RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa9.36□□□□□ -0.91
PDE4D-217ENST00000509355 SHISA2Q6UWI4 295 aa9.36□□□□□ -0.91
PDE4D-217ENST00000509355 HELQQ8TDG4 1101 aa9.36□□□□□ -0.91
PDE4D-217ENST00000509355 GPR152Q8TDT2 470 aa9.36□□□□□ -0.91
PDE4D-217ENST00000509355 PLD4Q96BZ4 506 aa9.36□□□□□ -0.91
PDE4D-217ENST00000509355 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
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PDE4D-217ENST00000509355 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
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PDE4D-217ENST00000509355 NPR3P17342 541 aa9.33□□□□□ -0.92
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PDE4D-217ENST00000509355 ATCAYQ86WG3 371 aa9.33□□□□□ -0.92
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PDE4D-217ENST00000509355 Q8N3U1 123 aa9.32□□□□□ -0.92
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PDE4D-217ENST00000509355 GHRHP01286 108 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-217ENST00000509355 IGF2-ASQ6U949 168 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-217ENST00000509355 ELP3Q9H9T3 547 aa9.3□□□□□ -0.92
PDE4D-217ENST00000509355 CARNS1A5YM72 827 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-217ENST00000509355 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-217ENST00000509355 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-217ENST00000509355 GGNBP2Q9H3C7 697 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-217ENST00000509355 TMEM63CQ9P1W3 806 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-217ENST00000509355 TRIM33Q9UPN9 1127 aa9.29□□□□□ -0.92
PDE4D-217ENST00000509355 TM4SF5O14894 197 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-217ENST00000509355 DYRK3O43781 588 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-217ENST00000509355 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-217ENST00000509355 HYAL2Q12891 473 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-217ENST00000509355 SETDB1Q15047 1291 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-217ENST00000509355 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-217ENST00000509355 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-217ENST00000509355 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-217ENST00000509355 IL22RA1Q8N6P7 574 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-217ENST00000509355 CEP120Q8N960 986 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-217ENST00000509355 CNTN3Q9P232 1028 aa9.28□□□□□ -0.92
PDE4D-217ENST00000509355 PDGFAP04085 211 aa9.27□□□□□ -0.93
PDE4D-217ENST00000509355 H2AFB1P0C5Y9 115 aa9.27□□□□□ -0.93
PDE4D-217ENST00000509355 H2AFB2P0C5Z0 115 aa9.27□□□□□ -0.93
PDE4D-217ENST00000509355 MPSTP25325 297 aa9.27□□□□□ -0.93
PDE4D-217ENST00000509355 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
PDE4D-217ENST00000509355 EDEM1Q92611 657 aa9.27□□□□□ -0.93
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PDE4D-217ENST00000509355 RASSF4Q9H2L5 321 aa9.24□□□□□ -0.93
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PDE4D-217ENST00000509355 USTQ9Y2C2 406 aa9.22□□□□□ -0.93
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PDE4D-217ENST00000509355 ECM1Q16610 540 aa9.21□□□□□ -0.94
PDE4D-217ENST00000509355 PRSS36Q5K4E3 855 aa9.21□□□□□ -0.94
PDE4D-217ENST00000509355 CEP135Q66GS9 1140 aa9.21□□□□□ -0.94
PDE4D-217ENST00000509355 Q6ZS46 218 aa9.21□□□□□ -0.94
PDE4D-217ENST00000509355 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
PDE4D-217ENST00000509355 MEGF10Q96KG7 1140 aa9.21□□□□□ -0.94
PDE4D-217ENST00000509355 ADAM19Q9H013 955 aa9.21□□□□□ -0.94
PDE4D-217ENST00000509355 POLIQ9UNA4 740 aa9.21□□□□□ -0.94
PDE4D-217ENST00000509355 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP9.2□□□□□ -0.94
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