RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531500.5

RBM25-209, Transcript of RNA binding motif protein 25, human

TSL 3

Gene RBM25, Length 1,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM25-209	ENST00000531500	GGA1	Q9UJY5	639 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RBM25-209	ENST00000531500	XDH	P47989	1333 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM25-209	ENST00000531500	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM25-209	ENST00000531500	SNED1	Q8TER0	1413 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM25-209	ENST00000531500	MYH3	P11055	1940 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM25-209	ENST00000531500	GLTPD2	A6NH11	291 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM25-209	ENST00000531500		G3V3G9	751 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM25-209	ENST00000531500	RIMBP2	O15034	1052 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM25-209	ENST00000531500	UFL1	O94874	794 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM25-209	ENST00000531500	ATP2B4	P23634	1241 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM25-209	ENST00000531500	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM25-209	ENST00000531500	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM25-209	ENST00000531500	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM25-209	ENST00000531500	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RBM25-209	ENST00000531500	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM25-209	ENST00000531500	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM25-209	ENST00000531500	POLL	Q9UGP5	575 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM25-209	ENST00000531500	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RBM25-209	ENST00000531500	SBF1	O95248	1867 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RBM25-209	ENST00000531500	PLIN1	O60240	522 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM25-209	ENST00000531500	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RBM25-209	ENST00000531500	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RBM25-209	ENST00000531500	COL4A1	P02462	1669 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM25-209	ENST00000531500	FZD9	O00144	591 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM25-209	ENST00000531500	GNAI2	P04899	355 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM25-209	ENST00000531500	RLBP1	P12271	317 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM25-209	ENST00000531500	KCNJ4	P48050	445 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM25-209	ENST00000531500	CHRND	Q07001	517 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM25-209	ENST00000531500	PANK1	Q8TE04	598 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM25-209	ENST00000531500	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RBM25-209	ENST00000531500	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RBM25-209	ENST00000531500	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
RBM25-209	ENST00000531500	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RBM25-209	ENST00000531500	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
RBM25-209	ENST00000531500	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
RBM25-209	ENST00000531500	TAF5L	O75529	589 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RBM25-209	ENST00000531500	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
RBM25-209	ENST00000531500	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
RBM25-209	ENST00000531500	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RBM25-209	ENST00000531500	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
RBM25-209	ENST00000531500	RRAGC	Q9HB90	399 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RBM25-209	ENST00000531500	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RBM25-209	ENST00000531500	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		13.86	□□□□□ -0.19
RBM25-209	ENST00000531500	UTRN	P46939	3433 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RBM25-209	ENST00000531500	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RBM25-209	ENST00000531500	DOK7	Q18PE1	504 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RBM25-209	ENST00000531500	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
RBM25-209	ENST00000531500	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RBM25-209	ENST00000531500	COG6	Q9Y2V7	657 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RBM25-209	ENST00000531500	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		13.85	□□□□□ -0.19
RBM25-209	ENST00000531500	SRGAP3	O43295	1099 aa		13.84	□□□□□ -0.19
RBM25-209	ENST00000531500	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
RBM25-209	ENST00000531500	PDE3A	Q14432	1141 aa		13.84	□□□□□ -0.19
RBM25-209	ENST00000531500	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
RBM25-209	ENST00000531500	LRRC24	Q50LG9	513 aa		13.84	□□□□□ -0.19
RBM25-209	ENST00000531500	METTL24	Q5JXM2	366 aa		13.84	□□□□□ -0.19
RBM25-209	ENST00000531500	GPC2	Q8N158	579 aa		13.84	□□□□□ -0.19
RBM25-209	ENST00000531500	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		13.84	□□□□□ -0.19
RBM25-209	ENST00000531500	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		13.84	□□□□□ -0.19
RBM25-209	ENST00000531500	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		13.84	□□□□□ -0.19
RBM25-209	ENST00000531500	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
RBM25-209	ENST00000531500	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
RBM25-209	ENST00000531500	ECE2	O60344	883 aa		13.83	□□□□□ -0.2
RBM25-209	ENST00000531500	RAD17	O75943	681 aa		13.83	□□□□□ -0.2
RBM25-209	ENST00000531500	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
RBM25-209	ENST00000531500	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
RBM25-209	ENST00000531500	CXCL9	Q07325	125 aa		13.83	□□□□□ -0.2
RBM25-209	ENST00000531500	TNIP1	Q15025	636 aa		13.83	□□□□□ -0.2
RBM25-209	ENST00000531500	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		13.83	□□□□□ -0.2
RBM25-209	ENST00000531500	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
RBM25-209	ENST00000531500	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		13.83	□□□□□ -0.2
RBM25-209	ENST00000531500	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		13.83	□□□□□ -0.2
RBM25-209	ENST00000531500	EYA2	O00167	538 aa		13.82	□□□□□ -0.2
RBM25-209	ENST00000531500	MTX1	Q13505	466 aa		13.82	□□□□□ -0.2
RBM25-209	ENST00000531500	SIL1	Q9H173	461 aa		13.82	□□□□□ -0.2
RBM25-209	ENST00000531500	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		13.82	□□□□□ -0.2
RBM25-209	ENST00000531500	FBXO3	Q9UK99	471 aa		13.82	□□□□□ -0.2
RBM25-209	ENST00000531500	SPEF2	Q9C093	1822 aa		13.82	□□□□□ -0.2
RBM25-209	ENST00000531500	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		13.82	□□□□□ -0.2
RBM25-209	ENST00000531500	MED23	Q9ULK4	1368 aa		13.82	□□□□□ -0.2
RBM25-209	ENST00000531500	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		13.81	□□□□□ -0.2
RBM25-209	ENST00000531500	YDJC	A8MPS7	323 aa		13.81	□□□□□ -0.2
RBM25-209	ENST00000531500	SNAP23	O00161	211 aa		13.81	□□□□□ -0.2
RBM25-209	ENST00000531500	PDE8B	O95263	885 aa		13.81	□□□□□ -0.2
RBM25-209	ENST00000531500	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
RBM25-209	ENST00000531500	ATP8B2	P98198	1209 aa		13.81	□□□□□ -0.2
RBM25-209	ENST00000531500	UBE4A	Q14139	1066 aa		13.81	□□□□□ -0.2
RBM25-209	ENST00000531500	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		13.81	□□□□□ -0.2
RBM25-209	ENST00000531500	PODN	Q7Z5L7	613 aa		13.81	□□□□□ -0.2
RBM25-209	ENST00000531500	COA1	Q9GZY4	146 aa		13.81	□□□□□ -0.2
RBM25-209	ENST00000531500	COPRS	Q9NQ92	184 aa		13.81	□□□□□ -0.2
RBM25-209	ENST00000531500	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
RBM25-209	ENST00000531500	COL4A5	P29400	1685 aa		13.81	□□□□□ -0.2
RBM25-209	ENST00000531500	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RBM25-209	ENST00000531500	KIF3C	O14782	793 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RBM25-209	ENST00000531500	CIAO1	O76071	339 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RBM25-209	ENST00000531500	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
RBM25-209	ENST00000531500	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		13.8	□□□□□ -0.2
RBM25-209	ENST00000531500	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
RBM25-209	ENST00000531500	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		13.8	□□□□□ -0.2

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