RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522928.1

CLVS1-209, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 464 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CLVS1-209ENST00000522928 FAM129BQ96TA1 746 aa7.15□□□□□ -1.26
CLVS1-209ENST00000522928 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa7.14□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 ITGB2P05107 769 aa7.14□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 CPB1P15086 417 aa7.14□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 MARSP56192 900 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 SIK1P57059 783 aa7.14□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 C8orf34Q49A92 452 aa7.14□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa7.14□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 FAM35AQ86V20 835 aa7.14□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 ACPPP15309 386 aa7.13□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 ALAS2P22557 587 aa7.13□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 AMPD1P23109 780 aa7.13□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 IRS1P35568 1242 aa7.13□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 BAG6P46379 1132 aa7.13□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 KANK3Q6NY19 840 aa7.13□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF438Q7Z4V0 828 aa7.13□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 CEP120Q8N960 986 aa7.13□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 NUDT8Q8WV74 236 aa7.13□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 RRAGCQ9HB90 399 aa7.13□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 SALL4Q9UJQ4 1053 aa7.13□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 NFKBIEO00221 500 aa7.12□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 GPR182O15218 404 aa7.12□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 PSAPP07602 524 aa7.12□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 AAMPQ13685 434 aa7.12□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 TTC9Q92623 222 aa7.12□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa7.12□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa7.12□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa7.12□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 EREGO14944 169 aa7.11□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 USP5P45974 858 aa7.11□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 RBCK1Q9BYM8 510 aa7.11□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 FRRS1LQ9P0K9 344 aa7.11□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 KANSL3Q9P2N6 904 aa7.11□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 BRPF3Q9ULD4 1205 aa7.11□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 MKL2Q9ULH7 1088 aa7.11□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 GNB5O14775 395 aa7.1□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 ATP11AP98196 1134 aa7.1□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 USPL1Q5W0Q7 1092 aa7.1□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 TMC7Q7Z402 723 aa7.1□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 PLD4Q96BZ4 506 aa7.1□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa7.1□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 TM4SF5O14894 197 aa7.09□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 ORC1Q13415 861 aa7.09□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 DSC3Q14574 896 aa7.09□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 PCSK7Q16549 785 aa7.09□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 AEBP1Q8IUX7 1158 aa7.09□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 DCAF5Q96JK2 942 aa7.09□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 HHIPQ96QV1 700 aa7.09□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 CITED4Q96RK1 184 aa7.09□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 PLVAPQ9BX97 442 aa7.09□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 LATS2Q9NRM7 1088 aa7.09□□□□□ -1.27
CLVS1-209ENST00000522928 KRBA1A5PL33 1030 aa7.08□□□□□ -1.28
CLVS1-209ENST00000522928 LILRB5O75023 590 aa7.08□□□□□ -1.28
CLVS1-209ENST00000522928 TRPA1O75762 1119 aa7.08□□□□□ -1.28
CLVS1-209ENST00000522928 PCSK2P16519 638 aa7.08□□□□□ -1.28
CLVS1-209ENST00000522928 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
CLVS1-209ENST00000522928 HYAL2Q12891 473 aa7.08□□□□□ -1.28
CLVS1-209ENST00000522928 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa7.08□□□□□ -1.28
CLVS1-209ENST00000522928 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
CLVS1-209ENST00000522928 RASSF4Q9H2L5 321 aa7.08□□□□□ -1.28
CLVS1-209ENST00000522928 TRIM33Q9UPN9 1127 aa7.08□□□□□ -1.28
CLVS1-209ENST00000522928 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa7.07□□□□□ -1.28
CLVS1-209ENST00000522928 NDUFB5O43674 189 aa7.07□□□□□ -1.28
CLVS1-209ENST00000522928 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
CLVS1-209ENST00000522928 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
CLVS1-209ENST00000522928 CES1P23141 567 aa7.07□□□□□ -1.28
CLVS1-209ENST00000522928 EHHADHQ08426 723 aa7.07□□□□□ -1.28
CLVS1-209ENST00000522928 SNX29Q8TEQ0 813 aa7.07□□□□□ -1.28
CLVS1-209ENST00000522928 DZANK1Q9NVP4 752 aa7.07□□□□□ -1.28
CLVS1-209ENST00000522928 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
CLVS1-209ENST00000522928 DCTN4Q9UJW0 460 aa7.07□□□□□ -1.28
CLVS1-209ENST00000522928 FAM229AH3BQW9 127 aa7.06□□□□□ -1.28
CLVS1-209ENST00000522928 PHACTR2O75167 634 aa7.06□□□□□ -1.28
CLVS1-209ENST00000522928 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
CLVS1-209ENST00000522928 PBX4Q9BYU1 374 aa7.06□□□□□ -1.28
CLVS1-209ENST00000522928 NIF3L1Q9GZT8 377 aa7.06□□□□□ -1.28
CLVS1-209ENST00000522928 PHF20L1A8MW92 1017 aa7.05□□□□□ -1.28
CLVS1-209ENST00000522928 TREHO43280 583 aa7.05□□□□□ -1.28
CLVS1-209ENST00000522928 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CLVS1-209ENST00000522928 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP7.05□□□□□ -1.28
CLVS1-209ENST00000522928 PODNQ7Z5L7 613 aa7.05□□□□□ -1.28
CLVS1-209ENST00000522928 Q8N3U1 123 aa7.05□□□□□ -1.28
CLVS1-209ENST00000522928 MSL1Q68DK7 614 aa7.04□□□□□ -1.28
CLVS1-209ENST00000522928 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
CLVS1-209ENST00000522928 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa7.04□□□□□ -1.28
CLVS1-209ENST00000522928 A0A0A0MRY4 1105 aa7.03□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms