RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514374.5

ZNF331-222, Transcript of zinc finger protein 331, human

TSL 4

Gene ZNF331, Length 574 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF331-222	ENST00000514374	COG3	Q96JB2	828 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ZNF331-222	ENST00000514374	AK7	Q96M32	723 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ZNF331-222	ENST00000514374	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		11.29	□□□□□ -0.6
ZNF331-222	ENST00000514374	RTL1	A6NKG5	1358 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNF331-222	ENST00000514374	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
ZNF331-222	ENST00000514374	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
ZNF331-222	ENST00000514374	TOMM70	O94826	608 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNF331-222	ENST00000514374	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
ZNF331-222	ENST00000514374	GRM5	P41594	1212 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNF331-222	ENST00000514374	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNF331-222	ENST00000514374	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
ZNF331-222	ENST00000514374	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNF331-222	ENST00000514374	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNF331-222	ENST00000514374	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNF331-222	ENST00000514374	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNF331-222	ENST00000514374	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNF331-222	ENST00000514374	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		11.28	□□□□□ -0.6
ZNF331-222	ENST00000514374	VSIG8	P0DPA2	414 aa		11.27	□□□□□ -0.61
ZNF331-222	ENST00000514374	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
ZNF331-222	ENST00000514374	ARID5B	Q14865	1188 aa		11.27	□□□□□ -0.61
ZNF331-222	ENST00000514374	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		11.27	□□□□□ -0.61
ZNF331-222	ENST00000514374	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		11.27	□□□□□ -0.61
ZNF331-222	ENST00000514374	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
ZNF331-222	ENST00000514374	NBPF4	Q96M43	638 aa		11.27	□□□□□ -0.61
ZNF331-222	ENST00000514374	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		11.27	□□□□□ -0.61
ZNF331-222	ENST00000514374	TRIM66	O15016	1216 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ZNF331-222	ENST00000514374	SSFA2	P28290	1259 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ZNF331-222	ENST00000514374	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		11.26	□□□□□ -0.61
ZNF331-222	ENST00000514374	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ZNF331-222	ENST00000514374	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ZNF331-222	ENST00000514374	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
ZNF331-222	ENST00000514374	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ZNF331-222	ENST00000514374	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		11.25	□□□□□ -0.61
ZNF331-222	ENST00000514374	NR5A1	Q13285	461 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ZNF331-222	ENST00000514374	SMIM5	Q71RC9	77 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ZNF331-222	ENST00000514374	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		11.24	□□□□□ -0.61
ZNF331-222	ENST00000514374	CYP27B1	O15528	508 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ZNF331-222	ENST00000514374	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ZNF331-222	ENST00000514374	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ZNF331-222	ENST00000514374	TESK2	Q96S53	571 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ZNF331-222	ENST00000514374	SBF1	O95248	1867 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ZNF331-222	ENST00000514374	TGFB2	P61812	414 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ZNF331-222	ENST00000514374	NEUROD1	Q13562	356 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ZNF331-222	ENST00000514374	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
ZNF331-222	ENST00000514374	QPCT	Q16769	361 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ZNF331-222	ENST00000514374	KLRG1	Q96E93	195 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ZNF331-222	ENST00000514374	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
ZNF331-222	ENST00000514374	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ZNF331-222	ENST00000514374	C4A	P0C0L4	1744 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ZNF331-222	ENST00000514374	INSR	P06213	1382 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ZNF331-222	ENST00000514374	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ZNF331-222	ENST00000514374	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ZNF331-222	ENST00000514374	SIK1	P57059	783 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ZNF331-222	ENST00000514374	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
ZNF331-222	ENST00000514374	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
ZNF331-222	ENST00000514374	JMY	Q8N9B5	988 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ZNF331-222	ENST00000514374	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ZNF331-222	ENST00000514374	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ZNF331-222	ENST00000514374	BCS1L	Q9Y276	419 aa		11.21	□□□□□ -0.61
ZNF331-222	ENST00000514374	NCAPD2	Q15021	1401 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ZNF331-222	ENST00000514374	FLT4	P35916	1363 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ZNF331-222	ENST00000514374	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ZNF331-222	ENST00000514374	FYB1	O15117	783 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ZNF331-222	ENST00000514374	MMP10	P09238	476 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ZNF331-222	ENST00000514374	FSTL1	Q12841	308 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ZNF331-222	ENST00000514374	AGER	Q15109	404 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ZNF331-222	ENST00000514374	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
ZNF331-222	ENST00000514374	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ZNF331-222	ENST00000514374	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ZNF331-222	ENST00000514374	MEIOB	Q8N635	442 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ZNF331-222	ENST00000514374	PIGB	Q92521	554 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ZNF331-222	ENST00000514374	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ZNF331-222	ENST00000514374	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
ZNF331-222	ENST00000514374	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		11.2	□□□□□ -0.62
ZNF331-222	ENST00000514374	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ZNF331-222	ENST00000514374	MAN1A2	O60476	641 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ZNF331-222	ENST00000514374	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ZNF331-222	ENST00000514374		A0A0G2JLW4	131 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ZNF331-222	ENST00000514374	SLC24A1	O60721	1099 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ZNF331-222	ENST00000514374	PPFIA3	O75145	1194 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ZNF331-222	ENST00000514374	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ZNF331-222	ENST00000514374	TNS4	Q8IZW8	715 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ZNF331-222	ENST00000514374	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ZNF331-222	ENST00000514374	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ZNF331-222	ENST00000514374	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ZNF331-222	ENST00000514374	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ZNF331-222	ENST00000514374	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ZNF331-222	ENST00000514374	LILRB3	O75022	631 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ZNF331-222	ENST00000514374	BMP2	P12643	396 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ZNF331-222	ENST00000514374	PRELP	P51888	382 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ZNF331-222	ENST00000514374	HTRA3	P83110	453 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ZNF331-222	ENST00000514374	ITPK1	Q13572	414 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ZNF331-222	ENST00000514374	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ZNF331-222	ENST00000514374	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ZNF331-222	ENST00000514374	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ZNF331-222	ENST00000514374	SPG7	Q9UQ90	795 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ZNF331-222	ENST00000514374	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
ZNF331-222	ENST00000514374	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ZNF331-222	ENST00000514374	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ZNF331-222	ENST00000514374	DPEP1	P16444	411 aa		11.16	□□□□□ -0.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.6 ms