RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521231.1

HOXA-AS3-204, HOXA cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXA-AS3, Length 621 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA-AS3-204ENST00000521231 C8orf58Q8NAV2 365 aa23.72■■□□□ 1.39
HOXA-AS3-204ENST00000521231 EYA3Q99504 573 aa23.72■■□□□ 1.39
HOXA-AS3-204ENST00000521231 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
HOXA-AS3-204ENST00000521231 RPS12P25398 132 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
HOXA-AS3-204ENST00000521231 DOK7Q18PE1 504 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXA-AS3-204ENST00000521231 USP48Q86UV5 1035 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXA-AS3-204ENST00000521231 CCDC191Q8NCU4 936 aa23.71■■□□□ 1.39
HOXA-AS3-204ENST00000521231 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
HOXA-AS3-204ENST00000521231 DLK2Q6UY11 383 aa23.7■■□□□ 1.38
HOXA-AS3-204ENST00000521231 ABHD8Q96I13 439 aa23.7■■□□□ 1.38
HOXA-AS3-204ENST00000521231 MYD88Q99836 296 aa23.7■■□□□ 1.38
HOXA-AS3-204ENST00000521231 BEGAINQ9BUH8 593 aa23.7■■□□□ 1.38
HOXA-AS3-204ENST00000521231 VIL1P09327 827 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
HOXA-AS3-204ENST00000521231 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
HOXA-AS3-204ENST00000521231 ZNF408Q9H9D4 720 aa23.69■■□□□ 1.38
HOXA-AS3-204ENST00000521231 SPEF2Q9C093 1822 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXA-AS3-204ENST00000521231 PDE8AO60658 829 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXA-AS3-204ENST00000521231 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
HOXA-AS3-204ENST00000521231 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
HOXA-AS3-204ENST00000521231 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
HOXA-AS3-204ENST00000521231 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
HOXA-AS3-204ENST00000521231 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
HOXA-AS3-204ENST00000521231 CACNA1FO60840 1977 aa23.67■■□□□ 1.38
HOXA-AS3-204ENST00000521231 ZNF609O15014 1411 aa23.67■■□□□ 1.38
HOXA-AS3-204ENST00000521231 CCDC152Q4G0S7 254 aa23.66■■□□□ 1.38
HOXA-AS3-204ENST00000521231 TSPYL6Q8N831 410 aa23.66■■□□□ 1.38
HOXA-AS3-204ENST00000521231 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
HOXA-AS3-204ENST00000521231 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
HOXA-AS3-204ENST00000521231 TSKSQ9UJT2 592 aa23.66■■□□□ 1.38
HOXA-AS3-204ENST00000521231 AKAP11Q9UKA4 1901 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXA-AS3-204ENST00000521231 CA12O43570 354 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXA-AS3-204ENST00000521231 CCDC30Q5VVM6 783 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXA-AS3-204ENST00000521231 KRT26Q7Z3Y9 468 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXA-AS3-204ENST00000521231 ZIC5Q96T25 663 aa23.65■■□□□ 1.38
HOXA-AS3-204ENST00000521231 UFL1O94874 794 aa23.64■■□□□ 1.37
HOXA-AS3-204ENST00000521231 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa23.64■■□□□ 1.37
HOXA-AS3-204ENST00000521231 GGA1Q9UJY5 639 aa23.64■■□□□ 1.37
HOXA-AS3-204ENST00000521231 HUNKP57058 714 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXA-AS3-204ENST00000521231 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
HOXA-AS3-204ENST00000521231 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
HOXA-AS3-204ENST00000521231 ADM5C9JUS6 153 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXA-AS3-204ENST00000521231 DDX58O95786 925 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
HOXA-AS3-204ENST00000521231 IGKV5-2P06315 115 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXA-AS3-204ENST00000521231 NOGQ13253 232 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXA-AS3-204ENST00000521231 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXA-AS3-204ENST00000521231 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
HOXA-AS3-204ENST00000521231 CHMP4AQ9BY43 222 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXA-AS3-204ENST00000521231 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXA-AS3-204ENST00000521231 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
HOXA-AS3-204ENST00000521231 KSR2Q6VAB6 950 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXA-AS3-204ENST00000521231 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
HOXA-AS3-204ENST00000521231 GMLQ99445 158 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXA-AS3-204ENST00000521231 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
HOXA-AS3-204ENST00000521231 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
HOXA-AS3-204ENST00000521231 XDHP47989 1333 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXA-AS3-204ENST00000521231 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXA-AS3-204ENST00000521231 AGBL3Q8NEM8 1001 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXA-AS3-204ENST00000521231 PI4KAP2A4QPH2 592 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXA-AS3-204ENST00000521231 CCDC184Q52MB2 194 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXA-AS3-204ENST00000521231 RGMBQ6NW40 437 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXA-AS3-204ENST00000521231 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
HOXA-AS3-204ENST00000521231 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXA-AS3-204ENST00000521231 TTLL11Q8NHH1 800 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXA-AS3-204ENST00000521231 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
HOXA-AS3-204ENST00000521231 CTSWP56202 376 aa23.58■■□□□ 1.37
HOXA-AS3-204ENST00000521231 C2orf69Q8N8R5 385 aa23.58■■□□□ 1.37
HOXA-AS3-204ENST00000521231 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
HOXA-AS3-204ENST00000521231 GGA3Q9NZ52 723 aa23.58■■□□□ 1.37
HOXA-AS3-204ENST00000521231 G3V3G9 751 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXA-AS3-204ENST00000521231 ATP2B4P23634 1241 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXA-AS3-204ENST00000521231 CCDC27Q2M243 656 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXA-AS3-204ENST00000521231 DCAF8Q5TAQ9 597 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXA-AS3-204ENST00000521231 PODNQ7Z5L7 613 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXA-AS3-204ENST00000521231 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
HOXA-AS3-204ENST00000521231 RGS19P49795 217 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXA-AS3-204ENST00000521231 SCARF1Q14162 830 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXA-AS3-204ENST00000521231 G2E3Q7L622 706 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXA-AS3-204ENST00000521231 SULF1Q8IWU6 871 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXA-AS3-204ENST00000521231 CCDC102AQ96A19 550 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXA-AS3-204ENST00000521231 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
HOXA-AS3-204ENST00000521231 GREM2Q9H772 168 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXA-AS3-204ENST00000521231 MINPP1Q9UNW1 487 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXA-AS3-204ENST00000521231 NEURL1BA8MQ27 555 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXA-AS3-204ENST00000521231 H7C1W4 665 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXA-AS3-204ENST00000521231 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
HOXA-AS3-204ENST00000521231 WWC1Q8IX03 1113 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXA-AS3-204ENST00000521231 CDCA5Q96FF9 252 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXA-AS3-204ENST00000521231 MCOLN1Q9GZU1 580 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXA-AS3-204ENST00000521231 MED23Q9ULK4 1368 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXA-AS3-204ENST00000521231 USP17L3A6NCW0 530 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXA-AS3-204ENST00000521231 USP17L4A6NCW7 530 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXA-AS3-204ENST00000521231 USP17L8P0C7I0 530 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXA-AS3-204ENST00000521231 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
HOXA-AS3-204ENST00000521231 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
HOXA-AS3-204ENST00000521231 USP17L1Q7RTZ2 530 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXA-AS3-204ENST00000521231 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXA-AS3-204ENST00000521231 CCDC85CA6NKD9 419 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXA-AS3-204ENST00000521231 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
HOXA-AS3-204ENST00000521231 NEXNQ0ZGT2 675 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXA-AS3-204ENST00000521231 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms