RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GGA1Q9UJY5 639 aa21.44■■□□□ 1.02
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LTBP1Q14766 1721 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BCL2L13Q9BXK5 485 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GREM2Q9H772 168 aa21.43■■□□□ 1.02
HOXC-AS3-202ENST00000513165 E9PSI1 815 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCER2I3L3R5 266 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CSF1RP07333 972 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXC-AS3-202ENST00000513165 XDHP47989 1333 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BEND3Q5T5X7 828 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DPF2Q92785 391 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DBNDD1Q9H9R9 158 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMEM88BA6NKF7 163 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXC-AS3-202ENST00000513165 UFL1O94874 794 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ATP2B4P23634 1241 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXC-AS3-202ENST00000513165 F6X3S4 739 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ECE2O60344 883 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DOK7Q18PE1 504 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PGAP2Q9UHJ9 254 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MINPP1Q9UNW1 487 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MYH3P11055 1940 aa21.39■■□□□ 1.02
HOXC-AS3-202ENST00000513165 H7C1D1 291 aa21.39■■□□□ 1.01
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PSMD14O00487 310 aa21.39■■□□□ 1.01
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RPS12P25398 132 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
HOXC-AS3-202ENST00000513165 G3V3G9 751 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLFN5Q08AF3 891 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DCAF8Q5TAQ9 597 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ALDH1L1O75891 902 aa21.37■■□□□ 1.01
HOXC-AS3-202ENST00000513165 VIL1P09327 827 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ITGA6P23229 1130 aa21.37■■□□□ 1.01
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KCNQ5Q9NR82 932 aa21.37■■□□□ 1.01
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FOXO4P98177 505 aa21.35■■□□□ 1.01
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PODNQ7Z5L7 613 aa21.35■■□□□ 1.01
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MICALL2Q8IY33 904 aa21.35■■□□□ 1.01
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MPHOSPH8Q99549 860 aa21.35■■□□□ 1.01
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LEMD3Q9Y2U8 911 aa21.35■■□□□ 1.01
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa21.34■■□□□ 1.01
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GRM8O00222 908 aa21.34■■□□□ 1.01
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCT4P50991 539 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM161AQ3B820 660 aa21.34■■□□□ 1.01
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa21.34■■□□□ 1.01
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ANKRD2Q9GZV1 360 aa21.34■■□□□ 1.01
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CNTNAP1P78357 1384 aa21.34■■□□□ 1.01
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PCNTO95613 3336 aa21.33■■□□□ 1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC4A10Q6U841 1118 aa21.32■■□□□ 1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AGBL3Q8NEM8 1001 aa21.32■■□□□ 1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MED23Q9ULK4 1368 aa21.32■■□□□ 1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PTPRCP08575 1304 aa21.31■■□□□ 1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SHTN1A0MZ66 631 aa21.31■■□□□ 1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RASSF10A6NK89 507 aa21.31■■□□□ 1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DEFB115Q30KQ5 88 aa21.31■■□□□ 1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CDC37L1Q7L3B6 337 aa21.31■■□□□ 1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRPM4Q8TD43 1214 aa21.31■■□□□ 1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ALDH1L2Q3SY69 923 aa21.3■■□□□ 1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CST9Q5W186 159 aa21.3■■□□□ 1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LMBR1LQ6UX01 489 aa21.3■■□□□ 1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SAMD7Q7Z3H4 446 aa21.3■■□□□ 1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SSH1Q8WYL5 1049 aa21.3■■□□□ 1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CDCA7LQ96GN5 454 aa21.3■■□□□ 1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 COA1Q9GZY4 146 aa21.3■■□□□ 1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF609O15014 1411 aa21.29■■□□□ 1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 USP17L3A6NCW0 530 aa21.29■■□□□ 1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 USP17L4A6NCW7 530 aa21.29■■□□□ 1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRAF5O00463 557 aa21.29■■□□□ 1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 USP17L1Q7RTZ2 530 aa21.29■■□□□ 1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF804BA4D1E1 1349 aa21.29■■□□□ 1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SCN9AQ15858 1988 aa21.28■■□□□ 1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 VEGFBP49765 207 aa21.28■■□□□ 1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP21.28■■□□□ 1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CHRNDQ07001 517 aa21.28■■□□□ 1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCDC57Q2TAC2 916 aa21.28■■□□□ 1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EPHA10Q5JZY3 1008 aa21.28■■□□□ 1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 UTYO14607 1347 aa21.28■■□□□ 1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GMLQ99445 158 aa21.27■■□□□ 1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CHMP3Q9Y3E7 222 aa21.27■■□□□ 1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TXNRD3Q86VQ6 643 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPEF2Q9C093 1822 aa21.25■□□□□ 0.99
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EGFRP00533 1210 aa21.25■□□□□ 0.99
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
HOXC-AS3-202ENST00000513165 USP17L8P0C7I0 530 aa21.25■□□□□ 0.99
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