RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552253.1

PTPRB-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 2,373 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-211ENST00000552253 KRT85P78386 507 aa7.03□□□□□ -1.28
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PTPRB-211ENST00000552253 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP7.03□□□□□ -1.28
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PTPRB-211ENST00000552253 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 GTF3C6Q969F1 213 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRB-211ENST00000552253 NEK1Q96PY6 1258 aa7.03□□□□□ -1.28
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PTPRB-211ENST00000552253 CHRNA2Q15822 529 aa7.01□□□□□ -1.29
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PTPRB-211ENST00000552253 PALLDQ8WX93 1383 aa7.01□□□□□ -1.29
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PTPRB-211ENST00000552253 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRB-211ENST00000552253 TNMDQ9H2S6 317 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRB-211ENST00000552253 PAG1Q9NWQ8 432 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRB-211ENST00000552253 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRB-211ENST00000552253 TNS3Q68CZ2 1445 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRB-211ENST00000552253 NWD2Q9ULI1 1742 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRB-211ENST00000552253 EYA2O00167 538 aa6.98□□□□□ -1.29
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