RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583704.1

TTC19-210, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 19, humanhuman

TSL 2

Gene TTC19, Length 552 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC19-210ENST00000583704 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
TTC19-210ENST00000583704 WBP1LQ9NX94 342 aa28.7■■■□□ 2.18
TTC19-210ENST00000583704 PGAP2Q9UHJ9 254 aa28.7■■■□□ 2.18
TTC19-210ENST00000583704 MYH3P11055 1940 aa28.7■■■□□ 2.18
TTC19-210ENST00000583704 SCN9AQ15858 1988 aa28.7■■■□□ 2.18
TTC19-210ENST00000583704 H7C1D1 291 aa28.69■■■□□ 2.18
TTC19-210ENST00000583704 UFL1O94874 794 aa28.69■■■□□ 2.18
TTC19-210ENST00000583704 IGKV5-2P06315 115 aa28.69■■■□□ 2.18
TTC19-210ENST00000583704 KCNQ5Q9NR82 932 aa28.69■■■□□ 2.18
TTC19-210ENST00000583704 PODXL2Q9NZ53 605 aa28.69■■■□□ 2.18
TTC19-210ENST00000583704 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa28.69■■■□□ 2.18
TTC19-210ENST00000583704 RTL9Q8NET4 1388 aa28.69■■■□□ 2.18
TTC19-210ENST00000583704 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
TTC19-210ENST00000583704 TLL2Q9Y6L7 1015 aa28.68■■■□□ 2.18
TTC19-210ENST00000583704 SPEF2Q9C093 1822 aa28.68■■■□□ 2.18
TTC19-210ENST00000583704 IL16Q14005 1332 aa28.68■■■□□ 2.18
TTC19-210ENST00000583704 CELF2O95319 508 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
TTC19-210ENST00000583704 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
TTC19-210ENST00000583704 GRM1Q13255 1194 aa28.67■■■□□ 2.18
TTC19-210ENST00000583704 CYP4F22Q6NT55 531 aa28.67■■■□□ 2.18
TTC19-210ENST00000583704 G2E3Q7L622 706 aa28.67■■■□□ 2.18
TTC19-210ENST00000583704 DPF2Q92785 391 aa28.67■■■□□ 2.18
TTC19-210ENST00000583704 CAPNS2Q96L46 248 aa28.67■■■□□ 2.18
TTC19-210ENST00000583704 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
TTC19-210ENST00000583704 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
TTC19-210ENST00000583704 GGA1Q9UJY5 639 aa28.66■■■□□ 2.18
TTC19-210ENST00000583704 CTSWP56202 376 aa28.65■■■□□ 2.18
TTC19-210ENST00000583704 NEXNQ0ZGT2 675 aa28.65■■■□□ 2.18
TTC19-210ENST00000583704 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
TTC19-210ENST00000583704 SAMD7Q7Z3H4 446 aa28.65■■■□□ 2.18
TTC19-210ENST00000583704 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa28.65■■■□□ 2.18
TTC19-210ENST00000583704 SLC4A2P04920 1241 aa28.64■■■□□ 2.18
TTC19-210ENST00000583704 FAM9BQ8IZU0 186 aa28.64■■■□□ 2.18
TTC19-210ENST00000583704 ZNF408Q9H9D4 720 aa28.64■■■□□ 2.18
TTC19-210ENST00000583704 PRDM10Q9NQV6 1147 aa28.64■■■□□ 2.18
TTC19-210ENST00000583704 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
TTC19-210ENST00000583704 EGFRP00533 1210 aa28.63■■■□□ 2.17
TTC19-210ENST00000583704 RPS12P25398 132 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
TTC19-210ENST00000583704 ECE1P42892 770 aa28.63■■■□□ 2.17
TTC19-210ENST00000583704 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
TTC19-210ENST00000583704 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
TTC19-210ENST00000583704 CDC37L1Q7L3B6 337 aa28.63■■■□□ 2.17
TTC19-210ENST00000583704 FANCIQ9NVI1 1328 aa28.63■■■□□ 2.17
TTC19-210ENST00000583704 NEURL1BA8MQ27 555 aa28.62■■■□□ 2.17
TTC19-210ENST00000583704 G3V3G9 751 aa28.62■■■□□ 2.17
TTC19-210ENST00000583704 DCAF8Q5TAQ9 597 aa28.62■■■□□ 2.17
TTC19-210ENST00000583704 SAPCD2Q86UD0 394 aa28.62■■■□□ 2.17
TTC19-210ENST00000583704 PSME4Q14997 1843 aa28.62■■■□□ 2.17
TTC19-210ENST00000583704 LBX1P52954 281 aa28.61■■■□□ 2.17
