RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512553.5

ITGA3-213, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 3

Gene ITGA3, Length 351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-213ENST00000512553 SLC51AQ86UW1 340 aa11.97□□□□□ -0.49
ITGA3-213ENST00000512553 ZNF428Q96B54 188 aa11.97□□□□□ -0.49
ITGA3-213ENST00000512553 PLA2G12BQ9BX93 195 aa11.97□□□□□ -0.49
ITGA3-213ENST00000512553 POLLQ9UGP5 575 aa11.97□□□□□ -0.49
ITGA3-213ENST00000512553 COL4A1P02462 1669 aa11.97□□□□□ -0.49
ITGA3-213ENST00000512553 THSD7BQ9C0I4 1608 aa11.97□□□□□ -0.49
ITGA3-213ENST00000512553 SCN9AQ15858 1988 aa11.96□□□□□ -0.49
ITGA3-213ENST00000512553 VAMP4O75379 141 aa11.96□□□□□ -0.49
ITGA3-213ENST00000512553 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
ITGA3-213ENST00000512553 GCKRQ14397 625 aa11.96□□□□□ -0.49
ITGA3-213ENST00000512553 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa11.96□□□□□ -0.49
ITGA3-213ENST00000512553 DBNDD1Q9H9R9 158 aa11.96□□□□□ -0.49
ITGA3-213ENST00000512553 SEC31BQ9NQW1 1179 aa11.96□□□□□ -0.49
ITGA3-213ENST00000512553 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
ITGA3-213ENST00000512553 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
ITGA3-213ENST00000512553 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
ITGA3-213ENST00000512553 MED23Q9ULK4 1368 aa11.95□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 RASSF10A6NK89 507 aa11.95□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 YDJCA8MPS7 323 aa11.95□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 H7C1W4 665 aa11.95□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 PSMD14O00487 310 aa11.95□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 RIMBP2O15034 1052 aa11.95□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 ECE1P42892 770 aa11.95□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 TTLL11Q8NHH1 800 aa11.95□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 AIDAQ96BJ3 306 aa11.95□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 MMP14P50281 582 aa11.94□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 DEFB115Q30KQ5 88 aa11.94□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 G2E3Q7L622 706 aa11.94□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 PODNQ7Z5L7 613 aa11.94□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 MICALL2Q8IY33 904 aa11.94□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 MPHOSPH8Q99549 860 aa11.94□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 ANKRD2Q9GZV1 360 aa11.94□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 PGAP2Q9UHJ9 254 aa11.94□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 A0A1B0GUL6 1792 aa11.94□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 E9PSI1 815 aa11.93□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 CDC37L1Q7L3B6 337 aa11.93□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 AGBL3Q8NEM8 1001 aa11.93□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 GREM2Q9H772 168 aa11.93□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 LEMD3Q9Y2U8 911 aa11.93□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 MYO3BQ8WXR4 1341 aa11.92□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa11.92□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 ALDH1L1O75891 902 aa11.92□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 VIL1P09327 827 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 ITGA6P23229 1130 aa11.92□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 DOK7Q18PE1 504 aa11.92□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 HHIPL1Q96JK4 782 aa11.92□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 ZNF521Q96K83 1311 aa11.91□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 CSF1RP07333 972 aa11.91□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 KCNJ4P48050 445 aa11.91□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 VEGFBP49765 207 aa11.91□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 CCT4P50991 539 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 TRPM4Q8TD43 1214 aa11.91□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 MINPP1Q9UNW1 487 aa11.91□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 TLL2Q9Y6L7 1015 aa11.91□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 PTPRCP08575 1304 aa11.9□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 USP17L3A6NCW0 530 aa11.9□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 USP17L4A6NCW7 530 aa11.9□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 GRM8O00222 908 aa11.9□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 CELF2O95319 508 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 CASP7P55210 303 aa11.9□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa11.9□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 FAM161AQ3B820 660 aa11.9□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 BEND3Q5T5X7 828 aa11.9□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 USP17L1Q7RTZ2 530 aa11.9□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 BEGAINQ9BUH8 593 aa11.9□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa11.9□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 COA1Q9GZY4 146 aa11.9□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
ITGA3-213ENST00000512553 ECM29Q5VYK3 1845 aa11.89□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 CCER2I3L3R5 266 aa11.89□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 CCDC57Q2TAC2 916 aa11.89□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 TAF7LQ5H9L4 462 aa11.89□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 KRT26Q7Z3Y9 468 aa11.89□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 SULF1Q8IWU6 871 aa11.89□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 OGFOD1Q8N543 542 aa11.89□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 CHMP3Q9Y3E7 222 aa11.89□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 ZNF804BA4D1E1 1349 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa11.88□□□□□ -0.51
ITGA3-213ENST00000512553 TRAF5O00463 557 aa11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms