RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493959.6

SENP6-211, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 3

Gene SENP6, Length 867 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-211ENST00000493959 TNIP1Q15025 636 aa28.9■■■□□ 2.22
SENP6-211ENST00000493959 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
SENP6-211ENST00000493959 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP28.89■■■□□ 2.221e-13■■■□□ 14.7
SENP6-211ENST00000493959 BEND3Q5T5X7 828 aa28.89■■■□□ 2.22
SENP6-211ENST00000493959 JMYQ8N9B5 988 aa28.89■■■□□ 2.22
SENP6-211ENST00000493959 BCL2L13Q9BXK5 485 aa28.89■■■□□ 2.22
SENP6-211ENST00000493959 CDCA7LQ96GN5 454 aa28.88■■■□□ 2.21
SENP6-211ENST00000493959 EYA3Q99504 573 aa28.88■■■□□ 2.21
SENP6-211ENST00000493959 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
SENP6-211ENST00000493959 GGA1Q9UJY5 639 aa28.88■■■□□ 2.21
SENP6-211ENST00000493959 MYH3P11055 1940 aa28.87■■■□□ 2.21
SENP6-211ENST00000493959 PSMD14O00487 310 aa28.87■■■□□ 2.21
SENP6-211ENST00000493959 ECE2O60344 883 aa28.87■■■□□ 2.21
SENP6-211ENST00000493959 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
SENP6-211ENST00000493959 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
SENP6-211ENST00000493959 PLA2G12BQ9BX93 195 aa28.87■■■□□ 2.21
SENP6-211ENST00000493959 CREBZFQ9NS37 354 aa28.87■■■□□ 2.21
SENP6-211ENST00000493959 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
SENP6-211ENST00000493959 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
SENP6-211ENST00000493959 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
SENP6-211ENST00000493959 MINPP1Q9UNW1 487 aa28.86■■■□□ 2.21
SENP6-211ENST00000493959 CSF1RP07333 972 aa28.85■■■□□ 2.21
SENP6-211ENST00000493959 SLFN5Q08AF3 891 aa28.85■■■□□ 2.21
SENP6-211ENST00000493959 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
SENP6-211ENST00000493959 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
SENP6-211ENST00000493959 FAM161AQ3B820 660 aa28.84■■■□□ 2.21
SENP6-211ENST00000493959 RTL9Q8NET4 1388 aa28.84■■■□□ 2.21
SENP6-211ENST00000493959 E9PSI1 815 aa28.83■■■□□ 2.21
SENP6-211ENST00000493959 ITGA6P23229 1130 aa28.83■■■□□ 2.21
SENP6-211ENST00000493959 SLC4A10Q6U841 1118 aa28.83■■■□□ 2.21
SENP6-211ENST00000493959 XDHP47989 1333 aa28.83■■■□□ 2.21
SENP6-211ENST00000493959 TMEM88BA6NKF7 163 aa28.82■■■□□ 2.2
SENP6-211ENST00000493959 CCER2I3L3R5 266 aa28.82■■■□□ 2.2
SENP6-211ENST00000493959 FOXO4P98177 505 aa28.82■■■□□ 2.2
SENP6-211ENST00000493959 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
SENP6-211ENST00000493959 TRPM4Q8TD43 1214 aa28.82■■■□□ 2.2
SENP6-211ENST00000493959 SCN9AQ15858 1988 aa28.82■■■□□ 2.2
SENP6-211ENST00000493959 TRAF5O00463 557 aa28.81■■■□□ 2.2
SENP6-211ENST00000493959 ATP2B4P23634 1241 aa28.81■■■□□ 2.2
SENP6-211ENST00000493959 EPHA10Q5JZY3 1008 aa28.81■■■□□ 2.2
SENP6-211ENST00000493959 MICALL2Q8IY33 904 aa28.81■■■□□ 2.2
SENP6-211ENST00000493959 SPEF2Q9C093 1822 aa28.8■■■□□ 2.2
SENP6-211ENST00000493959 G3V3G9 751 aa28.8■■■□□ 2.2
SENP6-211ENST00000493959 DCAF8Q5TAQ9 597 aa28.8■■■□□ 2.2
SENP6-211ENST00000493959 SAMD7Q7Z3H4 446 aa28.79■■■□□ 2.2
SENP6-211ENST00000493959 DPF2Q92785 391 aa28.79■■■□□ 2.2
SENP6-211ENST00000493959 H7C1D1 291 aa28.78■■■□□ 2.2
SENP6-211ENST00000493959 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
SENP6-211ENST00000493959 SSH1Q8WYL5 1049 aa28.78■■■□□ 2.2
SENP6-211ENST00000493959 GRM8O00222 908 aa28.77■■■□□ 2.2
SENP6-211ENST00000493959 EGFRP00533 1210 aa28.77■■■□□ 2.2
