RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-222	ENST00000532751	TRIM27	P14373	513 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PTPRK-222	ENST00000532751	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PTPRK-222	ENST00000532751	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PTPRK-222	ENST00000532751	RRAGC	Q9HB90	399 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PTPRK-222	ENST00000532751	POLL	Q9UGP5	575 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PTPRK-222	ENST00000532751	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PTPRK-222	ENST00000532751	UFL1	O94874	794 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PTPRK-222	ENST00000532751	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
PTPRK-222	ENST00000532751	KAZALD1	Q96I82	304 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PTPRK-222	ENST00000532751	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
PTPRK-222	ENST00000532751	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PTPRK-222	ENST00000532751	KIF3C	O14782	793 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PTPRK-222	ENST00000532751	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
PTPRK-222	ENST00000532751	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
PTPRK-222	ENST00000532751	ATP2B4	P23634	1241 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PTPRK-222	ENST00000532751	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PTPRK-222	ENST00000532751	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
PTPRK-222	ENST00000532751	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		27.57	■■■□□ 2
PTPRK-222	ENST00000532751	RIMBP2	O15034	1052 aa		27.56	■■■□□ 2
PTPRK-222	ENST00000532751	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
PTPRK-222	ENST00000532751	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
PTPRK-222	ENST00000532751	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		27.56	■■■□□ 2
PTPRK-222	ENST00000532751	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
PTPRK-222	ENST00000532751	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		27.56	■■■□□ 2
PTPRK-222	ENST00000532751	GPC2	Q8N158	579 aa		27.55	■■■□□ 2
PTPRK-222	ENST00000532751	SCN4A	P35499	1836 aa		27.55	■■■□□ 2
PTPRK-222	ENST00000532751	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		27.54	■■■□□ 2
PTPRK-222	ENST00000532751		G3V3G9	751 aa		27.53	■■■□□ 2
PTPRK-222	ENST00000532751	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		27.53	■■■□□ 2
PTPRK-222	ENST00000532751	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
PTPRK-222	ENST00000532751	TNN	Q9UQP3	1299 aa		27.53	■■■□□ 2
PTPRK-222	ENST00000532751	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		27.53	■■■□□ 2
PTPRK-222	ENST00000532751	GNAI3	P08754	354 aa		27.52	■■■□□ 2
PTPRK-222	ENST00000532751	CHRND	Q07001	517 aa		27.52	■■■□□ 2
PTPRK-222	ENST00000532751	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		27.52	■■■□□ 2
PTPRK-222	ENST00000532751	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2
PTPRK-222	ENST00000532751	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2
PTPRK-222	ENST00000532751	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2
PTPRK-222	ENST00000532751	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		27.52	■■■□□ 2
PTPRK-222	ENST00000532751	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		27.52	■■■□□ 2
PTPRK-222	ENST00000532751		A0A1B0GUL6	1792 aa		27.52	■■■□□ 2
PTPRK-222	ENST00000532751	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		27.51	■■□□□ 1.99
PTPRK-222	ENST00000532751	TOMM70	O94826	608 aa		27.5	■■□□□ 1.99
PTPRK-222	ENST00000532751	C1QTNF8	P60827	252 aa		27.5	■■□□□ 1.99
PTPRK-222	ENST00000532751	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	27.5	■■□□□ 1.99
PTPRK-222	ENST00000532751	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	27.5	■■□□□ 1.99
PTPRK-222	ENST00000532751	MEIS3	Q99687	375 aa		27.5	■■□□□ 1.99
PTPRK-222	ENST00000532751	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		27.5	■■□□□ 1.99
PTPRK-222	ENST00000532751	POTEC	B2RU33	542 aa		27.49	■■□□□ 1.99