TTC19-210ENST00000583704 TTLL11Q8NHH1 800 aa28.61■■■□□ 2.17
TTC19-210ENST00000583704 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
TTC19-210ENST00000583704 XDHP47989 1333 aa28.61■■■□□ 2.17
TTC19-210ENST00000583704 USP48Q86UV5 1035 aa28.6■■■□□ 2.17
TTC19-210ENST00000583704 GREM2Q9H772 168 aa28.6■■■□□ 2.17
TTC19-210ENST00000583704 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
TTC19-210ENST00000583704 CACNA1FO60840 1977 aa28.59■■■□□ 2.17
TTC19-210ENST00000583704 VIL1P09327 827 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
TTC19-210ENST00000583704 FLIIQ13045 1269 aa28.59■■■□□ 2.17
TTC19-210ENST00000583704 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
TTC19-210ENST00000583704 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa28.59■■■□□ 2.17
TTC19-210ENST00000583704 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
TTC19-210ENST00000583704 DLK2Q6UY11 383 aa28.58■■■□□ 2.17
TTC19-210ENST00000583704 AOC2O75106 756 aa28.57■■■□□ 2.16
TTC19-210ENST00000583704 H7C1W4 665 aa28.56■■■□□ 2.16
TTC19-210ENST00000583704 ATP2B4P23634 1241 aa28.56■■■□□ 2.16
TTC19-210ENST00000583704 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
TTC19-210ENST00000583704 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa28.56■■■□□ 2.16
TTC19-210ENST00000583704 KRT26Q7Z3Y9 468 aa28.55■■■□□ 2.16
TTC19-210ENST00000583704 WDR63Q8IWG1 891 aa28.55■■■□□ 2.16
TTC19-210ENST00000583704 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
TTC19-210ENST00000583704 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
TTC19-210ENST00000583704 GCKRQ14397 625 aa28.54■■■□□ 2.16
TTC19-210ENST00000583704 DNAAF4Q8WXU2 420 aa28.54■■■□□ 2.16
TTC19-210ENST00000583704 HHIPL1Q96JK4 782 aa28.54■■■□□ 2.16
TTC19-210ENST00000583704 MINPP1Q9UNW1 487 aa28.54■■■□□ 2.16
TTC19-210ENST00000583704 ZNF609O15014 1411 aa28.53■■■□□ 2.16
TTC19-210ENST00000583704 ADM5C9JUS6 153 aa28.53■■■□□ 2.16
TTC19-210ENST00000583704 VAMP4O75379 141 aa28.53■■■□□ 2.16
TTC19-210ENST00000583704 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
TTC19-210ENST00000583704 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
TTC19-210ENST00000583704 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
TTC19-210ENST00000583704 BEGAINQ9BUH8 593 aa28.53■■■□□ 2.16
TTC19-210ENST00000583704 MAP2K2P36507 400 aa28.52■■■□□ 2.16
TTC19-210ENST00000583704 GGA3Q9NZ52 723 aa28.52■■■□□ 2.16
TTC19-210ENST00000583704 MED23Q9ULK4 1368 aa28.51■■■□□ 2.16
TTC19-210ENST00000583704 AGBL3Q8NEM8 1001 aa28.51■■■□□ 2.15
TTC19-210ENST00000583704 MYH16Q9H6N6 1097 aa28.51■■■□□ 2.15
TTC19-210ENST00000583704 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
TTC19-210ENST00000583704 CASP7P55210 303 aa28.5■■■□□ 2.15
TTC19-210ENST00000583704 PODNQ7Z5L7 613 aa28.5■■■□□ 2.15
TTC19-210ENST00000583704 LINS1Q8NG48 757 aa28.5■■■□□ 2.15
TTC19-210ENST00000583704 PLA2G12BQ9BX93 195 aa28.5■■■□□ 2.15
TTC19-210ENST00000583704 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
TTC19-210ENST00000583704 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
TTC19-210ENST00000583704 ITGA6P23229 1130 aa28.49■■■□□ 2.15
TTC19-210ENST00000583704 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
TTC19-210ENST00000583704 CCT4P50991 539 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
TTC19-210ENST00000583704 HUNKP57058 714 aa28.49■■■□□ 2.15
TTC19-210ENST00000583704 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
TTC19-210ENST00000583704 FAM161AQ3B820 660 aa28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms