RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562866.1

VPS9D1-AS1-202, VPS9D1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS9D1-AS1, Length 1,753 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 AK7Q96M32 723 aa25.47■■□□□ 1.67
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LARGE1O95461 756 aa25.46■■□□□ 1.67
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TAF6LQ9Y6J9 622 aa25.4■■□□□ 1.66
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MTMR6Q9Y217 621 aa25.35■■□□□ 1.65
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PDE8BO95263 885 aa25.34■■□□□ 1.65
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TCEANC2Q96MN5 208 aa25.34■■□□□ 1.65
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PANK2Q9BZ23 570 aa25.34■■□□□ 1.65
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CAMTA2O94983 1202 aa25.33■■□□□ 1.65
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 USP48Q86UV5 1035 aa25.33■■□□□ 1.65
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZAP70P43403 619 aa25.33■■□□□ 1.65
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ITPK1Q13572 414 aa25.33■■□□□ 1.65
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SUSD4Q5VX71 490 aa25.33■■□□□ 1.65
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 Q6ZUG5 572 aa25.33■■□□□ 1.65
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
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