PTPRK-222	ENST00000532751	KCNJ4	P48050	445 aa		27.49	■■□□□ 1.99
PTPRK-222	ENST00000532751	CXCL9	Q07325	125 aa		27.49	■■□□□ 1.99
PTPRK-222	ENST00000532751	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		27.49	■■□□□ 1.99
PTPRK-222	ENST00000532751	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		27.49	■■□□□ 1.99
PTPRK-222	ENST00000532751	MED23	Q9ULK4	1368 aa		27.48	■■□□□ 1.99
PTPRK-222	ENST00000532751	ECE2	O60344	883 aa		27.48	■■□□□ 1.99
PTPRK-222	ENST00000532751	TNIP1	Q15025	636 aa		27.48	■■□□□ 1.99
PTPRK-222	ENST00000532751	DOK7	Q18PE1	504 aa		27.48	■■□□□ 1.99
PTPRK-222	ENST00000532751	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		27.48	■■□□□ 1.99
PTPRK-222	ENST00000532751	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	27.48	■■□□□ 1.99
PTPRK-222	ENST00000532751	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		27.47	■■□□□ 1.99
PTPRK-222	ENST00000532751	MS4A1	P11836	297 aa		27.47	■■□□□ 1.99
PTPRK-222	ENST00000532751	YDJC	A8MPS7	323 aa		27.46	■■□□□ 1.99
PTPRK-222	ENST00000532751	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	27.46	■■□□□ 1.99
PTPRK-222	ENST00000532751	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	27.46	■■□□□ 1.99
PTPRK-222	ENST00000532751	HACL1	Q9UJ83	578 aa		27.46	■■□□□ 1.99
PTPRK-222	ENST00000532751	RAD17	O75943	681 aa		27.45	■■□□□ 1.98
PTPRK-222	ENST00000532751	TAF5L	O75529	589 aa		27.44	■■□□□ 1.98
PTPRK-222	ENST00000532751	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	27.44	■■□□□ 1.98
PTPRK-222	ENST00000532751	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		27.43	■■□□□ 1.98
PTPRK-222	ENST00000532751	PLIN1	O60240	522 aa		27.43	■■□□□ 1.98
PTPRK-222	ENST00000532751	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		27.43	■■□□□ 1.98
PTPRK-222	ENST00000532751	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	27.43	■■□□□ 1.98
PTPRK-222	ENST00000532751	PSME4	Q14997	1843 aa		27.42	■■□□□ 1.98
PTPRK-222	ENST00000532751	GNAI2	P04899	355 aa		27.42	■■□□□ 1.98
PTPRK-222	ENST00000532751	PODN	Q7Z5L7	613 aa		27.42	■■□□□ 1.98
PTPRK-222	ENST00000532751	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	27.42	■■□□□ 1.98
PTPRK-222	ENST00000532751	SCN9A	Q15858	1988 aa		27.42	■■□□□ 1.98
PTPRK-222	ENST00000532751	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	27.41	■■□□□ 1.98
PTPRK-222	ENST00000532751	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		27.41	■■□□□ 1.98
PTPRK-222	ENST00000532751	PSMD14	O00487	310 aa		27.4	■■□□□ 1.98
PTPRK-222	ENST00000532751	RLBP1	P12271	317 aa		27.4	■■□□□ 1.98
PTPRK-222	ENST00000532751	EPHX2	P34913	555 aa		27.4	■■□□□ 1.98
PTPRK-222	ENST00000532751	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	27.4	■■□□□ 1.98
PTPRK-222	ENST00000532751	SCNN1D	P51172	638 aa		27.4	■■□□□ 1.98
PTPRK-222	ENST00000532751	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		27.4	■■□□□ 1.98
PTPRK-222	ENST00000532751	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		27.4	■■□□□ 1.98
PTPRK-222	ENST00000532751	COA1	Q9GZY4	146 aa		27.4	■■□□□ 1.98
PTPRK-222	ENST00000532751	LRRC24	Q50LG9	513 aa		27.39	■■□□□ 1.98
PTPRK-222	ENST00000532751	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	27.39	■■□□□ 1.98
PTPRK-222	ENST00000532751	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	27.39	■■□□□ 1.98
PTPRK-222	ENST00000532751	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	27.38	■■□□□ 1.97
PTPRK-222	ENST00000532751	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	27.38	■■□□□ 1.97
PTPRK-222	ENST00000532751	FSTL1	Q12841	308 aa		27.38	■■□□□ 1.97
PTPRK-222	ENST00000532751	UBE4A	Q14139	1066 aa		27.38	■■□□□ 1.97
PTPRK-222	ENST00000532751	METTL24	Q5JXM2	366 aa		27.38	■■□□□ 1.97
PTPRK-222	ENST00000532751	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	27.38	■■□□□ 1.97
PTPRK-222	ENST00000532751	FBXO3	Q9UK99	471 aa		27.38	■■□□□ 1.97
PTPRK-222	ENST00000532751	EYA2	O00167	538 aa		27.37	■■□□□ 1.97
PTPRK-222	ENST00000532751	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	27.37	■■□□□ 1.97
PTPRK-222	ENST00000532751	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		27.37	■■□□□ 1.97

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