RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575194.5

SPNS3-204, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SPNS3, Length 1,721 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-204ENST00000575194 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
SPNS3-204ENST00000575194 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.48■■□□□ 1.19
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SPNS3-204ENST00000575194 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
SPNS3-204ENST00000575194 TM6SF1Q9BZW5 370 aa22.48■■□□□ 1.19
SPNS3-204ENST00000575194 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.48■■□□□ 1.19
SPNS3-204ENST00000575194 NARFQ9UHQ1 456 aa22.48■■□□□ 1.19
SPNS3-204ENST00000575194 AKAP2Q9Y2D5 859 aa22.48■■□□□ 1.19
SPNS3-204ENST00000575194 PTH1RQ03431 593 aa22.48■■□□□ 1.19
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SPNS3-204ENST00000575194 KCNJ4P48050 445 aa22.47■■□□□ 1.19
SPNS3-204ENST00000575194 RNF20Q5VTR2 975 aa22.47■■□□□ 1.19
SPNS3-204ENST00000575194 FAM89AQ96GI7 184 aa22.47■■□□□ 1.19
SPNS3-204ENST00000575194 NEUROD6Q96NK8 337 aa22.47■■□□□ 1.19
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SPNS3-204ENST00000575194 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa22.47■■□□□ 1.19
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SPNS3-204ENST00000575194 A0A0D9SFI3 127 aa22.46■■□□□ 1.19
SPNS3-204ENST00000575194 PHF14O94880 888 aa22.46■■□□□ 1.19
SPNS3-204ENST00000575194 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
SPNS3-204ENST00000575194 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
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SPNS3-204ENST00000575194 MAP4K1Q92918 833 aa22.46■■□□□ 1.19
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SPNS3-204ENST00000575194 SLC15A2Q16348 729 aa22.45■■□□□ 1.19
SPNS3-204ENST00000575194 LRRC24Q50LG9 513 aa22.45■■□□□ 1.19
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SPNS3-204ENST00000575194 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.19
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SPNS3-204ENST00000575194 NECTIN1Q15223 517 aa22.45■■□□□ 1.18
SPNS3-204ENST00000575194 RASEFQ8IZ41 740 aa22.45■■□□□ 1.18
SPNS3-204ENST00000575194 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
SPNS3-204ENST00000575194 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.45■■□□□ 1.18
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SPNS3-204ENST00000575194 CTSWP56202 376 aa22.44■■□□□ 1.18
SPNS3-204ENST00000575194 KBTBD3Q8NAB2 608 aa22.44■■□□□ 1.18
SPNS3-204ENST00000575194 TTC14Q96N46 770 aa22.44■■□□□ 1.18
SPNS3-204ENST00000575194 HMG20BQ9P0W2 317 aa22.44■■□□□ 1.18
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SPNS3-204ENST00000575194 PSMA5P28066 241 aa22.43■■□□□ 1.18
SPNS3-204ENST00000575194 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.43■■□□□ 1.18
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SPNS3-204ENST00000575194 ZPR1O75312 459 aa22.43■■□□□ 1.18
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SPNS3-204ENST00000575194 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.43■■□□□ 1.18
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SPNS3-204ENST00000575194 STK32BQ9NY57 414 aa22.43■■□□□ 1.18
SPNS3-204ENST00000575194 ABCC12Q96J65 1359 aa22.42■■□□□ 1.18
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SPNS3-204ENST00000575194 VPS53Q5VIR6 699 aa22.42■■□□□ 1.18
SPNS3-204ENST00000575194 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
SPNS3-204ENST00000575194 FLAD1Q8NFF5 587 aa22.42■■□□□ 1.18
SPNS3-204ENST00000575194 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa22.42■■□□□ 1.18
SPNS3-204ENST00000575194 QSER1Q2KHR3 1735 aa22.42■■□□□ 1.18
SPNS3-204ENST00000575194 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa22.41■■□□□ 1.18
SPNS3-204ENST00000575194 BAG4O95429 457 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
SPNS3-204ENST00000575194 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
SPNS3-204ENST00000575194 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa22.41■■□□□ 1.18
SPNS3-204ENST00000575194 LAMB2P55268 1798 aa22.41■■□□□ 1.18
SPNS3-204ENST00000575194 LRP5O75197 1615 aa22.41■■□□□ 1.18
SPNS3-204ENST00000575194 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
SPNS3-204ENST00000575194 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
SPNS3-204ENST00000575194 TIMM10P62072 90 aa22.4■■□□□ 1.18
SPNS3-204ENST00000575194 CCDC158Q5M9N0 1113 aa22.4■■□□□ 1.18
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SPNS3-204ENST00000575194 TTLL11Q8NHH1 800 aa22.4■■□□□ 1.18
SPNS3-204ENST00000575194 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
SPNS3-204ENST00000575194 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.4■■□□□ 1.18
SPNS3-204ENST00000575194 RIC1Q4ADV7 1423 aa22.4■■□□□ 1.18
SPNS3-204ENST00000575194 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
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SPNS3-204ENST00000575194 AK2P54819 239 aa22.4■■□□□ 1.18
SPNS3-204ENST00000575194 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.4■■□□□ 1.18
SPNS3-204ENST00000575194 PARP10Q53GL7 1025 aa22.4■■□□□ 1.18
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SPNS3-204ENST00000575194 PDRG1Q9NUG6 133 aa22.4■■□□□ 1.18
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SPNS3-204ENST00000575194 ITGA6P23229 1130 aa22.39■■□□□ 1.17
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SPNS3-204ENST00000575194 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
SPNS3-204ENST00000575194 RUFY3Q7L099 469 aa22.39■■□□□ 1.17
SPNS3-204ENST00000575194 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
SPNS3-204ENST00000575194 HELLSQ9NRZ9 838 aa22.39■■□□□ 1.17
SPNS3-204ENST00000575194 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
SPNS3-204ENST00000575194 GOLIM4O00461 696 aa22.38■■□□□ 1.17
SPNS3-204ENST00000575194 GYS1P13807 737 aa22.38■■□□□ 1.17
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