RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510829.6

RABGEF1-208, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-208ENST00000510829 ATP2B3Q16720 1220 aa13.13□□□□□ -0.31
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RABGEF1-208ENST00000510829 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
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RABGEF1-208ENST00000510829 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
RABGEF1-208ENST00000510829 F13A1P00488 732 aa13.12□□□□□ -0.31
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RABGEF1-208ENST00000510829 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
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RABGEF1-208ENST00000510829 IDH1O75874 414 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
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RABGEF1-208ENST00000510829 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
RABGEF1-208ENST00000510829 NGLY1Q96IV0 654 aa13.06□□□□□ -0.32
RABGEF1-208ENST00000510829 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
RABGEF1-208ENST00000510829 JAK2O60674 1132 aa13.05□□□□□ -0.32
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RABGEF1-208ENST00000510829 ST3GAL1Q11201 340 aa13.05□□□□□ -0.32
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