RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
PGGT1B-205ENST00000514178 KBTBD4Q9NVX7 518 aa11.78□□□□□ -0.52
PGGT1B-205ENST00000514178 ZFATQ9P243 1243 aa11.78□□□□□ -0.52
PGGT1B-205ENST00000514178 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa11.78□□□□□ -0.52
PGGT1B-205ENST00000514178 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 FCGRTP55899 365 aa11.77□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 PAK2Q13177 524 aa11.77□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa11.77□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 GRIN2CQ14957 1233 aa11.76□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 VPS37DQ86XT2 251 aa11.76□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 LNPKQ9C0E8 428 aa11.76□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 STRN4Q9NRL3 753 aa11.76□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 MAN1A2O60476 641 aa11.75□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 TNP2Q05952 138 aa11.75□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 MCF2L2Q86YR7 1114 aa11.75□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 GPRASP2Q96D09 838 aa11.75□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 SPATA32Q96LK8 384 aa11.75□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 LIN7BQ9HAP6 207 aa11.75□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 ABCB6Q9NP58 842 aa11.75□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 AXIN1O15169 862 aa11.74□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 FGRP09769 529 aa11.74□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 MAPTP10636 758 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 NFKB1P19838 968 aa11.74□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 LAMC2Q13753 1193 aa11.74□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 PNMA5Q96PV4 448 aa11.74□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 TCF12Q99081 682 aa11.74□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 RSRP1Q9BUV0 290 aa11.74□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 PPM1HQ9ULR3 514 aa11.74□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa11.73□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 MAP3K10Q02779 954 aa11.73□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa11.73□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa11.73□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 HCN2Q9UL51 889 aa11.73□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 DGAT1O75907 488 aa11.72□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 KIF4AO95239 1232 aa11.72□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 PSAPP07602 524 aa11.72□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 ACPPP15309 386 aa11.72□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 NCAPG2Q86XI2 1143 aa11.72□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 ANKRD24Q8TF21 1146 aa11.72□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa11.72□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 AKAP2Q9Y2D5 859 aa11.72□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 SOBPA7XYQ1 873 aa11.71□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 F6X3S4 739 aa11.71□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 SOX18P35713 384 aa11.71□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 PTSQ03393 145 aa11.71□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 SPEM2Q0P670 501 aa11.71□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 PKDCCQ504Y2 493 aa11.71□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 DTHD1Q6ZMT9 781 aa11.71□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 CCNJLQ8IV13 435 aa11.71□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 CRIPAKQ8N1N5 446 aa11.71□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP11.71□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 SPON2Q9BUD6 331 aa11.71□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 MARK1Q9P0L2 795 aa11.71□□□□□ -0.53
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC35F4A4IF30 521 aa11.7□□□□□ -0.54
PGGT1B-205ENST00000514178 FBXO24O75426 580 aa11.7□□□□□ -0.54
PGGT1B-205ENST00000514178 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
PGGT1B-205ENST00000514178 RBL2Q08999 1139 aa11.7□□□□□ -0.54
PGGT1B-205ENST00000514178 HYAL2Q12891 473 aa11.7□□□□□ -0.54
PGGT1B-205ENST00000514178 PWP1Q13610 501 aa11.7□□□□□ -0.54
PGGT1B-205ENST00000514178 GIMAP6Q6P9H5 292 aa11.7□□□□□ -0.54
PGGT1B-205ENST00000514178 RELL1Q8IUW5 271 aa11.7□□□□□ -0.54
PGGT1B-205ENST00000514178 KIAA0825Q8IV33 1275 aa11.7□□□□□ -0.54
PGGT1B-205ENST00000514178 RASGRP4Q8TDF6 673 aa11.7□□□□□ -0.54
PGGT1B-205ENST00000514178 OSMRQ99650 979 aa11.7□□□□□ -0.54
PGGT1B-205ENST00000514178 NDFIP2Q9NV92 336 aa11.7□□□□□ -0.54
PGGT1B-205ENST00000514178 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa11.7□□□□□ -0.54
PGGT1B-205ENST00000514178 H7C1W4 665 aa11.69□□□□□ -0.54
PGGT1B-205ENST00000514178 BNIP3LO60238 219 aa11.69□□□□□ -0.54
PGGT1B-205ENST00000514178 RGS20O76081 388 aa11.69□□□□□ -0.54
PGGT1B-205ENST00000514178 MAP3K6O95382 1288 aa11.69□□□□□ -0.54
PGGT1B-205ENST00000514178 PLAURQ03405 335 aa11.69□□□□□ -0.54
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC30A3Q99726 388 aa11.69□□□□□ -0.54
PGGT1B-205ENST00000514178 EFCC1Q9HA90 598 aa11.69□□□□□ -0.54
PGGT1B-205ENST00000514178 DBN1Q16643 649 aa11.68□□□□□ -0.54
PGGT1B-205ENST00000514178 SV2BQ7L1I2 683 aa11.68□□□□□ -0.54
PGGT1B-205ENST00000514178 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
PGGT1B-205ENST00000514178 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa11.68□□□□□ -0.54
PGGT1B-205ENST00000514178 BHMTQ93088 406 aa11.68□□□□□ -0.54
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM74Q96NL1 305 aa11.68□□□□□ -0.54
PGGT1B-205ENST00000514178 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa11.68□□□□□ -0.54
PGGT1B-205ENST00000514178 MINDY4BA8MYZ0 360 aa11.67□□□□□ -0.54
PGGT1B-205ENST00000514178 TRPA1O75762 1119 aa11.67□□□□□ -0.54
PGGT1B-205ENST00000514178 STK10O94804 968 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
PGGT1B-205ENST00000514178 CD33P20138 364 aa11.67□□□□□ -0.54
PGGT1B-205ENST00000514178 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
PGGT1B-205ENST00000514178 MAP3K11Q16584 847 aa11.67□□□□□ -0.54
PGGT1B-205ENST00000514178 CCDC144BQ3MJ40 725 aa11.67□□□□□ -0.54
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