RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564172.1

GDE1-203, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GDE1, Length 2,238 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-203ENST00000564172 DBNDD2Q9BQY9 259 aa21.45■■□□□ 1.03
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GDE1-203ENST00000564172 CNNM1Q9NRU3 951 aa21.45■■□□□ 1.03
GDE1-203ENST00000564172 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa21.45■■□□□ 1.03
GDE1-203ENST00000564172 RTL9Q8NET4 1388 aa21.45■■□□□ 1.02
GDE1-203ENST00000564172 TIMM10P62072 90 aa21.45■■□□□ 1.02
GDE1-203ENST00000564172 ZNF827Q17R98 1081 aa21.45■■□□□ 1.02
GDE1-203ENST00000564172 TBC1D32Q96NH3 1257 aa21.45■■□□□ 1.02
GDE1-203ENST00000564172 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
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GDE1-203ENST00000564172 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa21.44■■□□□ 1.02
GDE1-203ENST00000564172 C3orf67Q6ZVT6 689 aa21.44■■□□□ 1.02
GDE1-203ENST00000564172 CNTROBQ8N137 903 aa21.44■■□□□ 1.02
GDE1-203ENST00000564172 ABCC12Q96J65 1359 aa21.44■■□□□ 1.02
GDE1-203ENST00000564172 A0A1B0GUL7 405 aa21.43■■□□□ 1.02
GDE1-203ENST00000564172 COL24A1Q17RW2 1714 aa21.43■■□□□ 1.02
GDE1-203ENST00000564172 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
GDE1-203ENST00000564172 C22orf23Q9BZE7 217 aa21.43■■□□□ 1.02
GDE1-203ENST00000564172 AKAP2Q9Y2D5 859 aa21.43■■□□□ 1.02
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GDE1-203ENST00000564172 CARMIL3Q8ND23 1372 aa21.42■■□□□ 1.02
GDE1-203ENST00000564172 ATP5JP18859 108 aa21.42■■□□□ 1.02
GDE1-203ENST00000564172 CHMLP26374 656 aa21.42■■□□□ 1.02
GDE1-203ENST00000564172 METTL24Q5JXM2 366 aa21.42■■□□□ 1.02
GDE1-203ENST00000564172 BOLA2Q9H3K6 86 aa21.42■■□□□ 1.02
GDE1-203ENST00000564172 ZNF609O15014 1411 aa21.42■■□□□ 1.02
GDE1-203ENST00000564172 RIC1Q4ADV7 1423 aa21.41■■□□□ 1.02
GDE1-203ENST00000564172 NLRP3Q96P20 1036 aa21.41■■□□□ 1.02
GDE1-203ENST00000564172 MPHOSPH8Q99549 860 aa21.41■■□□□ 1.02
GDE1-203ENST00000564172 CCDC24Q8N4L8 307 aa21.4■■□□□ 1.02
GDE1-203ENST00000564172 VGLL2Q8N8G2 317 aa21.4■■□□□ 1.02
GDE1-203ENST00000564172 TM4SF1P30408 202 aa21.4■■□□□ 1.02
GDE1-203ENST00000564172 KLHL34Q8N239 644 aa21.4■■□□□ 1.02
GDE1-203ENST00000564172 EVI5LQ96CN4 794 aa21.4■■□□□ 1.02
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GDE1-203ENST00000564172 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
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GDE1-203ENST00000564172 FLAD1Q8NFF5 587 aa21.37■■□□□ 1.01
GDE1-203ENST00000564172 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa21.37■■□□□ 1.01
GDE1-203ENST00000564172 ATP2B3Q16720 1220 aa21.37■■□□□ 1.01
GDE1-203ENST00000564172 XAGE2Q96GT9 111 aa21.37■■□□□ 1.01
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GDE1-203ENST00000564172 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
GDE1-203ENST00000564172 HIP1O00291 1037 aa21.29■■□□□ 1
GDE1-203ENST00000564172 CASZ1Q86V15 1759 aa21.29■■□□□ 1
GDE1-203ENST00000564172 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP21.29■■□□□ 1
GDE1-203ENST00000564172 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
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