RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546969.1

CASP9-211, Transcript of caspase 9, humanhuman

TSL 2

Gene CASP9, Length 569 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9-211ENST00000546969 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CASP9-211ENST00000546969 GCKRQ14397 625 aa21.52■■□□□ 1.04
CASP9-211ENST00000546969 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CASP9-211ENST00000546969 RPS12P25398 132 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
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CASP9-211ENST00000546969 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
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CASP9-211ENST00000546969 GREM2Q9H772 168 aa21.49■■□□□ 1.03
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CASP9-211ENST00000546969 RTL9Q8NET4 1388 aa21.48■■□□□ 1.03
CASP9-211ENST00000546969 DEFB115Q30KQ5 88 aa21.48■■□□□ 1.03
CASP9-211ENST00000546969 MICALL2Q8IY33 904 aa21.48■■□□□ 1.03
CASP9-211ENST00000546969 PLA2G12BQ9BX93 195 aa21.48■■□□□ 1.03
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CASP9-211ENST00000546969 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
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CASP9-211ENST00000546969 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
CASP9-211ENST00000546969 ANKRD2Q9GZV1 360 aa21.46■■□□□ 1.03
CASP9-211ENST00000546969 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
CASP9-211ENST00000546969 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
CASP9-211ENST00000546969 LTBP1Q14766 1721 aa21.46■■□□□ 1.03
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CASP9-211ENST00000546969 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa21.44■■□□□ 1.02
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CASP9-211ENST00000546969 KCNJ4P48050 445 aa21.44■■□□□ 1.02
CASP9-211ENST00000546969 PODNQ7Z5L7 613 aa21.44■■□□□ 1.02
CASP9-211ENST00000546969 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
CASP9-211ENST00000546969 LEMD3Q9Y2U8 911 aa21.44■■□□□ 1.02
CASP9-211ENST00000546969 CHMP3Q9Y3E7 222 aa21.44■■□□□ 1.02
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CASP9-211ENST00000546969 SLC4A10Q6U841 1118 aa21.43■■□□□ 1.02
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CASP9-211ENST00000546969 ALDH1L1O75891 902 aa21.42■■□□□ 1.02
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CASP9-211ENST00000546969 CCDC57Q2TAC2 916 aa21.4■■□□□ 1.02
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CASP9-211ENST00000546969 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
CASP9-211ENST00000546969 KCNQ5Q9NR82 932 aa21.4■■□□□ 1.02
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CASP9-211ENST00000546969 ZNF408Q9H9D4 720 aa21.39■■□□□ 1.01
CASP9-211ENST00000546969 COL4A1P02462 1669 aa21.39■■□□□ 1.01
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CASP9-211ENST00000546969 ZNF804BA4D1E1 1349 aa21.37■■□□□ 1.01
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CASP9-211ENST00000546969 LMBR1LQ6UX01 489 aa21.36■■□□□ 1.01
CASP9-211ENST00000546969 SULF1Q8IWU6 871 aa21.36■■□□□ 1.01
CASP9-211ENST00000546969 MYO3BQ8WXR4 1341 aa21.35■■□□□ 1.01
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