ -0.04
CELF4-218ENST00000591287 ADAM21Q9UKJ8 722 aa14.81□□□□□ -0.04
CELF4-218ENST00000591287 CTAGE5O15320 804 aa14.81□□□□□ -0.04
CELF4-218ENST00000591287 PPP2R3AQ06190 1150 aa14.81□□□□□ -0.04
CELF4-218ENST00000591287 ARMCX5Q6P1M9 558 aa14.81□□□□□ -0.04
CELF4-218ENST00000591287 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa14.81□□□□□ -0.04
CELF4-218ENST00000591287 NEK1Q96PY6 1258 aa14.81□□□□□ -0.04
CELF4-218ENST00000591287 PDE11AQ9HCR9 933 aa14.81□□□□□ -0.04
CELF4-218ENST00000591287 KIF24Q5T7B8 1368 aa14.8□□□□□ -0.04
CELF4-218ENST00000591287 RPS6KB1P23443 525 aa14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms