RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564105.5

CTU2-204, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CTU2, Length 1,586 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-204ENST00000564105 RPS8P62241 208 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
CTU2-204ENST00000564105 CRAMP1Q96RY5 1269 aa23.7■■□□□ 1.38
CTU2-204ENST00000564105 CNNM1Q9NRU3 951 aa23.7■■□□□ 1.38
CTU2-204ENST00000564105 CIAO1O76071 339 aa23.69■■□□□ 1.38
CTU2-204ENST00000564105 ATG9AQ7Z3C6 839 aa23.69■■□□□ 1.38
CTU2-204ENST00000564105 CHRNA5P30532 468 aa23.69■■□□□ 1.38
CTU2-204ENST00000564105 IL15P40933 162 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
CTU2-204ENST00000564105 ANKRD45Q5TZF3 282 aa23.69■■□□□ 1.38
CTU2-204ENST00000564105 ERC1Q8IUD2 1116 aa23.69■■□□□ 1.38
CTU2-204ENST00000564105 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP23.69■■□□□ 1.38
CTU2-204ENST00000564105 ALDH1B1P30837 517 aa23.68■■□□□ 1.38
CTU2-204ENST00000564105 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa23.68■■□□□ 1.38
CTU2-204ENST00000564105 SASH1O94885 1247 aa23.67■■□□□ 1.38
CTU2-204ENST00000564105 STYK1Q6J9G0 422 aa23.67■■□□□ 1.38
CTU2-204ENST00000564105 RHPN1Q8TCX5 695 aa23.67■■□□□ 1.38
CTU2-204ENST00000564105 KIF1BPQ96EK5 621 aa23.67■■□□□ 1.38
CTU2-204ENST00000564105 LRRCC1Q9C099 1032 aa23.67■■□□□ 1.38
CTU2-204ENST00000564105 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
CTU2-204ENST00000564105 ARAP2Q8WZ64 1704 aa23.66■■□□□ 1.38
CTU2-204ENST00000564105 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
CTU2-204ENST00000564105 TGFB2P61812 414 aa23.65■■□□□ 1.38
CTU2-204ENST00000564105 NUCB1Q02818 461 aa23.65■■□□□ 1.38
CTU2-204ENST00000564105 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa23.65■■□□□ 1.38
CTU2-204ENST00000564105 MYH13Q9UKX3 1938 aa23.65■■□□□ 1.38
CTU2-204ENST00000564105 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
CTU2-204ENST00000564105 GRIN3BO60391 1043 aa23.65■■□□□ 1.38
CTU2-204ENST00000564105 BBOX1O75936 387 aa23.65■■□□□ 1.38
CTU2-204ENST00000564105 DPEP1P16444 411 aa23.65■■□□□ 1.38
CTU2-204ENST00000564105 MROH5Q6ZUA9 1318 aa23.64■■□□□ 1.38
CTU2-204ENST00000564105 A0A0G2JLW4 131 aa23.64■■□□□ 1.37
CTU2-204ENST00000564105 TFCP2Q12800 502 aa23.64■■□□□ 1.37
CTU2-204ENST00000564105 METTL24Q5JXM2 366 aa23.64■■□□□ 1.37
CTU2-204ENST00000564105 CNKSR1Q969H4 720 aa23.64■■□□□ 1.37
CTU2-204ENST00000564105 BCL11AQ9H165 835 aa23.64■■□□□ 1.37
CTU2-204ENST00000564105 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa23.64■■□□□ 1.37
CTU2-204ENST00000564105 CHD1LQ86WJ1 897 aa23.63■■□□□ 1.37
CTU2-204ENST00000564105 LNPKQ9C0E8 428 aa23.63■■□□□ 1.37
CTU2-204ENST00000564105 CEP126Q9P2H0 1117 aa23.63■■□□□ 1.37
CTU2-204ENST00000564105 WWC3Q9ULE0 1092 aa23.63■■□□□ 1.37
CTU2-204ENST00000564105 LTBP1Q14766 1721 aa23.63■■□□□ 1.37
CTU2-204ENST00000564105 AK9Q5TCS8 1911 aa23.62■■□□□ 1.37
CTU2-204ENST00000564105 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
CTU2-204ENST00000564105 TMC4Q7Z404 712 aa23.62■■□□□ 1.37
CTU2-204ENST00000564105 MINPP1Q9UNW1 487 aa23.62■■□□□ 1.37
CTU2-204ENST00000564105 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
CTU2-204ENST00000564105 KCNA3P22001 575 aa23.61■■□□□ 1.37
CTU2-204ENST00000564105 CHRNDQ07001 517 aa23.61■■□□□ 1.37
CTU2-204ENST00000564105 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
CTU2-204ENST00000564105 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa23.6■■□□□ 1.37
