RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa7.27□□□□□ -1.25
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PTPRB-210ENST00000551525 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-210ENST00000551525 USP25Q9UHP3 1055 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRB-210ENST00000551525 AGLP35573 1532 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRB-210ENST00000551525 GNPATO15228 680 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRB-210ENST00000551525 MAP7D1Q3KQU3 841 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRB-210ENST00000551525 LONRF3Q496Y0 759 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRB-210ENST00000551525 DUSP27Q5VZP5 1158 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRB-210ENST00000551525 CEP135Q66GS9 1140 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRB-210ENST00000551525 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRB-210ENST00000551525 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRB-210ENST00000551525 WASF1Q92558 559 aa7.23□□□□□ -1.25
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