RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 GORABQ5T7V8 394 aa35.21■■■■□ 3.23
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CTDNEP1-208ENST00000573600 VGLL2Q8N8G2 317 aa35.2■■■■□ 3.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 MPHOSPH8Q99549 860 aa35.2■■■■□ 3.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 UBR3Q6ZT12 1888 aa35.2■■■■□ 3.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 PDE8BO95263 885 aa35.2■■■■□ 3.23
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CTDNEP1-208ENST00000573600 IL27Q8NEV9 243 aa35.18■■■■□ 3.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 SEC31BQ9NQW1 1179 aa35.18■■■■□ 3.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 PAG1Q9NWQ8 432 aa35.18■■■■□ 3.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 KBTBD3Q8NAB2 608 aa35.17■■■■□ 3.22
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ANP32EQ9BTT0 268 aa35.17■■■■□ 3.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 PHF14O94880 888 aa35.16■■■■□ 3.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 TPTE2Q6XPS3 522 aa35.16■■■■□ 3.22
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ADORA1P30542 326 aa35.15■■■■□ 3.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM227BQ96M60 508 aa35.15■■■■□ 3.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 ARAP2Q8WZ64 1704 aa35.14■■■■□ 3.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP35.14■■■■□ 3.22
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CTDNEP1-208ENST00000573600 LPIN2Q92539 896 aa35.12■■■■□ 3.21
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP35.12■■■■□ 3.21
CTDNEP1-208ENST00000573600 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa35.12■■■■□ 3.21
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CTDNEP1-208ENST00000573600 PALD1Q9ULE6 856 aa35.12■■■■□ 3.21
CTDNEP1-208ENST00000573600 MED23Q9ULK4 1368 aa35.11■■■■□ 3.21
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CTDNEP1-208ENST00000573600 TXNRD1Q16881 649 aa35.11■■■■□ 3.21
CTDNEP1-208ENST00000573600 CCDC171Q6TFL3 1326 aa35.11■■■■□ 3.21
CTDNEP1-208ENST00000573600 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP35.1■■■■□ 3.21
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CTDNEP1-208ENST00000573600 NLRP3Q96P20 1036 aa35.1■■■■□ 3.21
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa35.08■■■■□ 3.21
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CTDNEP1-208ENST00000573600 SNX14Q9Y5W7 946 aa35.03■■■■□ 3.2
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CTDNEP1-208ENST00000573600 RASEFQ8IZ41 740 aa34.97■■■■□ 3.19
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