RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578025.5

TSPOAP1-AS1-201, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,229 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TTLL11Q8NHH1 800 aa28.8■■■□□ 2.2
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GREM2Q9H772 168 aa28.8■■■□□ 2.2
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SNRKQ9NRH2 765 aa28.8■■■□□ 2.2
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MED23Q9ULK4 1368 aa28.8■■■□□ 2.2
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CHGBP05060 677 aa28.79■■■□□ 2.2
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ITGA6P23229 1130 aa28.79■■■□□ 2.2
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF34Q8IZ26 560 aa28.79■■■□□ 2.2
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CASTP20810 708 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NECTIN1Q15223 517 aa28.78■■■□□ 2.2
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MAP4K1Q92918 833 aa28.78■■■□□ 2.2
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CPA1P15085 419 aa28.78■■■□□ 2.2
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MSNP26038 577 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FBXO3Q9UK99 471 aa28.78■■■□□ 2.2
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GOLIM4O00461 696 aa28.77■■■□□ 2.2
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 OFD1O75665 1012 aa28.77■■■□□ 2.2
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ADCK5Q3MIX3 580 aa28.77■■■□□ 2.2
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM177BA6PVY3 158 aa28.76■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CREB3L3Q68CJ9 461 aa28.76■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PAG1Q9NWQ8 432 aa28.76■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MYH3P11055 1940 aa28.76■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RFX7Q2KHR2 1363 aa28.76■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KBTBD3Q8NAB2 608 aa28.75■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TTC14Q96N46 770 aa28.75■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa28.75■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PDE8AO60658 829 aa28.75■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KCNB2Q92953 911 aa28.75■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 AKAP2Q9Y2D5 859 aa28.75■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa28.74■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TCHHQ07283 1943 aa28.74■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ADORA1P30542 326 aa28.74■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 AK2P54819 239 aa28.74■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GORABQ5T7V8 394 aa28.74■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 USP21Q9UK80 565 aa28.74■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CAMTA2O94983 1202 aa28.73■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TPM2P07951 284 aa28.73■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SUSD4Q5VX71 490 aa28.73■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RREB1Q92766 1687 aa28.73■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 METTL24Q5JXM2 366 aa28.73■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa28.73■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 XAGE2Q96GT9 111 aa28.73■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RIC1Q4ADV7 1423 aa28.72■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SLC27A2O14975 620 aa28.72■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TAF5LO75529 589 aa28.72■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CNNM1Q9NRU3 951 aa28.71■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa28.71■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KCNQ4P56696 695 aa28.7■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CCDC158Q5M9N0 1113 aa28.7■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TTC39AQ5SRH9 613 aa28.7■■■□□ 2.19
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa28.7■■■□□ 2.18
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa28.7■■■□□ 2.18
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SH3TC1Q8TE82 1336 aa28.7■■■□□ 2.18
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SLFNL1Q499Z3 407 aa28.69■■■□□ 2.18
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RUFY3Q7L099 469 aa28.69■■■□□ 2.18
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PTF1AQ7RTS3 328 aa28.69■■■□□ 2.18
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TM6SF1Q9BZW5 370 aa28.69■■■□□ 2.18
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GDPD2Q9HCC8 539 aa28.69■■■□□ 2.18
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa28.69■■■□□ 2.18
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PDRG1Q9NUG6 133 aa28.69■■■□□ 2.18
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RRP9O43818 475 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP28.69■■■□□ 2.18
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RNF20Q5VTR2 975 aa28.69■■■□□ 2.18
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 USP48Q86UV5 1035 aa28.69■■■□□ 2.18
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa28.68■■■□□ 2.18
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ATP2B3Q16720 1220 aa28.68■■■□□ 2.18
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TMEM87AQ8NBN3 555 aa28.68■■■□□ 2.18
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LINC00116Q8NCU8 138 aa28.68■■■□□ 2.18
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP28.68■■■□□ 2.18
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TSPY26PQ9H489 355 aa28.67■■■□□ 2.18
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa28.67■■■□□ 2.18
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RNF214Q8ND24 703 aa28.67■■■□□ 2.18
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa28.67■■■□□ 2.18
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TAF6LQ9Y6J9 622 aa28.67■■■□□ 2.18
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP28.66■■■□□ 2.18
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM182BQ5T319 152 aa28.66■■■□□ 2.18
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 VPS53Q5VIR6 699 aa28.66■■■□□ 2.18
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PARP10Q53GL7 1025 aa28.65■■■□□ 2.18
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PSMA5P28066 241 aa28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms