RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557478.5

NEDD1-212, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 5

Gene NEDD1, Length 595 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-212ENST00000557478 POTEJP0CG39 1038 aa22.21■■□□□ 1.15
NEDD1-212ENST00000557478 EPS15P42566 896 aa22.21■■□□□ 1.15
NEDD1-212ENST00000557478 RAD17O75943 681 aa22.2■■□□□ 1.14
NEDD1-212ENST00000557478 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
NEDD1-212ENST00000557478 CSF1RP07333 972 aa22.2■■□□□ 1.14
NEDD1-212ENST00000557478 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
NEDD1-212ENST00000557478 BEND3Q5T5X7 828 aa22.2■■□□□ 1.14
NEDD1-212ENST00000557478 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
NEDD1-212ENST00000557478 MPHOSPH8Q99549 860 aa22.2■■□□□ 1.14
NEDD1-212ENST00000557478 ANKRD2Q9GZV1 360 aa22.2■■□□□ 1.14
NEDD1-212ENST00000557478 SLC51AQ86UW1 340 aa22.19■■□□□ 1.14
NEDD1-212ENST00000557478 GREM2Q9H772 168 aa22.19■■□□□ 1.14
NEDD1-212ENST00000557478 PTPRCP08575 1304 aa22.19■■□□□ 1.14
NEDD1-212ENST00000557478 DUOX1Q9NRD9 1551 aa22.19■■□□□ 1.14
NEDD1-212ENST00000557478 RIMBP2O15034 1052 aa22.18■■□□□ 1.14
NEDD1-212ENST00000557478 ECE2O60344 883 aa22.18■■□□□ 1.14
NEDD1-212ENST00000557478 CASP7P55210 303 aa22.18■■□□□ 1.14
NEDD1-212ENST00000557478 PODNQ7Z5L7 613 aa22.18■■□□□ 1.14
NEDD1-212ENST00000557478 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
NEDD1-212ENST00000557478 LEMD3Q9Y2U8 911 aa22.18■■□□□ 1.14
NEDD1-212ENST00000557478 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa22.17■■□□□ 1.14
NEDD1-212ENST00000557478 YDJCA8MPS7 323 aa22.17■■□□□ 1.14
NEDD1-212ENST00000557478 ITGA6P23229 1130 aa22.17■■□□□ 1.14
NEDD1-212ENST00000557478 SLFN5Q08AF3 891 aa22.17■■□□□ 1.14
NEDD1-212ENST00000557478 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa22.17■■□□□ 1.14
NEDD1-212ENST00000557478 DBNDD1Q9H9R9 158 aa22.17■■□□□ 1.14
NEDD1-212ENST00000557478 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
NEDD1-212ENST00000557478 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
NEDD1-212ENST00000557478 MINPP1Q9UNW1 487 aa22.17■■□□□ 1.14
NEDD1-212ENST00000557478 GRM8O00222 908 aa22.16■■□□□ 1.14
NEDD1-212ENST00000557478 MMP14P50281 582 aa22.16■■□□□ 1.14
NEDD1-212ENST00000557478 HTRA3P83110 453 aa22.16■■□□□ 1.14
NEDD1-212ENST00000557478 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
NEDD1-212ENST00000557478 ALDH1L2Q3SY69 923 aa22.16■■□□□ 1.14
NEDD1-212ENST00000557478 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
NEDD1-212ENST00000557478 PGAP2Q9UHJ9 254 aa22.16■■□□□ 1.14
NEDD1-212ENST00000557478 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa22.15■■□□□ 1.14
NEDD1-212ENST00000557478 PSMD14O00487 310 aa22.15■■□□□ 1.14
NEDD1-212ENST00000557478 MED23Q9ULK4 1368 aa22.14■■□□□ 1.14
NEDD1-212ENST00000557478 F6X3S4 739 aa22.14■■□□□ 1.13
NEDD1-212ENST00000557478 VIL1P09327 827 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
NEDD1-212ENST00000557478 AGBL3Q8NEM8 1001 aa22.14■■□□□ 1.13
NEDD1-212ENST00000557478 CCT4P50991 539 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
NEDD1-212ENST00000557478 DOK7Q18PE1 504 aa22.13■■□□□ 1.13
NEDD1-212ENST00000557478 CCDC57Q2TAC2 916 aa22.13■■□□□ 1.13
NEDD1-212ENST00000557478 SLC4A10Q6U841 1118 aa22.13■■□□□ 1.13
NEDD1-212ENST00000557478 MICALL2Q8IY33 904 aa22.13■■□□□ 1.13
NEDD1-212ENST00000557478 ZNF609O15014 1411 aa22.13■■□□□ 1.13
NEDD1-212ENST00000557478 LTBP1Q14766 1721 aa22.12■■□□□ 1.13
NEDD1-212ENST00000557478 FAM161AQ3B820 660 aa22.12■■□□□ 1.13
