RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
AKAP13-223	ENST00000560957	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		5.79	□□□□□ -1.48
AKAP13-223	ENST00000560957	RBSN	Q9H1K0	784 aa		5.79	□□□□□ -1.48
AKAP13-223	ENST00000560957	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
AKAP13-223	ENST00000560957	PSAP	P07602	524 aa		5.78	□□□□□ -1.48
AKAP13-223	ENST00000560957	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
AKAP13-223	ENST00000560957	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
AKAP13-223	ENST00000560957	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		5.78	□□□□□ -1.48
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		5.78	□□□□□ -1.48
AKAP13-223	ENST00000560957	TM4SF5	O14894	197 aa		5.77	□□□□□ -1.49
AKAP13-223	ENST00000560957	MICAL2	O94851	1124 aa		5.77	□□□□□ -1.49
AKAP13-223	ENST00000560957	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
AKAP13-223	ENST00000560957	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
AKAP13-223	ENST00000560957	KLK14	Q9P0G3	267 aa		5.77	□□□□□ -1.49
AKAP13-223	ENST00000560957	PIM2	Q9P1W9	311 aa		5.77	□□□□□ -1.49
AKAP13-223	ENST00000560957	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
AKAP13-223	ENST00000560957	PRNP	P04156	253 aa		5.76	□□□□□ -1.49
AKAP13-223	ENST00000560957	MSMP	Q1L6U9	139 aa		5.76	□□□□□ -1.49
AKAP13-223	ENST00000560957	BEND4	Q6ZU67	534 aa		5.76	□□□□□ -1.49
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
AKAP13-223	ENST00000560957	FBXL18	Q96ME1	805 aa		5.76	□□□□□ -1.49
AKAP13-223	ENST00000560957	NSUN5	Q96P11	429 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		5.76	□□□□□ -1.49
AKAP13-223	ENST00000560957	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
AKAP13-223	ENST00000560957	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
AKAP13-223	ENST00000560957	WDR64	B1ANS9	1081 aa		5.75	□□□□□ -1.49
AKAP13-223	ENST00000560957	LINC01387	J3KSC0	135 aa		5.75	□□□□□ -1.49
AKAP13-223	ENST00000560957	MMP20	O60882	483 aa		5.75	□□□□□ -1.49
AKAP13-223	ENST00000560957	XYLB	O75191	536 aa		5.75	□□□□□ -1.49
AKAP13-223	ENST00000560957	RASA1	P20936	1047 aa		5.75	□□□□□ -1.49
AKAP13-223	ENST00000560957	IGFBP4	P22692	258 aa		5.75	□□□□□ -1.49
AKAP13-223	ENST00000560957	DGKZ	Q13574	1117 aa		5.75	□□□□□ -1.49
AKAP13-223	ENST00000560957	MCM6	Q14566	821 aa		5.75	□□□□□ -1.49
AKAP13-223	ENST00000560957	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	5.75	□□□□□ -1.49
AKAP13-223	ENST00000560957	FBLN7	Q53RD9	439 aa		5.75	□□□□□ -1.49
AKAP13-223	ENST00000560957	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		5.75	□□□□□ -1.49
AKAP13-223	ENST00000560957	OPLAH	O14841	1288 aa		5.74	□□□□□ -1.49
AKAP13-223	ENST00000560957	ATP9B	O43861	1147 aa		5.74	□□□□□ -1.49
AKAP13-223	ENST00000560957	BMP3	P12645	472 aa		5.74	□□□□□ -1.49
AKAP13-223	ENST00000560957	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
AKAP13-223	ENST00000560957	SEC13	P55735	322 aa		5.74	□□□□□ -1.49
AKAP13-223	ENST00000560957	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		5.74	□□□□□ -1.49
AKAP13-223	ENST00000560957	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		5.74	□□□□□ -1.49
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		5.74	□□□□□ -1.49
AKAP13-223	ENST00000560957	COG6	Q9Y2V7	657 aa		5.74	□□□□□ -1.49
AKAP13-223	ENST00000560957	FOSL1	P15407	271 aa		5.73	□□□□□ -1.49
AKAP13-223	ENST00000560957	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		5.73	□□□□□ -1.49
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		5.73	□□□□□ -1.49
AKAP13-223	ENST00000560957	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		5.73	□□□□□ -1.49
AKAP13-223	ENST00000560957	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		5.73	□□□□□ -1.49
AKAP13-223	ENST00000560957	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		5.73	□□□□□ -1.49
AKAP13-223	ENST00000560957	MYO19	Q96H55	970 aa		5.73	□□□□□ -1.49
