RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484684.1

SRPRB-204, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene SRPRB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-204ENST00000484684 DCAF8Q5TAQ9 597 aa20.68■□□□□ 0.9
SRPRB-204ENST00000484684 POLLQ9UGP5 575 aa20.68■□□□□ 0.9
SRPRB-204ENST00000484684 TAF1P21675 1872 aa20.68■□□□□ 0.9
SRPRB-204ENST00000484684 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
SRPRB-204ENST00000484684 NEFMP07197 916 aa20.67■□□□□ 0.9
SRPRB-204ENST00000484684 VIL1P09327 827 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
SRPRB-204ENST00000484684 TM4SF4P48230 202 aa20.67■□□□□ 0.9
SRPRB-204ENST00000484684 GPSM2P81274 684 aa20.67■□□□□ 0.9
SRPRB-204ENST00000484684 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
SRPRB-204ENST00000484684 POTEFA5A3E0 1075 aa20.66■□□□□ 0.9
SRPRB-204ENST00000484684 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
SRPRB-204ENST00000484684 SREBF2Q12772 1141 aa20.66■□□□□ 0.9
SRPRB-204ENST00000484684 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
SRPRB-204ENST00000484684 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
SRPRB-204ENST00000484684 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
SRPRB-204ENST00000484684 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
SRPRB-204ENST00000484684 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
SRPRB-204ENST00000484684 ANXA1P04083 346 aa20.64■□□□□ 0.89
SRPRB-204ENST00000484684 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
SRPRB-204ENST00000484684 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
SRPRB-204ENST00000484684 LRP10Q7Z4F1 713 aa20.64■□□□□ 0.89
SRPRB-204ENST00000484684 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
SRPRB-204ENST00000484684 TRIM17Q9Y577 477 aa20.64■□□□□ 0.89
SRPRB-204ENST00000484684 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa20.63■□□□□ 0.89
SRPRB-204ENST00000484684 PPP2R1AP30153 589 aa20.63■□□□□ 0.89
SRPRB-204ENST00000484684 PDIA6Q15084 440 aa20.63■□□□□ 0.89
SRPRB-204ENST00000484684 PROSER3Q2NL68 480 aa20.63■□□□□ 0.89
SRPRB-204ENST00000484684 TBC1D16Q8TBP0 767 aa20.63■□□□□ 0.89
SRPRB-204ENST00000484684 ZNF428Q96B54 188 aa20.63■□□□□ 0.89
SRPRB-204ENST00000484684 TCIRG1Q13488 830 aa20.62■□□□□ 0.89
SRPRB-204ENST00000484684 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
SRPRB-204ENST00000484684 COPS6Q7L5N1 327 aa20.62■□□□□ 0.89
SRPRB-204ENST00000484684 AGBL3Q8NEM8 1001 aa20.62■□□□□ 0.89
SRPRB-204ENST00000484684 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa20.62■□□□□ 0.89
SRPRB-204ENST00000484684 MYOZ2Q9NPC6 264 aa20.62■□□□□ 0.89
SRPRB-204ENST00000484684 NF2P35240 595 aa20.61■□□□□ 0.89
SRPRB-204ENST00000484684 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa20.61■□□□□ 0.89
SRPRB-204ENST00000484684 CFHR5Q9BXR6 569 aa20.61■□□□□ 0.89
SRPRB-204ENST00000484684 SCN9AQ15858 1988 aa20.6■□□□□ 0.89
SRPRB-204ENST00000484684 USP17L8P0C7I0 530 aa20.6■□□□□ 0.89
SRPRB-204ENST00000484684 XAGE3Q8WTP9 111 aa20.6■□□□□ 0.89
SRPRB-204ENST00000484684 TSPYL4Q9UJ04 414 aa20.6■□□□□ 0.89
SRPRB-204ENST00000484684 DLG5Q8TDM6 1919 aa20.59■□□□□ 0.89
SRPRB-204ENST00000484684 UFL1O94874 794 aa20.59■□□□□ 0.89
SRPRB-204ENST00000484684 ALDH1A1P00352 501 aa20.58■□□□□ 0.89
SRPRB-204ENST00000484684 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
SRPRB-204ENST00000484684 OTOP1Q7RTM1 612 aa20.58■□□□□ 0.89
SRPRB-204ENST00000484684 NECTIN2Q92692 538 aa20.58■□□□□ 0.89
SRPRB-204ENST00000484684 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa20.58■□□□□ 0.89
SRPRB-204ENST00000484684 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
SRPRB-204ENST00000484684 ZNF609O15014 1411 aa20.58■□□□□ 0.88
SRPRB-204ENST00000484684 EN2P19622 333 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
SRPRB-204ENST00000484684 RPS8P62241 208 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
SRPRB-204ENST00000484684 FAM89AQ96GI7 184 aa20.56■□□□□ 0.88
SRPRB-204ENST00000484684 GGA1Q9UJY5 639 aa20.56■□□□□ 0.88
SRPRB-204ENST00000484684 HTTP42858 3142 aa20.55■□□□□ 0.88
SRPRB-204ENST00000484684 PRKG1Q13976 671 aa20.55■□□□□ 0.88
SRPRB-204ENST00000484684 ARMC9Q7Z3E5 817 aa20.55■□□□□ 0.88
SRPRB-204ENST00000484684 PODXL2Q9NZ53 605 aa20.55■□□□□ 0.88
SRPRB-204ENST00000484684 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
SRPRB-204ENST00000484684 NFE2L2Q16236 605 aa20.54■□□□□ 0.88
SRPRB-204ENST00000484684 NBPF9Q3BBW0 867 aa20.54■□□□□ 0.88
SRPRB-204ENST00000484684 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
SRPRB-204ENST00000484684 GMLQ99445 158 aa20.54■□□□□ 0.88
SRPRB-204ENST00000484684 COL4A1P02462 1669 aa20.54■□□□□ 0.88
SRPRB-204ENST00000484684 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
SRPRB-204ENST00000484684 SPRYD7Q5W111 196 aa20.53■□□□□ 0.88
SRPRB-204ENST00000484684 PTPN22Q9Y2R2 807 aa20.53■□□□□ 0.88
SRPRB-204ENST00000484684 USP17L3A6NCW0 530 aa20.52■□□□□ 0.88
SRPRB-204ENST00000484684 USP17L4A6NCW7 530 aa20.52■□□□□ 0.88
SRPRB-204ENST00000484684 USP17L1Q7RTZ2 530 aa20.52■□□□□ 0.88
SRPRB-204ENST00000484684 ERO1AQ96HE7 468 aa20.52■□□□□ 0.88
SRPRB-204ENST00000484684 TMEM106CQ9BVX2 250 aa20.52■□□□□ 0.88
SRPRB-204ENST00000484684 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
SRPRB-204ENST00000484684 CENPFP49454 3210 aa20.51■□□□□ 0.87
SRPRB-204ENST00000484684 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SRPRB-204ENST00000484684 IFNL1Q8IU54 200 aa20.51■□□□□ 0.87
SRPRB-204ENST00000484684 OGFOD1Q8N543 542 aa20.51■□□□□ 0.87
SRPRB-204ENST00000484684 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa20.5■□□□□ 0.87
SRPRB-204ENST00000484684 DLL1O00548 723 aa20.5■□□□□ 0.87
SRPRB-204ENST00000484684 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
SRPRB-204ENST00000484684 INHBEP58166 350 aa20.5■□□□□ 0.87
SRPRB-204ENST00000484684 CD99L2Q8TCZ2 262 aa20.5■□□□□ 0.87
SRPRB-204ENST00000484684 ARMC5Q96C12 935 aa20.5■□□□□ 0.87
SRPRB-204ENST00000484684 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SRPRB-204ENST00000484684 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa20.5■□□□□ 0.87
SRPRB-204ENST00000484684 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SRPRB-204ENST00000484684 PSME4Q14997 1843 aa20.49■□□□□ 0.87
SRPRB-204ENST00000484684 EFCC1Q9HA90 598 aa20.49■□□□□ 0.87
SRPRB-204ENST00000484684 BRCA2P51587 3418 aa20.48■□□□□ 0.87
SRPRB-204ENST00000484684 WNT10BO00744 389 aa20.48■□□□□ 0.87
SRPRB-204ENST00000484684 PODNQ7Z5L7 613 aa20.48■□□□□ 0.87
SRPRB-204ENST00000484684 PLBD2Q8NHP8 589 aa20.48■□□□□ 0.87
SRPRB-204ENST00000484684 FBXW7Q969H0 707 aa20.48■□□□□ 0.87
SRPRB-204ENST00000484684 PLEKHF1Q96S99 279 aa20.48■□□□□ 0.87
SRPRB-204ENST00000484684 ISCA1Q9BUE6 129 aa20.48■□□□□ 0.87
SRPRB-204ENST00000484684 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SRPRB-204ENST00000484684 SEC31BQ9NQW1 1179 aa20.48■□□□□ 0.87
SRPRB-204ENST00000484684 LDLRAD1Q5T700 205 aa20.47■□□□□ 0.87
SRPRB-204ENST00000484684 SLC10A4Q96EP9 437 aa20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11 ms