CTU2-204ENST00000564105 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
CTU2-204ENST00000564105 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
CTU2-204ENST00000564105 VGLL2Q8N8G2 317 aa23.6■■□□□ 1.37
CTU2-204ENST00000564105 PDE8BO95263 885 aa23.59■■□□□ 1.37
CTU2-204ENST00000564105 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa23.58■■□□□ 1.37
CTU2-204ENST00000564105 TAF5LO75529 589 aa23.58■■□□□ 1.37
CTU2-204ENST00000564105 SP8Q8IXZ3 490 aa23.58■■□□□ 1.37
CTU2-204ENST00000564105 TTLL6Q8N841 843 aa23.58■■□□□ 1.37
CTU2-204ENST00000564105 ANKRD2Q9GZV1 360 aa23.58■■□□□ 1.37
CTU2-204ENST00000564105 GPR108Q9NPR9 543 aa23.58■■□□□ 1.37
CTU2-204ENST00000564105 ZNF609O15014 1411 aa23.58■■□□□ 1.36
CTU2-204ENST00000564105 TNNI3KQ59H18 835 aa23.57■■□□□ 1.36
CTU2-204ENST00000564105 SLC51AQ86UW1 340 aa23.57■■□□□ 1.36
CTU2-204ENST00000564105 PIM2Q9P1W9 311 aa23.57■■□□□ 1.36
CTU2-204ENST00000564105 AKAP2Q9Y2D5 859 aa23.57■■□□□ 1.36
CTU2-204ENST00000564105 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa23.57■■□□□ 1.36
CTU2-204ENST00000564105 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa23.57■■□□□ 1.36
CTU2-204ENST00000564105 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
CTU2-204ENST00000564105 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
CTU2-204ENST00000564105 AACSQ86V21 672 aa23.56■■□□□ 1.36
CTU2-204ENST00000564105 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
CTU2-204ENST00000564105 PDE4AP27815 886 aa23.55■■□□□ 1.36
CTU2-204ENST00000564105 ATP2B3Q16720 1220 aa23.55■■□□□ 1.36
CTU2-204ENST00000564105 SKAP1Q86WV1 359 aa23.55■■□□□ 1.36
CTU2-204ENST00000564105 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa23.55■■□□□ 1.36
CTU2-204ENST00000564105 AKAP11Q9UKA4 1901 aa23.55■■□□□ 1.36
CTU2-204ENST00000564105 A0A1B0GUL7 405 aa23.54■■□□□ 1.36
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CTU2-204ENST00000564105 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
CTU2-204ENST00000564105 NEUROD6Q96NK8 337 aa23.54■■□□□ 1.36
CTU2-204ENST00000564105 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
CTU2-204ENST00000564105 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
CTU2-204ENST00000564105 XDHP47989 1333 aa23.54■■□□□ 1.36
CTU2-204ENST00000564105 TIMM10P62072 90 aa23.53■■□□□ 1.36
CTU2-204ENST00000564105 GPSM2P81274 684 aa23.53■■□□□ 1.36
CTU2-204ENST00000564105 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
CTU2-204ENST00000564105 SNAP23O00161 211 aa23.52■■□□□ 1.36
CTU2-204ENST00000564105 FGFR2P21802 821 aa23.52■■□□□ 1.36
CTU2-204ENST00000564105 OLFM4Q6UX06 510 aa23.52■■□□□ 1.36
CTU2-204ENST00000564105 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
CTU2-204ENST00000564105 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
CTU2-204ENST00000564105 DUOX1Q9NRD9 1551 aa23.52■■□□□ 1.36
CTU2-204ENST00000564105 KCNJ4P48050 445 aa23.52■■□□□ 1.36
CTU2-204ENST00000564105 RGS3P49796 1198 aa23.52■■□□□ 1.36
CTU2-204ENST00000564105 UBE4AQ14139 1066 aa23.52■■□□□ 1.36
CTU2-204ENST00000564105 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
CTU2-204ENST00000564105 C7orf43Q8WVR3 580 aa23.52■■□□□ 1.36
CTU2-204ENST00000564105 LPIN2Q92539 896 aa23.52■■□□□ 1.36
CTU2-204ENST00000564105 C21orf2O43822 256 aa23.51■■□□□ 1.35
CTU2-204ENST00000564105 SLC5A1P13866 664 aa23.51■■□□□ 1.35
CTU2-204ENST00000564105 PODXL2Q9NZ53 605 aa23.51■■□□□ 1.35
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