AKAP13-223	ENST00000560957	UCN2	Q96RP3	112 aa		5.73	□□□□□ -1.49
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		5.73	□□□□□ -1.49
AKAP13-223	ENST00000560957	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
AKAP13-223	ENST00000560957	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		5.72	□□□□□ -1.49
AKAP13-223	ENST00000560957	WWC1	Q8IX03	1113 aa		5.72	□□□□□ -1.49
AKAP13-223	ENST00000560957	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
AKAP13-223	ENST00000560957	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		5.72	□□□□□ -1.49
AKAP13-223	ENST00000560957	FSCN2	O14926	492 aa		5.71	□□□□□ -1.5
AKAP13-223	ENST00000560957	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
AKAP13-223	ENST00000560957	PREP	P48147	710 aa		5.71	□□□□□ -1.5
AKAP13-223	ENST00000560957	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		5.71	□□□□□ -1.5
AKAP13-223	ENST00000560957	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		5.71	□□□□□ -1.5
AKAP13-223	ENST00000560957	USP20	Q9Y2K6	914 aa		5.71	□□□□□ -1.5
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		5.71	□□□□□ -1.5
AKAP13-223	ENST00000560957	DBX1	A6NMT0	343 aa		5.7	□□□□□ -1.5
AKAP13-223	ENST00000560957	ADAM11	O75078	769 aa		5.7	□□□□□ -1.5
AKAP13-223	ENST00000560957	CDC27	P30260	824 aa		5.7	□□□□□ -1.5
AKAP13-223	ENST00000560957	COL19A1	Q14993	1142 aa		5.7	□□□□□ -1.5
AKAP13-223	ENST00000560957	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		5.7	□□□□□ -1.5
AKAP13-223	ENST00000560957	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		5.7	□□□□□ -1.5
AKAP13-223	ENST00000560957	ATG3	Q9NT62	314 aa		5.7	□□□□□ -1.5
AKAP13-223	ENST00000560957	F13B	P05160	661 aa		5.69	□□□□□ -1.5
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		5.69	□□□□□ -1.5
AKAP13-223	ENST00000560957	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		5.69	□□□□□ -1.5
AKAP13-223	ENST00000560957	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		5.69	□□□□□ -1.5
AKAP13-223	ENST00000560957	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
AKAP13-223	ENST00000560957	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		5.69	□□□□□ -1.5
AKAP13-223	ENST00000560957	HINFP	Q9BQA5	517 aa		5.69	□□□□□ -1.5
AKAP13-223	ENST00000560957	RNF208	Q9H0X6	261 aa		5.69	□□□□□ -1.5
AKAP13-223	ENST00000560957	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		5.68	□□□□□ -1.5
AKAP13-223	ENST00000560957	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
AKAP13-223	ENST00000560957	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	5.68	□□□□□ -1.5
AKAP13-223	ENST00000560957	NLRP13	Q86W25	1043 aa		5.68	□□□□□ -1.5
AKAP13-223	ENST00000560957	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		5.68	□□□□□ -1.5
AKAP13-223	ENST00000560957	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
AKAP13-223	ENST00000560957	COL26A1	Q96A83	441 aa		5.68	□□□□□ -1.5
AKAP13-223	ENST00000560957	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		5.68	□□□□□ -1.5
AKAP13-223	ENST00000560957	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		5.68	□□□□□ -1.5
AKAP13-223	ENST00000560957	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		5.68	□□□□□ -1.5
AKAP13-223	ENST00000560957	FOXO3	O43524	673 aa		5.67	□□□□□ -1.5
AKAP13-223	ENST00000560957	PAPLN	O95428	1278 aa		5.67	□□□□□ -1.5
AKAP13-223	ENST00000560957	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
AKAP13-223	ENST00000560957	ATP11A	P98196	1134 aa		5.67	□□□□□ -1.5
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF648	Q5T619	568 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
AKAP13-223	ENST00000560957	CEP135	Q66GS9	1140 aa		5.67	□□□□□ -1.5
AKAP13-223	ENST00000560957	TREML1	Q86YW5	311 aa		5.67	□□□□□ -1.5
AKAP13-223	ENST00000560957	OR13H1	Q8NG92	308 aa		5.67	□□□□□ -1.5
AKAP13-223	ENST00000560957	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5

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