RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546048.5

MDM2-234, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 5

Gene MDM2, Length 363 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-234	ENST00000546048		Q6ZNB5	142 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MDM2-234	ENST00000546048	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MDM2-234	ENST00000546048	HLA-C	Q95604	372 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MDM2-234	ENST00000546048	RUNDC1	Q96C34	613 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MDM2-234	ENST00000546048	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MDM2-234	ENST00000546048	NARF	Q9UHQ1	456 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MDM2-234	ENST00000546048	COL15A1	P39059	1388 aa		6.68	□□□□□ -1.34
MDM2-234	ENST00000546048	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MDM2-234	ENST00000546048	STARD3NL	O95772	234 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MDM2-234	ENST00000546048	ANXA1	P04083	346 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MDM2-234	ENST00000546048	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
MDM2-234	ENST00000546048	DPEP1	P16444	411 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MDM2-234	ENST00000546048	CLCN1	P35523	988 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MDM2-234	ENST00000546048	SLC19A1	P41440	591 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MDM2-234	ENST00000546048	HLF	Q16534	295 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MDM2-234	ENST00000546048	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MDM2-234	ENST00000546048	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MDM2-234	ENST00000546048	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MDM2-234	ENST00000546048	REPIN1	Q9BWE0	567 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
MDM2-234	ENST00000546048	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
MDM2-234	ENST00000546048	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
MDM2-234	ENST00000546048	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MDM2-234	ENST00000546048	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MDM2-234	ENST00000546048	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MDM2-234	ENST00000546048	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		6.67	□□□□□ -1.34
MDM2-234	ENST00000546048	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
MDM2-234	ENST00000546048	CHL1	O00533	1208 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MDM2-234	ENST00000546048	LCE2B	O14633	110 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MDM2-234	ENST00000546048	KDM4A	O75164	1064 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MDM2-234	ENST00000546048	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
MDM2-234	ENST00000546048	ZNF853	P0CG23	659 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MDM2-234	ENST00000546048	CHRNA5	P30532	468 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MDM2-234	ENST00000546048	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	6.66	□□□□□ -1.34
MDM2-234	ENST00000546048	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MDM2-234	ENST00000546048	SLC51A	Q86UW1	340 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MDM2-234	ENST00000546048	NGEF	Q8N5V2	710 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MDM2-234	ENST00000546048	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
MDM2-234	ENST00000546048	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
MDM2-234	ENST00000546048	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MDM2-234	ENST00000546048	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MDM2-234	ENST00000546048	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		6.66	□□□□□ -1.34
MDM2-234	ENST00000546048	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
MDM2-234	ENST00000546048	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
MDM2-234	ENST00000546048	SERPINB2	P05120	415 aa		6.65	□□□□□ -1.34
MDM2-234	ENST00000546048	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
MDM2-234	ENST00000546048	LAPTM4A	Q15012	233 aa		6.65	□□□□□ -1.34
MDM2-234	ENST00000546048	GPR162	Q16538	588 aa		6.65	□□□□□ -1.34
MDM2-234	ENST00000546048	SPRYD7	Q5W111	196 aa		6.65	□□□□□ -1.34
MDM2-234	ENST00000546048	BRICD5	Q6PL45	260 aa		6.65	□□□□□ -1.34
MDM2-234	ENST00000546048	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		6.65	□□□□□ -1.34
MDM2-234	ENST00000546048	ZNF428	Q96B54	188 aa		6.65	□□□□□ -1.34
MDM2-234	ENST00000546048	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
MDM2-234	ENST00000546048	MRS2	Q9HD23	443 aa		6.65	□□□□□ -1.34
MDM2-234	ENST00000546048	MBIP	Q9NS73	344 aa		6.65	□□□□□ -1.34
MDM2-234	ENST00000546048	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		6.65	□□□□□ -1.34
MDM2-234	ENST00000546048	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
MDM2-234	ENST00000546048	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		6.65	□□□□□ -1.34
MDM2-234	ENST00000546048	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		6.65	□□□□□ -1.35
MDM2-234	ENST00000546048	HOXA2	O43364	376 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MDM2-234	ENST00000546048	ANP32C	O43423	234 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MDM2-234	ENST00000546048	MYL6B	P14649	208 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MDM2-234	ENST00000546048	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
MDM2-234	ENST00000546048	PRELP	P51888	382 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MDM2-234	ENST00000546048	GUCA2A	Q02747	115 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MDM2-234	ENST00000546048	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MDM2-234	ENST00000546048	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
MDM2-234	ENST00000546048	TSPYL6	Q8N831	410 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MDM2-234	ENST00000546048	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MDM2-234	ENST00000546048	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
MDM2-234	ENST00000546048	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
MDM2-234	ENST00000546048	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
MDM2-234	ENST00000546048	C4A	P0C0L4	1744 aa		6.64	□□□□□ -1.35
MDM2-234	ENST00000546048	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
MDM2-234	ENST00000546048	YY1	P25490	414 aa		6.63	□□□□□ -1.35
MDM2-234	ENST00000546048	MSS51	Q4VC12	460 aa		6.63	□□□□□ -1.35
MDM2-234	ENST00000546048	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		6.63	□□□□□ -1.35
MDM2-234	ENST00000546048	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
MDM2-234	ENST00000546048	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
MDM2-234	ENST00000546048	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		6.62	□□□□□ -1.35
MDM2-234	ENST00000546048		A0A087WZG4	1122 aa		6.62	□□□□□ -1.35
MDM2-234	ENST00000546048	FAM177B	A6PVY3	158 aa		6.62	□□□□□ -1.35
MDM2-234	ENST00000546048	NEFM	P07197	916 aa		6.62	□□□□□ -1.35
MDM2-234	ENST00000546048	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
MDM2-234	ENST00000546048	TGFB2	P61812	414 aa		6.62	□□□□□ -1.35
MDM2-234	ENST00000546048	USP46	P62068	366 aa		6.62	□□□□□ -1.35
MDM2-234	ENST00000546048	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
MDM2-234	ENST00000546048	AMHR2	Q16671	573 aa		6.62	□□□□□ -1.35
MDM2-234	ENST00000546048	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		6.62	□□□□□ -1.35
MDM2-234	ENST00000546048	WWC1	Q8IX03	1113 aa		6.62	□□□□□ -1.35
MDM2-234	ENST00000546048	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		6.62	□□□□□ -1.35
MDM2-234	ENST00000546048	SYNE4	Q8N205	404 aa		6.62	□□□□□ -1.35
MDM2-234	ENST00000546048	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		6.62	□□□□□ -1.35
MDM2-234	ENST00000546048	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		6.62	□□□□□ -1.35
MDM2-234	ENST00000546048	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		6.62	□□□□□ -1.35
MDM2-234	ENST00000546048	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
MDM2-234	ENST00000546048	GPT	P24298	496 aa		6.61	□□□□□ -1.35
MDM2-234	ENST00000546048		Q3C1V9	767 aa		6.61	□□□□□ -1.35
MDM2-234	ENST00000546048	SUSD4	Q5VX71	490 aa		6.61	□□□□□ -1.35
MDM2-234	ENST00000546048	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		6.61	□□□□□ -1.35
MDM2-234	ENST00000546048	OLFM4	Q6UX06	510 aa		6.61	□□□□□ -1.35

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