RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559257.5

USP3-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 5

Gene USP3, Length 2,217 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-211ENST00000559257 MYOCDQ8IZQ8 938 aa9.73□□□□□ -0.85
USP3-211ENST00000559257 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
USP3-211ENST00000559257 CCDC114Q96M63 670 aa9.73□□□□□ -0.85
USP3-211ENST00000559257 VPS18Q9P253 973 aa9.73□□□□□ -0.85
USP3-211ENST00000559257 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
USP3-211ENST00000559257 ANKRD65E5RJM6 399 aa9.72□□□□□ -0.85
USP3-211ENST00000559257 PKP1Q13835 747 aa9.72□□□□□ -0.85
USP3-211ENST00000559257 NAA25Q14CX7 972 aa9.72□□□□□ -0.85
USP3-211ENST00000559257 AKNAD1Q5T1N1 836 aa9.72□□□□□ -0.85
USP3-211ENST00000559257 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
USP3-211ENST00000559257 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa9.72□□□□□ -0.85
USP3-211ENST00000559257 FAM169AQ9Y6X4 670 aa9.72□□□□□ -0.85
USP3-211ENST00000559257 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa9.72□□□□□ -0.85
USP3-211ENST00000559257 TADA3O75528 432 aa9.72□□□□□ -0.85
USP3-211ENST00000559257 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
USP3-211ENST00000559257 HARSP12081 509 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
USP3-211ENST00000559257 ADRA2BP18089 450 aa9.72□□□□□ -0.85
USP3-211ENST00000559257 APOBRQ0VD83 1088 aa9.72□□□□□ -0.85
USP3-211ENST00000559257 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
USP3-211ENST00000559257 KCNB1Q14721 858 aa9.72□□□□□ -0.85
USP3-211ENST00000559257 PKN1Q16512 942 aa9.72□□□□□ -0.85
USP3-211ENST00000559257 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
USP3-211ENST00000559257 FAM81BQ96LP2 452 aa9.72□□□□□ -0.85
USP3-211ENST00000559257 MPHOSPH9Q99550 1183 aa9.72□□□□□ -0.85
USP3-211ENST00000559257 CD248Q9HCU0 757 aa9.72□□□□□ -0.85
USP3-211ENST00000559257 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
USP3-211ENST00000559257 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa9.72□□□□□ -0.85
USP3-211ENST00000559257 USP47Q96K76 1375 aa9.71□□□□□ -0.85
USP3-211ENST00000559257 ERICH2A1L162 156 aa9.71□□□□□ -0.85
USP3-211ENST00000559257 EBAG9O00559 213 aa9.71□□□□□ -0.85
USP3-211ENST00000559257 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.85
USP3-211ENST00000559257 FERP16591 822 aa9.71□□□□□ -0.85
USP3-211ENST00000559257 PLCB4Q15147 1175 aa9.71□□□□□ -0.85
USP3-211ENST00000559257 MTHFD1LQ6UB35 978 aa9.71□□□□□ -0.85
USP3-211ENST00000559257 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.85
USP3-211ENST00000559257 STAG2Q8N3U4 1231 aa9.71□□□□□ -0.85
USP3-211ENST00000559257 FAM71BQ8TC56 605 aa9.71□□□□□ -0.85
USP3-211ENST00000559257 ARHGAP45Q92619 1136 aa9.71□□□□□ -0.85
USP3-211ENST00000559257 BHMTQ93088 406 aa9.71□□□□□ -0.85
USP3-211ENST00000559257 HOOK2Q96ED9 719 aa9.71□□□□□ -0.85
USP3-211ENST00000559257 TMEM165Q9HC07 324 aa9.71□□□□□ -0.85
USP3-211ENST00000559257 MTMR7Q9Y216 660 aa9.71□□□□□ -0.85
USP3-211ENST00000559257 WDR37Q9Y2I8 494 aa9.71□□□□□ -0.85
USP3-211ENST00000559257 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa9.71□□□□□ -0.85
USP3-211ENST00000559257 KIAA0556O60303 1618 aa9.71□□□□□ -0.85
USP3-211ENST00000559257 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.85
USP3-211ENST00000559257 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa9.71□□□□□ -0.86
USP3-211ENST00000559257 NPHP1O15259 732 aa9.71□□□□□ -0.86
