RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563645.1

GDE1-202, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

TSL 2

Gene GDE1, Length 769 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-202ENST00000563645 PROCP04070 461 aa7.24□□□□□ -1.25
GDE1-202ENST00000563645 CHRNA4P43681 627 aa7.24□□□□□ -1.25
GDE1-202ENST00000563645 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.25
GDE1-202ENST00000563645 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
GDE1-202ENST00000563645 TRAPPC3LQ5T215 181 aa7.24□□□□□ -1.25
GDE1-202ENST00000563645 ZNF438Q7Z4V0 828 aa7.24□□□□□ -1.25
GDE1-202ENST00000563645 CD163Q86VB7 1156 aa7.24□□□□□ -1.25
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GDE1-202ENST00000563645 TMEM63CQ9P1W3 806 aa7.23□□□□□ -1.25
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GDE1-202ENST00000563645 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
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GDE1-202ENST00000563645 PTPRAP18433 802 aa7.12□□□□□ -1.27
GDE1-202ENST00000563645 CDC27P30260 824 aa7.12□□□□□ -1.27
GDE1-202ENST00000563645 DCAF11Q8TEB1 546 aa7.12□□□□□ -1.27
GDE1-202ENST00000563645 DZANK1Q9NVP4 752 aa7.12□□□□□ -1.27
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