SENP6-211ENST00000493959 VIL1P09327 827 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
SENP6-211ENST00000493959 CCT4P50991 539 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
SENP6-211ENST00000493959 PGAP2Q9UHJ9 254 aa28.77■■■□□ 2.2
SENP6-211ENST00000493959 TXNRD3Q86VQ6 643 aa28.76■■■□□ 2.19
SENP6-211ENST00000493959 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
SENP6-211ENST00000493959 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
SENP6-211ENST00000493959 CST9Q5W186 159 aa28.75■■■□□ 2.19
SENP6-211ENST00000493959 LMBR1LQ6UX01 489 aa28.75■■■□□ 2.19
SENP6-211ENST00000493959 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
SENP6-211ENST00000493959 MPHOSPH8Q99549 860 aa28.75■■■□□ 2.19
SENP6-211ENST00000493959 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
SENP6-211ENST00000493959 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa28.75■■■□□ 2.19
SENP6-211ENST00000493959 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
SENP6-211ENST00000493959 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa28.74■■■□□ 2.19
SENP6-211ENST00000493959 ALDH1L1O75891 902 aa28.74■■■□□ 2.19
SENP6-211ENST00000493959 CHMP3Q9Y3E7 222 aa28.74■■■□□ 2.19
SENP6-211ENST00000493959 CNTNAP1P78357 1384 aa28.74■■■□□ 2.19
SENP6-211ENST00000493959 SNAP23O00161 211 aa28.73■■■□□ 2.19
SENP6-211ENST00000493959 KLRK1P26718 216 aa28.73■■■□□ 2.19
SENP6-211ENST00000493959 DLK2Q6UY11 383 aa28.73■■■□□ 2.19
SENP6-211ENST00000493959 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
SENP6-211ENST00000493959 RPS12P25398 132 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
SENP6-211ENST00000493959 VEGFBP49765 207 aa28.72■■■□□ 2.19
SENP6-211ENST00000493959 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
SENP6-211ENST00000493959 CHRNDQ07001 517 aa28.71■■■□□ 2.19
SENP6-211ENST00000493959 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
SENP6-211ENST00000493959 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
SENP6-211ENST00000493959 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
SENP6-211ENST00000493959 KAZALD1Q96I82 304 aa28.71■■■□□ 2.19
SENP6-211ENST00000493959 LEMD3Q9Y2U8 911 aa28.71■■■□□ 2.19
SENP6-211ENST00000493959 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
SENP6-211ENST00000493959 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
SENP6-211ENST00000493959 SUCLG2Q96I99 432 aa28.7■■■□□ 2.18
SENP6-211ENST00000493959 MXD3Q9BW11 206 aa28.7■■■□□ 2.18
SENP6-211ENST00000493959 ANKRD2Q9GZV1 360 aa28.7■■■□□ 2.18
SENP6-211ENST00000493959 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
SENP6-211ENST00000493959 ZNF804BA4D1E1 1349 aa28.69■■■□□ 2.18
SENP6-211ENST00000493959 TAF5LO75529 589 aa28.69■■■□□ 2.18
SENP6-211ENST00000493959 DEFB115Q30KQ5 88 aa28.69■■■□□ 2.18
SENP6-211ENST00000493959 PODNQ7Z5L7 613 aa28.69■■■□□ 2.18
SENP6-211ENST00000493959 USP48Q86UV5 1035 aa28.69■■■□□ 2.18
SENP6-211ENST00000493959 MED23Q9ULK4 1368 aa28.69■■■□□ 2.18
SENP6-211ENST00000493959 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
SENP6-211ENST00000493959 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
SENP6-211ENST00000493959 MIER1Q8N108 512 aa28.68■■■□□ 2.18
SENP6-211ENST00000493959 GMLQ99445 158 aa28.68■■■□□ 2.18
SENP6-211ENST00000493959 USP17L3A6NCW0 530 aa28.67■■■□□ 2.18
SENP6-211ENST00000493959 USP17L4A6NCW7 530 aa28.67■■■□□ 2.18
SENP6-211ENST00000493959 RASSF10A6NK89 507 aa28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46 ms