RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574042.2

TRIM16L-211, Transcript of tripartite motif containing 16 like, humanhuman

TSL 3

Gene TRIM16L, Length 791 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16L-211ENST00000574042 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 CYP4F22Q6NT55 531 aa14.65□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 CDC37L1Q7L3B6 337 aa14.65□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 SAPCD2Q86UD0 394 aa14.65□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 STK31Q9BXU1 1019 aa14.65□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 SEC31BQ9NQW1 1179 aa14.65□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 GGA1Q9UJY5 639 aa14.65□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa14.65□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 SCN9AQ15858 1988 aa14.65□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 IL16Q14005 1332 aa14.65□□□□□ -0.06
TRIM16L-211ENST00000574042 SHTN1A0MZ66 631 aa14.64□□□□□ -0.07
TRIM16L-211ENST00000574042 RIMBP2O15034 1052 aa14.64□□□□□ -0.07
TRIM16L-211ENST00000574042 LBX1P52954 281 aa14.64□□□□□ -0.07
TRIM16L-211ENST00000574042 CTSWP56202 376 aa14.64□□□□□ -0.07
TRIM16L-211ENST00000574042 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TRIM16L-211ENST00000574042 TSPYL6Q8N831 410 aa14.64□□□□□ -0.07
TRIM16L-211ENST00000574042 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TRIM16L-211ENST00000574042 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa14.64□□□□□ -0.07
TRIM16L-211ENST00000574042 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TRIM16L-211ENST00000574042 XDHP47989 1333 aa14.64□□□□□ -0.07
TRIM16L-211ENST00000574042 NEXNQ0ZGT2 675 aa14.63□□□□□ -0.07
TRIM16L-211ENST00000574042 KSR2Q6VAB6 950 aa14.63□□□□□ -0.07
TRIM16L-211ENST00000574042 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa14.63□□□□□ -0.07
TRIM16L-211ENST00000574042 WWC1Q8IX03 1113 aa14.63□□□□□ -0.07
TRIM16L-211ENST00000574042 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TRIM16L-211ENST00000574042 BEGAINQ9BUH8 593 aa14.63□□□□□ -0.07
TRIM16L-211ENST00000574042 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TRIM16L-211ENST00000574042 IGKV5-2P06315 115 aa14.62□□□□□ -0.07
TRIM16L-211ENST00000574042 MAP2K2P36507 400 aa14.62□□□□□ -0.07
TRIM16L-211ENST00000574042 GRM1Q13255 1194 aa14.62□□□□□ -0.07
TRIM16L-211ENST00000574042 DOK7Q18PE1 504 aa14.62□□□□□ -0.07
TRIM16L-211ENST00000574042 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TRIM16L-211ENST00000574042 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TRIM16L-211ENST00000574042 ZNF408Q9H9D4 720 aa14.62□□□□□ -0.07
TRIM16L-211ENST00000574042 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TRIM16L-211ENST00000574042 MED23Q9ULK4 1368 aa14.61□□□□□ -0.07
TRIM16L-211ENST00000574042 PI4KAP2A4QPH2 592 aa14.61□□□□□ -0.07
TRIM16L-211ENST00000574042 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa14.61□□□□□ -0.07
TRIM16L-211ENST00000574042 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TRIM16L-211ENST00000574042 CCDC184Q52MB2 194 aa14.61□□□□□ -0.07
TRIM16L-211ENST00000574042 SAMD7Q7Z3H4 446 aa14.61□□□□□ -0.07
TRIM16L-211ENST00000574042 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa14.61□□□□□ -0.07
TRIM16L-211ENST00000574042 NEURL1BA8MQ27 555 aa14.6□□□□□ -0.07
TRIM16L-211ENST00000574042 G3V3G9 751 aa14.6□□□□□ -0.07
TRIM16L-211ENST00000574042 CA12O43570 354 aa14.6□□□□□ -0.07
TRIM16L-211ENST00000574042 EGFRP00533 1210 aa14.6□□□□□ -0.07
TRIM16L-211ENST00000574042 VIL1P09327 827 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TRIM16L-211ENST00000574042 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TRIM16L-211ENST00000574042 DCAF8Q5TAQ9 597 aa14.6□□□□□ -0.07