NEDD1-212ENST00000557478 COA1Q9GZY4 146 aa22.12■■□□□ 1.13
NEDD1-212ENST00000557478 CDC37L1Q7L3B6 337 aa22.11■■□□□ 1.13
NEDD1-212ENST00000557478 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
NEDD1-212ENST00000557478 TAF1P21675 1872 aa22.11■■□□□ 1.13
NEDD1-212ENST00000557478 CNTNAP1P78357 1384 aa22.11■■□□□ 1.13
NEDD1-212ENST00000557478 USP17L3A6NCW0 530 aa22.1■■□□□ 1.13
NEDD1-212ENST00000557478 USP17L4A6NCW7 530 aa22.1■■□□□ 1.13
NEDD1-212ENST00000557478 USP17L1Q7RTZ2 530 aa22.1■■□□□ 1.13
NEDD1-212ENST00000557478 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
NEDD1-212ENST00000557478 ZNF804BA4D1E1 1349 aa22.09■■□□□ 1.13
NEDD1-212ENST00000557478 MYO3BQ8WXR4 1341 aa22.09■■□□□ 1.13
NEDD1-212ENST00000557478 KCNJ4P48050 445 aa22.09■■□□□ 1.13
NEDD1-212ENST00000557478 FOXO4P98177 505 aa22.09■■□□□ 1.13
NEDD1-212ENST00000557478 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.09■■□□□ 1.13
NEDD1-212ENST00000557478 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
NEDD1-212ENST00000557478 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.09■■□□□ 1.13
NEDD1-212ENST00000557478 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.09■■□□□ 1.13
NEDD1-212ENST00000557478 MYH3P11055 1940 aa22.09■■□□□ 1.13
NEDD1-212ENST00000557478 RASSF10A6NK89 507 aa22.08■■□□□ 1.13
NEDD1-212ENST00000557478 LMBR1LQ6UX01 489 aa22.08■■□□□ 1.13
NEDD1-212ENST00000557478 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
NEDD1-212ENST00000557478 UTYO14607 1347 aa22.07■■□□□ 1.12
NEDD1-212ENST00000557478 DEFB115Q30KQ5 88 aa22.07■■□□□ 1.12
NEDD1-212ENST00000557478 SSH1Q8WYL5 1049 aa22.07■■□□□ 1.12
NEDD1-212ENST00000557478 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
NEDD1-212ENST00000557478 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
NEDD1-212ENST00000557478 ECE1P42892 770 aa22.06■■□□□ 1.12
NEDD1-212ENST00000557478 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
NEDD1-212ENST00000557478 CHRNDQ07001 517 aa22.06■■□□□ 1.12
NEDD1-212ENST00000557478 STRIP1Q5VSL9 837 aa22.06■■□□□ 1.12
NEDD1-212ENST00000557478 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
NEDD1-212ENST00000557478 OGFOD1Q8N543 542 aa22.06■■□□□ 1.12
NEDD1-212ENST00000557478 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
NEDD1-212ENST00000557478 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
NEDD1-212ENST00000557478 PCNTO95613 3336 aa22.05■■□□□ 1.12
NEDD1-212ENST00000557478 COL4A1P02462 1669 aa22.05■■□□□ 1.12
NEDD1-212ENST00000557478 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
NEDD1-212ENST00000557478 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa22.05■■□□□ 1.12
NEDD1-212ENST00000557478 HHIPL1Q96JK4 782 aa22.05■■□□□ 1.12
NEDD1-212ENST00000557478 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.05■■□□□ 1.12
NEDD1-212ENST00000557478 USP17L8P0C7I0 530 aa22.04■■□□□ 1.12
NEDD1-212ENST00000557478 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
NEDD1-212ENST00000557478 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa22.04■■□□□ 1.12
NEDD1-212ENST00000557478 TRPM4Q8TD43 1214 aa22.04■■□□□ 1.12
NEDD1-212ENST00000557478 KCNQ5Q9NR82 932 aa22.03■■□□□ 1.12
NEDD1-212ENST00000557478 CNNM1Q9NRU3 951 aa22.03■■□□□ 1.12
NEDD1-212ENST00000557478 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
NEDD1-212ENST00000557478 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
NEDD1-212ENST00000557478 SAMD7Q7Z3H4 446 aa22.02■■□□□ 1.12
NEDD1-212ENST00000557478 ZNF804AQ7Z570 1209 aa22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms