RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527549.5

TSTA3-206, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 2

Gene TSTA3, Length 575 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-206ENST00000527549 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
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TSTA3-206ENST00000527549 CFAP53Q96M91 514 aa20.49■□□□□ 0.87
TSTA3-206ENST00000527549 LAMB1P07942 1786 aa20.49■□□□□ 0.87
TSTA3-206ENST00000527549 COL4A1P02462 1669 aa20.48■□□□□ 0.87
TSTA3-206ENST00000527549 FKTNO75072 461 aa20.48■□□□□ 0.87
TSTA3-206ENST00000527549 SH3TC1Q8TE82 1336 aa20.48■□□□□ 0.87
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TSTA3-206ENST00000527549 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.87
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TSTA3-206ENST00000527549 SCARF1Q14162 830 aa20.46■□□□□ 0.87
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TSTA3-206ENST00000527549 EYA3Q99504 573 aa20.45■□□□□ 0.86
TSTA3-206ENST00000527549 RIMBP2O15034 1052 aa20.44■□□□□ 0.86
TSTA3-206ENST00000527549 TCIRG1Q13488 830 aa20.44■□□□□ 0.86
TSTA3-206ENST00000527549 DOK7Q18PE1 504 aa20.44■□□□□ 0.86
TSTA3-206ENST00000527549 TBC1D16Q8TBP0 767 aa20.44■□□□□ 0.86
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TSTA3-206ENST00000527549 UBE2Q2LH0YL09 131 aa20.43■□□□□ 0.86
TSTA3-206ENST00000527549 SREBF2Q12772 1141 aa20.43■□□□□ 0.86
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TSTA3-206ENST00000527549 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
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TSTA3-206ENST00000527549 ARMC5Q96C12 935 aa20.41■□□□□ 0.86
TSTA3-206ENST00000527549 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
TSTA3-206ENST00000527549 ALDH1A1P00352 501 aa20.4■□□□□ 0.86
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TSTA3-206ENST00000527549 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
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TSTA3-206ENST00000527549 COPS6Q7L5N1 327 aa20.38■□□□□ 0.85
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TSTA3-206ENST00000527549 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
TSTA3-206ENST00000527549 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
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TSTA3-206ENST00000527549 UFL1O94874 794 aa20.31■□□□□ 0.84
TSTA3-206ENST00000527549 NF2P35240 595 aa20.31■□□□□ 0.84
TSTA3-206ENST00000527549 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
TSTA3-206ENST00000527549 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
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TSTA3-206ENST00000527549 GGA1Q9UJY5 639 aa20.31■□□□□ 0.84
TSTA3-206ENST00000527549 LAMA3Q16787 3333 aa20.3■□□□□ 0.84
TSTA3-206ENST00000527549 USP17L3A6NCW0 530 aa20.3■□□□□ 0.84
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TSTA3-206ENST00000527549 WNT10BO00744 389 aa20.3■□□□□ 0.84
TSTA3-206ENST00000527549 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
TSTA3-206ENST00000527549 MMP14P50281 582 aa20.3■□□□□ 0.84
TSTA3-206ENST00000527549 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
TSTA3-206ENST00000527549 MAP3K11Q16584 847 aa20.3■□□□□ 0.84
TSTA3-206ENST00000527549 USP17L1Q7RTZ2 530 aa20.3■□□□□ 0.84
TSTA3-206ENST00000527549 ARMC9Q7Z3E5 817 aa20.3■□□□□ 0.84
TSTA3-206ENST00000527549 TSPYL4Q9UJ04 414 aa20.3■□□□□ 0.84
TSTA3-206ENST00000527549 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP20.29■□□□□ 0.84
TSTA3-206ENST00000527549 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
TSTA3-206ENST00000527549 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
TSTA3-206ENST00000527549 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
TSTA3-206ENST00000527549 PLBD2Q8NHP8 589 aa20.29■□□□□ 0.84
TSTA3-206ENST00000527549 ZNF333Q96JL9 665 aa20.29■□□□□ 0.84
TSTA3-206ENST00000527549 DLL1O00548 723 aa20.28■□□□□ 0.84
TSTA3-206ENST00000527549 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
TSTA3-206ENST00000527549 UNCXA6NJT0 531 aa20.27■□□□□ 0.84
TSTA3-206ENST00000527549 G3V3G9 751 aa20.27■□□□□ 0.84
TSTA3-206ENST00000527549 CAP1Q01518 475 aa20.27■□□□□ 0.84
TSTA3-206ENST00000527549 DCAF8Q5TAQ9 597 aa20.27■□□□□ 0.84
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