TRIM16L-211ENST00000574042 KRT26Q7Z3Y9 468 aa14.6□□□□□ -0.07
TRIM16L-211ENST00000574042 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TRIM16L-211ENST00000574042 FANCIQ9NVI1 1328 aa14.6□□□□□ -0.07
TRIM16L-211ENST00000574042 AOC2O75106 756 aa14.59□□□□□ -0.07
TRIM16L-211ENST00000574042 ATP2B4P23634 1241 aa14.59□□□□□ -0.07
TRIM16L-211ENST00000574042 USP48Q86UV5 1035 aa14.59□□□□□ -0.07
TRIM16L-211ENST00000574042 AGBL3Q8NEM8 1001 aa14.59□□□□□ -0.07
TRIM16L-211ENST00000574042 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
TRIM16L-211ENST00000574042 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
TRIM16L-211ENST00000574042 KCNQ5Q9NR82 932 aa14.59□□□□□ -0.07
TRIM16L-211ENST00000574042 GGA3Q9NZ52 723 aa14.59□□□□□ -0.07
TRIM16L-211ENST00000574042 CACNA1FO60840 1977 aa14.58□□□□□ -0.07
TRIM16L-211ENST00000574042 ADM5C9JUS6 153 aa14.58□□□□□ -0.08
TRIM16L-211ENST00000574042 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
TRIM16L-211ENST00000574042 NOGQ13253 232 aa14.58□□□□□ -0.08
TRIM16L-211ENST00000574042 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
TRIM16L-211ENST00000574042 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
TRIM16L-211ENST00000574042 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa14.58□□□□□ -0.08
TRIM16L-211ENST00000574042 TTLL11Q8NHH1 800 aa14.58□□□□□ -0.08
TRIM16L-211ENST00000574042 GREM2Q9H772 168 aa14.58□□□□□ -0.08
TRIM16L-211ENST00000574042 MRS2Q9HD23 443 aa14.58□□□□□ -0.08
TRIM16L-211ENST00000574042 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
TRIM16L-211ENST00000574042 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa14.57□□□□□ -0.08
TRIM16L-211ENST00000574042 HUNKP57058 714 aa14.57□□□□□ -0.08
TRIM16L-211ENST00000574042 FLIIQ13045 1269 aa14.57□□□□□ -0.08
TRIM16L-211ENST00000574042 PODNQ7Z5L7 613 aa14.57□□□□□ -0.08
TRIM16L-211ENST00000574042 SULF1Q8IWU6 871 aa14.57□□□□□ -0.08
TRIM16L-211ENST00000574042 PLA2G12BQ9BX93 195 aa14.57□□□□□ -0.08
TRIM16L-211ENST00000574042 MYH16Q9H6N6 1097 aa14.57□□□□□ -0.08
TRIM16L-211ENST00000574042 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
TRIM16L-211ENST00000574042 A0A1B0GUL6 1792 aa14.57□□□□□ -0.08
TRIM16L-211ENST00000574042 H7C1W4 665 aa14.56□□□□□ -0.08
TRIM16L-211ENST00000574042 SLC4A2P04920 1241 aa14.56□□□□□ -0.08
TRIM16L-211ENST00000574042 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
TRIM16L-211ENST00000574042 G2E3Q7L622 706 aa14.56□□□□□ -0.08
TRIM16L-211ENST00000574042 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa14.56□□□□□ -0.08
TRIM16L-211ENST00000574042 USP17L3A6NCW0 530 aa14.55□□□□□ -0.08
TRIM16L-211ENST00000574042 USP17L4A6NCW7 530 aa14.55□□□□□ -0.08
TRIM16L-211ENST00000574042 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
TRIM16L-211ENST00000574042 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
TRIM16L-211ENST00000574042 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
TRIM16L-211ENST00000574042 GCKRQ14397 625 aa14.55□□□□□ -0.08
TRIM16L-211ENST00000574042 USP17L1Q7RTZ2 530 aa14.55□□□□□ -0.08
TRIM16L-211ENST00000574042 C2orf69Q8N8R5 385 aa14.55□□□□□ -0.08
TRIM16L-211ENST00000574042 GMLQ99445 158 aa14.55□□□□□ -0.08
TRIM16L-211ENST00000574042 MINPP1Q9UNW1 487 aa14.55□□□□□ -0.08
TRIM16L-211ENST00000574042 MYO3BQ8WXR4 1341 aa14.55□□□□□ -0.08
TRIM16L-211ENST00000574042 ANP32CO43423 234 aa14.54□□□□□ -0.08
TRIM16L-211ENST00000574042 USP17L8P0C7I0 530 aa14.54□□□□□ -0.08
TRIM16L-211ENST00000574042 CCT4P50991 539 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
TRIM16L-211ENST00000574042 FAM161AQ3B820 660 aa14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms