RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 KCNG4Q8TDN1 519 aa19.61■□□□□ 0.73
NISCH-213ENST00000489895 PLEKHG3A1L390 1219 aa19.61■□□□□ 0.73
NISCH-213ENST00000489895 YEATS4O95619 227 aa19.61■□□□□ 0.73
NISCH-213ENST00000489895 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
NISCH-213ENST00000489895 LEKR1Q6ZMV7 388 aa19.61■□□□□ 0.73
NISCH-213ENST00000489895 CKAP2LQ8IYA6 745 aa19.61■□□□□ 0.73
NISCH-213ENST00000489895 ALG1Q9BT22 464 aa19.61■□□□□ 0.73
NISCH-213ENST00000489895 INSRP06213 1382 aa19.61■□□□□ 0.73
NISCH-213ENST00000489895 PTPN14Q15678 1187 aa19.61■□□□□ 0.73
NISCH-213ENST00000489895 RMND1Q9NWS8 449 aa19.61■□□□□ 0.73
NISCH-213ENST00000489895 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
NISCH-213ENST00000489895 CCDC66A2RUB6 948 aa19.6■□□□□ 0.73
NISCH-213ENST00000489895 CLIP2Q9UDT6 1046 aa19.6■□□□□ 0.73
NISCH-213ENST00000489895 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa19.6■□□□□ 0.73
NISCH-213ENST00000489895 KIF5CO60282 957 aa19.6■□□□□ 0.73
NISCH-213ENST00000489895 GBP3Q9H0R5 595 aa19.6■□□□□ 0.73
NISCH-213ENST00000489895 NBPF14Q5TI25 921 aa19.6■□□□□ 0.73
NISCH-213ENST00000489895 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
NISCH-213ENST00000489895 RTL9Q8NET4 1388 aa19.59■□□□□ 0.73
NISCH-213ENST00000489895 UBXN4Q92575 508 aa19.59■□□□□ 0.73
NISCH-213ENST00000489895 USO1O60763 962 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
NISCH-213ENST00000489895 IDEP14735 1019 aa19.59■□□□□ 0.73
NISCH-213ENST00000489895 SKIDA1Q1XH10 827 aa19.59■□□□□ 0.73
NISCH-213ENST00000489895 TRAPPC3LQ5T215 181 aa19.59■□□□□ 0.73
NISCH-213ENST00000489895 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
NISCH-213ENST00000489895 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
NISCH-213ENST00000489895 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
NISCH-213ENST00000489895 TFCP2Q12800 502 aa19.58■□□□□ 0.73
NISCH-213ENST00000489895 KRT24Q2M2I5 525 aa19.58■□□□□ 0.73
NISCH-213ENST00000489895 Q6ZUG5 572 aa19.58■□□□□ 0.73
NISCH-213ENST00000489895 CCDC191Q8NCU4 936 aa19.58■□□□□ 0.73
NISCH-213ENST00000489895 ORAI2Q96SN7 254 aa19.58■□□□□ 0.73
NISCH-213ENST00000489895 CHL1O00533 1208 aa19.58■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 POLD1P28340 1107 aa19.58■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 ARHGEF5Q12774 1597 aa19.58■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 PDCL2Q8N4E4 241 aa19.58■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 PRC1O43663 620 aa19.57■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 SSR1P43307 286 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 KIF18AQ8NI77 898 aa19.57■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 PLXNC1O60486 1568 aa19.57■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 UQCRHLA0A096LP55 91 aa19.57■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 H0YHG0 523 aa19.57■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 UQCRHP07919 91 aa19.57■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 NEBLO76041 1014 aa19.57■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 RLBP1P12271 317 aa19.57■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 CALML3P27482 149 aa19.57■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 CCDC40Q4G0X9 1142 aa19.57■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 NECAB1Q8N987 351 aa19.56■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 DENND2AQ9ULE3 1009 aa19.56■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 SYKP43405 635 aa19.56■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 SLC52A2Q9HAB3 445 aa19.56■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 GDPD2Q9HCC8 539 aa19.56■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 ZNF165P49910 485 aa19.56■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa19.56■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 SH3TC1Q8TE82 1336 aa19.56■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 HELLSQ9NRZ9 838 aa19.56■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 LDHBP07195 334 aaKnown RBP19.55■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 EYA2O00167 538 aa19.55■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 SAMM50Q9Y512 469 aa19.55■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 GNPATO15228 680 aa19.55■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa19.55■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 F8W031 263 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 TBCAO75347 108 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa19.54■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 C6orf50Q9HD87 102 aa19.54■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 CCDC171Q6TFL3 1326 aa19.54■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 JDP2Q8WYK2 163 aa19.54■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 USP25Q9UHP3 1055 aa19.54■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 MAGEB6Q8N7X4 407 aa19.54■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa19.53■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 MCM3P25205 808 aa19.53■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 PTPRTO14522 1441 aa19.53■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 EXOC1Q9NV70 894 aa19.53■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 PICALMQ13492 652 aa19.53■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 LRRC2Q9BYS8 371 aa19.53■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 MCM9Q9NXL9 1143 aa19.53■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 CREB3L3Q68CJ9 461 aa19.53■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 BIN1O00499 593 aa19.52■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 PDE8AO60658 829 aa19.52■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 SYCP3Q8IZU3 236 aa19.52■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 CHMP4BP1P59074 171 aa19.52■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa19.52■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 CNBD1Q8NA66 436 aa19.52■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 PANK2Q9BZ23 570 aa19.52■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 CHMLP26374 656 aa19.52■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa19.52■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 SLAIN2Q9P270 581 aa19.52■□□□□ 0.72
NISCH-213ENST00000489895 B4DLN1 442 aa19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 108.4 ms