USP3-211ENST00000559257 CHGAP10645 457 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
USP3-211ENST00000559257 CYP11B2P19099 503 aa9.71□□□□□ -0.86
USP3-211ENST00000559257 USP4Q13107 963 aa9.71□□□□□ -0.86
USP3-211ENST00000559257 BRD3Q15059 726 aa9.71□□□□□ -0.86
USP3-211ENST00000559257 WDR78Q5VTH9 848 aa9.71□□□□□ -0.86
USP3-211ENST00000559257 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
USP3-211ENST00000559257 PLA2G4DQ86XP0 818 aa9.71□□□□□ -0.86
USP3-211ENST00000559257 CCDC125Q86Z20 511 aa9.71□□□□□ -0.86
USP3-211ENST00000559257 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
USP3-211ENST00000559257 NUP133Q8WUM0 1156 aa9.71□□□□□ -0.86
USP3-211ENST00000559257 CCDC102AQ96A19 550 aa9.71□□□□□ -0.86
USP3-211ENST00000559257 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
USP3-211ENST00000559257 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
USP3-211ENST00000559257 TRAIPQ9BWF2 469 aa9.71□□□□□ -0.86
USP3-211ENST00000559257 ADCY10Q96PN6 1610 aa9.71□□□□□ -0.86
USP3-211ENST00000559257 KIF14Q15058 1648 aa9.7□□□□□ -0.86
USP3-211ENST00000559257 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa9.7□□□□□ -0.86
USP3-211ENST00000559257 CCDC151A5D8V7 595 aa9.7□□□□□ -0.86
USP3-211ENST00000559257 CCDC175P0C221 793 aa9.7□□□□□ -0.86
USP3-211ENST00000559257 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
USP3-211ENST00000559257 YY1P25490 414 aa9.7□□□□□ -0.86
USP3-211ENST00000559257 MPP3Q13368 585 aa9.7□□□□□ -0.86
USP3-211ENST00000559257 SLMAPQ14BN4 828 aa9.7□□□□□ -0.86
USP3-211ENST00000559257 INF2Q27J81 1249 aa9.7□□□□□ -0.86
USP3-211ENST00000559257 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa9.7□□□□□ -0.86
USP3-211ENST00000559257 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
USP3-211ENST00000559257 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
USP3-211ENST00000559257 KCNN1Q92952 543 aa9.7□□□□□ -0.86
USP3-211ENST00000559257 DHRS1Q96LJ7 313 aa9.7□□□□□ -0.86
USP3-211ENST00000559257 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa9.7□□□□□ -0.86
USP3-211ENST00000559257 COG6Q9Y2V7 657 aa9.7□□□□□ -0.86
USP3-211ENST00000559257 MRFAP1Q9Y605 127 aa9.7□□□□□ -0.86
USP3-211ENST00000559257 MAP3K5Q99683 1374 aa9.7□□□□□ -0.86
USP3-211ENST00000559257 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa9.7□□□□□ -0.86
USP3-211ENST00000559257 ENO4A6NNW6 628 aa9.7□□□□□ -0.86
USP3-211ENST00000559257 SLC27A2O14975 620 aa9.7□□□□□ -0.86
USP3-211ENST00000559257 PPFIA3O75145 1194 aa9.7□□□□□ -0.86
USP3-211ENST00000559257 STIP1P31948 543 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
USP3-211ENST00000559257 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
USP3-211ENST00000559257 SMTNP53814 917 aa9.7□□□□□ -0.86
USP3-211ENST00000559257 POSTNQ15063 836 aa9.7□□□□□ -0.86
USP3-211ENST00000559257 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
USP3-211ENST00000559257 CEP85LQ5SZL2 805 aa9.7□□□□□ -0.86
USP3-211ENST00000559257 KIAA0825Q8IV33 1275 aa9.7□□□□□ -0.86
USP3-211ENST00000559257 KCTD17Q8N5Z5 321 aa9.7□□□□□ -0.86
USP3-211ENST00000559257 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
USP3-211ENST00000559257 TRIM4Q9C037 500 aa9.7□□□□□ -0.86
USP3-211ENST00000559257 NACA2Q9H009 215 aa9.7□□□□□ -0.86
USP3-211ENST00000559257 PICK1Q9NRD5 415 aa9.7□□□□□ -0.86
USP3-211ENST00000559257 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
USP3-211ENST00000559257 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
USP3-211ENST00000559257 TTC41PQ6P2S7 1318 aa9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.5 ms