RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554994.5

ATXN3-231, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 922 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-231	ENST00000554994	TRIM66	O15016	1216 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATXN3-231	ENST00000554994	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
ATXN3-231	ENST00000554994		Q8N3U1	123 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATXN3-231	ENST00000554994	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATXN3-231	ENST00000554994	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
ATXN3-231	ENST00000554994	ACD	Q96AP0	544 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATXN3-231	ENST00000554994	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATXN3-231	ENST00000554994	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
ATXN3-231	ENST00000554994	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATXN3-231	ENST00000554994	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATXN3-231	ENST00000554994	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
ATXN3-231	ENST00000554994	ALS2	Q96Q42	1657 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ATXN3-231	ENST00000554994	IFT172	Q9UG01	1749 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATXN3-231	ENST00000554994	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATXN3-231	ENST00000554994	FURIN	P09958	794 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATXN3-231	ENST00000554994	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
ATXN3-231	ENST00000554994	NR6A1	Q15406	480 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATXN3-231	ENST00000554994	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATXN3-231	ENST00000554994	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATXN3-231	ENST00000554994	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		6.67	□□□□□ -1.34
ATXN3-231	ENST00000554994	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
ATXN3-231	ENST00000554994	ATP7B	P35670	1465 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATXN3-231	ENST00000554994	LRRC37A3	O60309	1634 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATXN3-231	ENST00000554994	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
ATXN3-231	ENST00000554994	PTK2	Q05397	1052 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATXN3-231	ENST00000554994	DBN1	Q16643	649 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATXN3-231	ENST00000554994	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATXN3-231	ENST00000554994	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATXN3-231	ENST00000554994	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATXN3-231	ENST00000554994	ADAM32	Q8TC27	787 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATXN3-231	ENST00000554994	CYLD	Q9NQC7	956 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATXN3-231	ENST00000554994	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		6.66	□□□□□ -1.34
ATXN3-231	ENST00000554994	PAPPA	Q13219	1627 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ATXN3-231	ENST00000554994	ERVH48-1	M5A8F1	160 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ATXN3-231	ENST00000554994	MX2	P20592	715 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ATXN3-231	ENST00000554994	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	6.65	□□□□□ -1.34
ATXN3-231	ENST00000554994	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
ATXN3-231	ENST00000554994	KDF1	Q8NAX2	398 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
ATXN3-231	ENST00000554994	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ATXN3-231	ENST00000554994	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ATXN3-231	ENST00000554994	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		6.65	□□□□□ -1.34
ATXN3-231	ENST00000554994	PCNT	O95613	3336 aa		6.65	□□□□□ -1.35
ATXN3-231	ENST00000554994	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		6.65	□□□□□ -1.35
ATXN3-231	ENST00000554994	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.35
ATXN3-231	ENST00000554994	MEN1	O00255	615 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ATXN3-231	ENST00000554994	LILRA1	O75019	489 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ATXN3-231	ENST00000554994	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
ATXN3-231	ENST00000554994	DDB1	Q16531	1140 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ATXN3-231	ENST00000554994	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ATXN3-231	ENST00000554994	MSL1	Q68DK7	614 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ATXN3-231	ENST00000554994	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
ATXN3-231	ENST00000554994	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ATXN3-231	ENST00000554994	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ATXN3-231	ENST00000554994	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		6.64	□□□□□ -1.35
ATXN3-231	ENST00000554994	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
ATXN3-231	ENST00000554994	KRBA1	A5PL33	1030 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ATXN3-231	ENST00000554994	SNRPN	P63162	240 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
ATXN3-231	ENST00000554994	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ATXN3-231	ENST00000554994	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
ATXN3-231	ENST00000554994	GMCL1	Q96IK5	515 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ATXN3-231	ENST00000554994	RRAGC	Q9HB90	399 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ATXN3-231	ENST00000554994	POGK	Q9P215	609 aa		6.63	□□□□□ -1.35
ATXN3-231	ENST00000554994	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
ATXN3-231	ENST00000554994	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ATXN3-231	ENST00000554994	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ATXN3-231	ENST00000554994		H7C1W4	665 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ATXN3-231	ENST00000554994	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
ATXN3-231	ENST00000554994	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
ATXN3-231	ENST00000554994	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ATXN3-231	ENST00000554994	AK7	Q96M32	723 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ATXN3-231	ENST00000554994	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ATXN3-231	ENST00000554994	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		6.62	□□□□□ -1.35
ATXN3-231	ENST00000554994	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
ATXN3-231	ENST00000554994	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ATXN3-231	ENST00000554994	USP19	O94966	1318 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ATXN3-231	ENST00000554994	FOXN1	O15353	648 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ATXN3-231	ENST00000554994	KCNQ4	P56696	695 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ATXN3-231	ENST00000554994	POU4F2	Q12837	409 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ATXN3-231	ENST00000554994	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ATXN3-231	ENST00000554994	ABHD8	Q96I13	439 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ATXN3-231	ENST00000554994	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
ATXN3-231	ENST00000554994	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ATXN3-231	ENST00000554994	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		6.61	□□□□□ -1.35
ATXN3-231	ENST00000554994	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
ATXN3-231	ENST00000554994	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ATXN3-231	ENST00000554994	OIP5	O43482	229 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ATXN3-231	ENST00000554994	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ATXN3-231	ENST00000554994	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ATXN3-231	ENST00000554994	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ATXN3-231	ENST00000554994	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ATXN3-231	ENST00000554994	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
ATXN3-231	ENST00000554994	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		6.6	□□□□□ -1.35
ATXN3-231	ENST00000554994	CRB1	P82279	1406 aa		6.59	□□□□□ -1.35
ATXN3-231	ENST00000554994	AKAP12	Q02952	1782 aa		6.59	□□□□□ -1.35
ATXN3-231	ENST00000554994	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		6.59	□□□□□ -1.35
ATXN3-231	ENST00000554994	TONSL	Q96HA7	1378 aa		6.59	□□□□□ -1.35
ATXN3-231	ENST00000554994	ABCC11	Q96J66	1382 aa		6.59	□□□□□ -1.35
ATXN3-231	ENST00000554994	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		6.59	□□□□□ -1.35
ATXN3-231	ENST00000554994	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		6.59	□□□□□ -1.35
ATXN3-231	ENST00000554994	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		6.59	□□□□□ -1.35

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