RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511412.1

ALYREF-203, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 3

Gene ALYREF, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-203ENST00000511412 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP31.62■■■□□ 2.65
ALYREF-203ENST00000511412 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP31.62■■■□□ 2.65
ALYREF-203ENST00000511412 H7C1D1 291 aa31.61■■■□□ 2.65
ALYREF-203ENST00000511412 DOK7Q18PE1 504 aa31.61■■■□□ 2.65
ALYREF-203ENST00000511412 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP31.61■■■□□ 2.65
ALYREF-203ENST00000511412 TRPM4Q8TD43 1214 aa31.61■■■□□ 2.65
ALYREF-203ENST00000511412 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP31.61■■■□□ 2.65
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ALYREF-203ENST00000511412 SPEF2Q9C093 1822 aa31.61■■■□□ 2.65
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ALYREF-203ENST00000511412 NEURL1BA8MQ27 555 aa31.6■■■□□ 2.65
ALYREF-203ENST00000511412 WDR63Q8IWG1 891 aa31.6■■■□□ 2.65
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ALYREF-203ENST00000511412 SHTN1A0MZ66 631 aa31.59■■■□□ 2.65
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ALYREF-203ENST00000511412 XDHP47989 1333 aa31.57■■■□□ 2.64
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ALYREF-203ENST00000511412 TLL2Q9Y6L7 1015 aa31.55■■■□□ 2.64
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ALYREF-203ENST00000511412 GREM2Q9H772 168 aa31.53■■■□□ 2.64
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ALYREF-203ENST00000511412 ATP2B4P23634 1241 aa31.52■■■□□ 2.64
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ALYREF-203ENST00000511412 MYH16Q9H6N6 1097 aa31.52■■■□□ 2.64
ALYREF-203ENST00000511412 WBP1LQ9NX94 342 aa31.52■■■□□ 2.64
ALYREF-203ENST00000511412 GCKRQ14397 625 aa31.51■■■□□ 2.63
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ALYREF-203ENST00000511412 MED23Q9ULK4 1368 aa31.47■■■□□ 2.63
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ALYREF-203ENST00000511412 SAPCD2Q86UD0 394 aa31.47■■■□□ 2.63
ALYREF-203ENST00000511412 PRDM10Q9NQV6 1147 aa31.47■■■□□ 2.63
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ALYREF-203ENST00000511412 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP31.46■■■□□ 2.63
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ALYREF-203ENST00000511412 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP31.44■■■□□ 2.62
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ALYREF-203ENST00000511412 KRT26Q7Z3Y9 468 aa31.43■■■□□ 2.62
ALYREF-203ENST00000511412 PODNQ7Z5L7 613 aa31.43■■■□□ 2.62
ALYREF-203ENST00000511412 AGBL3Q8NEM8 1001 aa31.43■■■□□ 2.62
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ALYREF-203ENST00000511412 CAPN15O75808 1086 aa31.42■■■□□ 2.62
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ALYREF-203ENST00000511412 MPHOSPH8Q99549 860 aa31.4■■■□□ 2.62
ALYREF-203ENST00000511412 GGA3Q9NZ52 723 aa31.4■■■□□ 2.62
ALYREF-203ENST00000511412 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP31.39■■■□□ 2.62
ALYREF-203ENST00000511412 USP17L3A6NCW0 530 aa31.39■■■□□ 2.62
ALYREF-203ENST00000511412 USP17L4A6NCW7 530 aa31.39■■■□□ 2.62
ALYREF-203ENST00000511412 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP31.39■■■□□ 2.62
ALYREF-203ENST00000511412 F6X3S4 739 aa31.39■■■□□ 2.62
ALYREF-203ENST00000511412 CSF1RP07333 972 aa31.39■■■□□ 2.62
ALYREF-203ENST00000511412 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP31.39■■■□□ 2.62
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP31.39■■■□□ 2.62
ALYREF-203ENST00000511412 USP17L1Q7RTZ2 530 aa31.39■■■□□ 2.62
ALYREF-203ENST00000511412 BEGAINQ9BUH8 593 aa31.39■■■□□ 2.62
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP31.39■■■□□ 2.62
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